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1
tesis de grado
Publicado 2013
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La presente investigación se realizó del 5 de diciembre del 2011 al 20 de marzo del 2012 en el Laboratorio de Biología Molecular de la Facultad de Ingeniería Pesquera de la Universidad Nacional de Tumbes, y tuvo como objetivo implementar protocolos de PCR Y q-PCR para la detección de herpesvirus en Crassostrea gigas y Argopecten purpuratus. Se recolectaron ejemplares de C. gigas y A. purpuratus de 13 puntos de recolección en las regiones de Piura, Ancash, Lima e Ica. De cada ejemplar se extrajo 100 mg de masa visceral y se realizo la extracción de ADN mediante el protocolo de CTAB. La calidad del ADN extraído fue previamente comprobada mediante la amplificación por PCR del gen de referencia actina con los primers Bi-actin-Fw y Bi-actin-Rev. Los protocolos de PCR se realizaron con los primers C2, C4 y C6 como estándares y los nuevos primer OsHV1Fw1, OsHV1Rev1, OsHV1Rev2 y OsHV1R...
2
tesis de grado
Publicado 2014
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Se estandarizó la técnica TR-PCR en tiempo real y convencional. Se utilizó patrones positivos (n=150) y negativos (n=150) al VR mediante IFD. La extracción de ARN, síntesis de ADNc, PCR convencional y tiempo real se realizaron utilizando kits comerciales. Se utilizaron tres cebadores para amplificar una región codificante del gen E1 del VR frente a patrones positivos, vacuna combina (Wistar RA 27/3-Edmoston Zagreb) como controles positivos, y patrones positivos de sarampión, VHS1, VHS2, PVB19 y Mycoplasma, como controles negativos. Los resultados se determinaron mediante el análisis de bandas en gel de agarosa y curvas de amplificación. La PCR convencional detectó 4,47 x 10-2 ng/μl de ARN con un 98 % sensibilidad, 100 % especificidad, 100 % VPP y 98 % VPN y la PCR en tiempo real detectó 4,36 x 10-5 ng/μl de ARN, con un 98,6 % sensibilidad, 100 % especificidad, 100 % VPP y 98...
3
artículo
Publicado 2015
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El objetivo del presente estudio fue determinar la expresión de péptidos antimicrobianos (á- y â-defensinas) en el epitelio intestinal de crías de alpaca de 1 a 6 semanas de edad y con enteropatías, mediante la cuantificación relativa de ARN mensajeros (ARNm) de las á (defa 8) y â (â def alp) defensinas. Se tomaron dos porciones de yeyuno de 2 cm de longitud de 29 crías de alpacas con signos de diarrea. Una porción se procesó para el análisis histopatológico utilizando la tinción Hematoxilina-Eosina para determinar el tipo de enteropatía. De la otra porción se obtuvo el ARNm total de los raspados yeyunales, que sirvió de molde para la síntesis de cDNA mediante transcripción reversa (RT), seguido de un PCR en Tiempo Real, para la amplificación y detección de las defensinas. La cuantificación relativa de ARNm se realizó mediante el método 2- ÄÄCt. Las crías enf...
4
tesis de grado
Publicado 2012
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La presente investigación se realizó del 5 de diciembre del 2011 al 20 de marzo del 2012 en el Laboratorio de Biología Molecular de la Facultad de Ingeniería Pesquera de la Universidad Nacional de Tumbes. Se pretendió determinar si los primers diseñados para PCR: CXcFw1 (CGGAAGGCAGCAGTAGGG) /CXcRev3 (CCGGGACTTTTTCTGTGGG) y nested-PCR: CxcFw1 (CGGAAGGCAGCAGTAGGG)/CXcRev4 (TATCTAAT CCTGTTTGCTCCCC) y CXcFw1/CXcRev2 (CGGAAGGCAGCAGTAGGG/ ACTTACTAAACCACCTACACACCC) permitirían detectar un fragmento del gen 16S ARNr en rickettsias en Crassostrea gigas. Para ello se realizó la extracción de ADN de muestras de branquias y masa visceral de C. gigas siguiendo el protocolo CTAB y para verificar la extracción adecuada se realizó una amplificación del gen de referencia de actina mediante PCR utilizando los primers Bi-actin-Fw y Bi-actin-Rev. Los resultados indican que la extracción de ADN ...
