Tópicos Sugeridos dentro de su búsqueda.
Tópicos Sugeridos dentro de su búsqueda.
Buscar alternativas:
application program » application programs (Expander búsqueda), aplicacion programa (Expander búsqueda), application programming (Expander búsqueda)
dna application » dual application (Expander búsqueda), dna replication (Expander búsqueda), data applications (Expander búsqueda)
application program » application programs (Expander búsqueda), aplicacion programa (Expander búsqueda), application programming (Expander búsqueda)
dna application » dual application (Expander búsqueda), dna replication (Expander búsqueda), data applications (Expander búsqueda)
1
artículo
Publicado 2024
Enlace
Enlace
The mitochondrial genome of Pumpo (Bos taurus), a prominent breed contributing to livestock farming, was sequenced using the Illumina HiSeq 2500 platform. Assembly and annotation of the mitochondrial genome were achieved through a multifaceted approach employing bioinformatics tools such as Trim Galore, SPAdes, and Geseq, followed by meticulous manual inspection. Additionally, analyses covering tRNA secondary structure and codon usage bias were conducted for comprehensive characterization. The 16,341 base pair mitochondrial genome comprises 13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, and 2 rRNA genes. Phylogenetic analysis places Pumpo within a clade predominantly composed of European cattle, reflecting its prevalence in Europe. This comprehensive study underscores the importance of mitochondrial genome analysis in understanding cattle evolution and highlights the potential of genetic improv...
2
artículo
Publicado 2024
Enlace
Enlace
The mitochondrial genome of Pumpo (Bos taurus), a prominent breed contributing to livestock farming, was sequenced using the Illumina HiSeq 2500 platform. Assembly and annotation of the mitochondrial genome were achieved through a multifaceted approach employing bioinformatics tools such as Trim Galore, SPAdes, and Geseq, followed by meticulous manual inspection. Additionally, analyses covering tRNA secondary structure and codon usage bias were conducted for comprehensive characterization. The 16,341 base pair mitochondrial genome comprises 13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, and 2 rRNA genes. Phylogenetic analysis places Pumpo within a clade predominantly composed of European cattle, reflecting its prevalence in Europe. This comprehensive study underscores the importance of mitochondrial genome analysis in understanding cattle evolution and highlights the potential of genetic improv...
3
objeto de conferencia
Publicado 2019
Enlace
Enlace
Introduction: Enteroagregative Escherichia coli (EAEC) is a group of enteric pathogens that cause acute and persistent diarrhea among children, in patients infected with human immunodeficiency virus, which causes traveler's diarrhea and are associated with important outbreaks that have caused death. AIM: The aims of this study were to quantify and compare the bacterial load of stool samples from children under 2 years of age with and without diarrhea in a periurban community in Lima, Peru. Materials and methods: We randomly selected 165 stool samples (80 from diarrhea and 85 from asymptomatic patients) that previously were identified as EAEC for the presence of aggR plasmidic gene by Real Time-PCR for Diagnostic of Diarrheagenic E. coli (DEC) from bacteria isolated of stool culture, placebocontrolled trial conducted in children living in the district of Independencia, Lima, Peru. This st...
4
tesis de grado
Publicado 2020
Enlace
Enlace
Este estudio tuvo como objetivo caracterizar morfológica y genéticamente las seis especies taxonómicas más un morfotipo del género Plukenetia reportadas para la Amazonía peruana: P. volubilis, P. brachybotrya, P. loretensis, P. polyadenia, P. huayllabambana, P. carolis-vegae y Plukenetia sp. morfotipo Cusco. Para lo cual se colectaron muestras biológicas de entre cuatro a seis individuos por especie y morfotipo en las localidades de procedencia de las diferentes especies en la Amazonía peruana (regiones Amazonas, Cusco, Loreto y San Martín). Para la caracterización molecular fue realizado el secuenciamiento nucleotidico de dos regiones del genoma de estas especies (región nuclear ribosomal ITS y la región cloroplásica trnH-psbA). El análisis de divergencia genética y los árboles filogeneticos permitieron corroborar la identidad taxonómica de cinco de las seis especies ta...
5
tesis de maestría
Publicado 2019
Enlace
Enlace
Bartonella spp. es una bacteria gramnegativa emergente de distribución mundial. Los gatos son los principales reservorios de Bartonella henselae y los perros son huéspedes oportunistas. Aunque las garrapatas también pueden desempeñar un papel en la transmisión, su competencia como vectores de Bartonella spp. no se conoce del todo. Teniendo en cuenta que sólo unos pocos estudios se han centrado en la detección de Bartonella en animales, humanos y ectoparásitos en Portugal, este estudio pretende abordar la presencia molecular de Bartonella sp. en 123 gatos callejeros, 25 perros callejeros, 30 humanos de Lisboa y 236 garrapatas buscadoras dentro del país. Utilizando una qPCR dirigida al gen nuoG, fue posible detectar ADN de Bartonella sp. en el 20,32% de las muestras de gatos (25/123). De estas muestras positivas, 13 secuencias se caracterizaron como B. henselae, 11 como B. clarrid...
6
tesis de grado
Publicado 2008
Enlace
Enlace
Echinococcus granulosus es el agente causal de la hidatidosis unilocular, patología de carácter endémico en amplias zonas de Perú. Actualmente la metodología del análisis molecular del ADN se ha utilizado para enriquecer los conocimientos sobre este parásito, a través del aislamiento de sus genes, el estudio de su estructura y organización, así como la expresión de los mismos. La aplicación de estas técnicas ha reconocido en E. granulosus un mínimo de 10 variedades o cepas.. La taxonomia y el estatus filogenético de las cepas de E. granulosus es controversial y esta bajo discusión; su variación genética ha sido analizada por la variación de las secuencias de los nucleótidos dentro de las regiones mitocondriales y nucleares del DNA. Estas variantes son referidas como cepas y han sido generalmente asignadas con el nombre del hospedero intermediario involucrado en el cic...
7
artículo
Publicado 2020
Enlace
Enlace
Plant breeders and geneticists use molecular marker-assisted selection also called as MAS as a useful approach for breeding of plant to make selection more efficient and speed up the breeding cycle. MAS can be more efficient, effective, and reliable than phenotypic selection. Molecular markers are useful to identify the economically important traits in the breeding population for further manipulation in a short time. Due to the applicability of markers at the seedling stage ensuring high precision at the reduced level of cost, marker-assisted selection offer the chances to improve responses from selection. The MAS using DNA level polymorphism accelerate the pace of selection. The main marker technologies applied are chiefly co-dominant markers i.e. microsatellite markers/SSR (Simple Sequence Repeats) marker, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) marker and SNPs ...
8
artículo
Publicado 2022
Enlace
Enlace
The Peruvian creole cattle (PCC) is a neglected breed and an essential livestock resource in the Andean region of Peru. To develop a modern breeding program and conservation strategies for the PCC, a better understanding of the genetics of this breed is needed. We sequenced the whole genome of the PCC using a de novo assembly approach with a paired-end 150 strategy on the Illumina HiSeq 2500 platform, obtaining 320 GB of sequencing data. A reference scaffolding was used to improve the draft genome. The obtained genome size of the PCC was 2.81 Gb with a contig N50 of 108 Mb and 92.