5
artículo
Publicado 2009
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El objetivo es determinar el nivel de correlación de la cuantificación de carga viral para VIH-1 mediante las técnicas Amplicor HIV-1 Monitor Versión Estándar y Sistema COBAS Ampliprep/COBAS Taqman 48 HIV-1; los materiales y métodos due que se realizó un estudio correlacional, se incluyó 152 muestras de plasma, de personas viviendo con VIH/SIDA que se encuentran en el Sistema de Monitoreo de TARGA del INS. Las muestras incluidas tenían carga viral en rango de 400 a 750,000 copias/mL, y se almacenaron a -20 ºC hasta 15 días antes de su procesamiento. Las muestras fueron procesadas por el método Amplicor HIV-1 que usa la técnica de RT-PCR, y con el método COBASAmpliprep/TaqMan HIV-1, tecnología automatizada que utiliza el PCR en tiempo real.
6
artículo
Publicado 2018
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Se describen dos casos de caninos infectados con Hepatozoon canis en la ciudad de Cúcuta, Colombia. La primera paciente de 18 meses de edad llegó a consulta con vómitos, anorexia y pérdida progresiva de peso. En el segundo caso se pretendía realizar ovariohisterectomía preventiva, pero en los exámenes clínicos prequirúrgicos presentó anemia. Para los dos casos, el diagnóstico fue mediante extendido sanguíneo, observado a 100X. Para el segundo caso, el diagnóstico se confirmó con la prueba de PCR. El tratamiento instaurado fue sintomático, usando fármacos como oxitetraciclina y doxiciclina. Este es el primer reporte de hepatozoonosis en la ciudad de Cúcuta.
7
tesis de maestría
Publicado 2017
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Fasciolasis es la infección por trematodos más ampliamente distribuida en el mundo. En el Perú la Fasciolasis humana es considerada una enfermedad parasitaria reemergente e hiperendémica. El diagnóstico de Fasciolasis humana sigue siendo un problema debido a la poca sensibilidad de los métodos parasitológicos empleados así como a las precarias condiciones de salud en zonas rurales donde la Fasciolasis manifiesta su verdadero impacto. En el presente trabajo de investigación se desarrollaron y validaron dos pruebas de diagnóstico altamente sensibles y específicas para la detección de Fasciolasis humana: la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real q(PCR) y un método de amplificación por Polimerasas y Recombinasas (RPA). El q(PCR) así como el RPA mostraron un límite de detección (LOD) de 1.6 pg/µl de ADN de Fasciola hepatica, ambas pruebas no mostraron reacciones...
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otro
Publicado 2019
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The diseases produced by avian adenovirus Type 4 (FAdV-4) are transmitted vertically and horizontally causing great economic losses in the poultry sector, that is why there is the need to carry out a process of standardisation of a Polymerase chain in reaction (PCR) to detect and quantify our virus of interest. To this end, in the present investigation, it was carried out in three (03) phases: The first consisted in the preparation of the internal reference material where the DNA was extracted, from a culture of EB66 cells, measuring its quantity of the Amplicon through the Fluorometer Qubit 2.0. The second phase was to standardize conventional PCR, in this phase we proceeded to the selection of the specific primers (Primer´s), these were HHS *-2, HHS *-3 and HHS *-4; The test of its temperature gradient was carried out based on the Q5 PCR Kit® High-Fidelity 2X Master, followed by the ...
9
artículo
Publicado 2007
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The tumor necrosis factor (TNF) is an important mediator of the inflammatory reactions; it seems to play a central roll in the pathogenesis of several chronic inflammatory diseases including the periodontitis. It has been demonstrated that different rates exist from TNF alpha in vitro and in vivo between the individuals, so it can be associated with the presence of certain genetic polymorphism. The purpose of this investigation is to study the degree of polymorphism of the gene TNF-alpha (-308G/A) in samples of adult Peruvian patients and analyze the relationship with periodontal processes. For the study 81 blood samples with anticoagulant EDTA of people between 25 and 52 years were collected (47,5 average ± 7,4). 11 of them were people who had severe periodontal processes (average 35,2 ± 2,3). There was a greater frequency of genotype GG (G alele for the gene TNF-alpha-308) of the 82,...
10
tesis de maestría
Publicado 2016
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Uno de los productos bandera del Perú que ha alcanzado notoriedad y proyección internacional es el pisco, derivado de las “uvas pisqueras” sembradas en los valles de Ica, Lima, Moquegua, Arequipa y Tacna. Su productividad se ve reducida a causa de enfermedades de origen viral, cuyo control se basa exclusivamente en la prevención. A pesar de la gran importancia económica, no se ha realizado hasta la fecha una evaluación fitosanitaria viral rigurosa de este cultivo. Por tal motivo, el objetivo principal de esta tesis se centró en implementar herramientas moleculares altamente sensibles que sirvan para la identificación de los virus de mayor incidencia y prevalencia en nuestras uvas pisqueras. Así, el trabajo se dividió en dos fases: en un principio se determinó la prevalencia, incidencia y distribución de 7 virus de importancia mundial en las regiones de Ica, Arequipa y Tacn...
11
tesis de maestría
Publicado 2016
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Uno de los productos bandera del Perú que ha alcanzado notoriedad y proyección internacional es el pisco, derivado de las “uvas pisqueras” sembradas en los valles de Ica, Lima, Moquegua, Arequipa y Tacna. Su productividad se ve reducida a causa de enfermedades de origen viral, cuyo control se basa exclusivamente en la prevención. A pesar de la gran importancia económica, no se ha realizado hasta la fecha una evaluación fitosanitaria viral rigurosa de este cultivo. Por tal motivo, el objetivo principal de esta tesis se centró en implementar herramientas moleculares altamente sensibles que sirvan para la identificación de los virus de mayor incidencia y prevalencia en nuestras uvas pisqueras. Así, el trabajo se dividió en dos fases: en un principio se determinó la prevalencia, incidencia y distribución de 7 virus de importancia mundial en las regiones de Ica, Arequipa y Tacn...
12
tesis de grado
Publicado 2025
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Determinar la efectividad de la inspección visual con ácido acético (IVAA) en comparación con la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en la detección del Virus del Papiloma Humano (VPH) en el Hospital Vista Alegre durante los años 2023-2024. Materiales y métodos: Estudio comparativo, cuantitativo, no experimental y retrospectivo. Se analizó una muestra de 293 pacientes seleccionadas aleatoriamente entre 519 historias clínicas. Se evaluaron las tasas de sensibilidad, especificidad y concordancia (índice Kappa) entre IVAA y PCR. La recolección de datos se realizó a partir de las historias clínicas, y los resultados fueron procesados utilizando software estadístico. Resultados: La sensibilidad del IVAA fue de 22.9% y su especificidad de 98.4%, mientras que la PCR presentó una mayor sensibilidad para identificar infecciones subclínicas de VPH. El índice Kappa de concor...
13
artículo
Publicado 2021
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It is important to have a PCR technique capable of detecting avian adenovirus 4 with high sensitivity and precision in cell cultures and samples of avian origin. In the present work, a PCR technique was standardized. First, the Internal Reference Material (IRM) was prepared, using cell culture in EB66 cells, infected with FAdV-4; then the virus was purified, the DNA was extracted and the amplicon was quantified. Finally, the temperature gradient test, primer concentration test, sensitivity test and specificity test were carried out using the Q5® High-Fidelity 2X Master PCR kit. Of the five primers used, the HHS*-3 and HHS*-4 primers passed all the tests, with HHS*-3 being the most sensitive as it detected up to 1 pg/µl.
14
artículo
Publicado 2021
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It is important to have a PCR technique capable of detecting avian adenovirus 4 with high sensitivity and precision in cell cultures and samples of avian origin. In the present work, a PCR technique was standardized. First, the Internal Reference Material (IRM) was prepared, using cell culture in EB66 cells, infected with FAdV-4; then the virus was purified, the DNA was extracted and the amplicon was quantified. Finally, the temperature gradient test, primer concentration test, sensitivity test and specificity test were carried out using the Q5® High-Fidelity 2X Master PCR kit. Of the five primers used, the HHS*-3 and HHS*-4 primers passed all the tests, with HHS*-3 being the most sensitive as it detected up to 1 pg/µl.
15
tesis de maestría
Publicado 2019
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El género Bartonella comprende bacterias capaces de infectar glóbulos rojos y células endoteliales, y que causan al menos tres enfermedades humanas: la “enfermedad de Carrión”, por Bartonella bacilliformis, la “fiebre de las trincheras”, por Bartonella quintana, y la “enfermedad del arañazo del gato”, por Bartonella henselae. Las especies patógenas reconocidas de Bartonella han ido en aumento durante los últimos veinte años. En el Perú la infección más frecuente es la Enfermedad de Carrión, causada por Bartonella bacilliformis; sin embargo, hay reportes de otras bartonelosis en zonas endémicas, por lo que se requiere de un diagnóstico diferencial rápido y confirmativo. El objetivo de este estudio fue desarrollar una prueba basada en la Reacción en Cadena de la Polimerasa con varios marcadores (PCR múltiple), para la detección e identificación de Bartonella ...
16
tesis de grado
Publicado 1997
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Para facilitar la identificación rápida y especifica de Campylobacter jejuni se desarrolló un Test de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) a partir de muestras de heces de niños, con problemas gastrointestinales, menores de 24 meses de edad. Los cebadores (primers) elegidos, CAMPYJ y CAMPYJ2, para la realización del PCR se diseñaron sobre la base de una secuencia específica del gen MapA, este gen codifica a la proteína A (24KD), que es parte estructural de la membrana celular, presente en todas las cepas de Campylobacter jejuni. Para la extracción de ADN directamente de heces se evaluaron 04 protocolos diferentes, mostrando el Método de Franket y col. un ADN genómico más puro y conservado. Para la estandarización del PCR se utilizaron cepas de Campylobacter jejuni, cuyo límite de detección con el par de cebadores fue 15 bacterias, equivalente a 100 fentogramos de ADN...
17
artículo
Publicado 2005
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Se evaluaron los parámetros productivos de un lote de gallinas de postura comercial vacunado con la cepa ts11 de Mycoplasma gallisepticum (MG). Se criaron 9,065 pollitas de postura comercial de la línea Hy Line Brown libres de micoplasma en una granja previamente identificada como positiva a MG. La mitad de las aves se vacunó con la cepa ts11 de MG a las cuatro semanas de edad y la otra mitad permaneció sin vacuna. Se midió la producción de huevos y se realizaron las pruebas de aglutinación en placa, inhibición de la hemoaglutinación y ELISA para evaluar el comportamiento serológico de los lotes como respuesta a la vacuna o a los desafíos de campo. Así mismo, se utilizó PCR y cultivos microbiológicos para determinar desafíos de campo por micoplasmas y salmonella. Sobre un periodo productivo de 41 semanas, las aves vacunadas produjeron 188 huevos/ave (11.55 kg) y tuvieron u...
18
tesis de grado
Publicado 2021
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La presente investigación tuvo como problema general: ¿Cómo influye el PET- PCR como aditivo en las propiedades del concreto para losas aligeradas?, el objetivo general fue: Evaluar la influencia del PET- PCR como aditivo en las propiedades del concreto para losas aligeradas y la hipótesis general que se verificó fue: El PET- PCR como aditivo mejora las propiedades del concreto para losas aligeradas. El método general de investigación fue el científico, el tipo de investigación fue aplicada de nivel descriptivo explicativo y de diseño experimental. La población estuvo constituido por 208 especímenes elaborados de concreto con adiciones de PET PCR , no se utilizó la técnica de muestreo, si no el censo por que se trabajó con el total de la población. Como la conclusión principal de este estudio fue utilizando el PET PCR como aditivo se mejora sustancialmente las propiedade...
19
tesis de grado
Publicado 2017
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Caracterizar molecularmente mediante los marcadores ERIC-PCR y REP-PCR cepas de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) aisladas de pacientes con infección urinaria en los servicios del Hospital Regional Lambayeque. Junio-Diciembre 2015. Se analizaron 30 aislados clínicos conformados por E. coli y K. pneumoniae productores de BLEE, obtenidos durante los meses de junio a diciembre del 2015. Se determinó la producción de BLEE mediante el método de Jarlier, así como la susceptibilidad antimicrobiana para observar el fenotipo de resistencia. Además se evaluó la caracterización molecular por los marcadores ERIC-PCR y REP-PCR, registrando los geles con el software Quantity One-BIORAD. Para el agrupamiento de las cepas se usó el algoritmo UPGMA, generando los dendrogramas respectivos con la unión de los perfiles electroforé...
20
tesis de grado
Publicado 2019
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La enfermedad infecciosa de la bursa (o enfermedad de Gumboro) afecta a nuestro país causando grandes pérdidas económicas en los planteles avícolas (1). La detección, control y prevención de esta enfermedad es complicada debido a la capacidad infectiva, resistencia y alta variabilidad del virus. Las pruebas existentes para la detección y clasificación del virus han sido útiles para el estudio de la evolución de la enfermedad, no obstante, presentan dificultades con el manejo de los virus de campo en las granjas avícolas. Por dichas razones, en este estudio se evaluó a la técnica de la RT-PCR con primers específicos-degenerados para incrementar la sensibilidad de la PCR como prueba de diagnóstico y la PCR como técnica de secuenciación para IBDV. Las muestras evaluadas fueron una vacuna y bursas infectadas con IBDV. Se evaluaron distintos aspectos en el diseño de la RT-P ...
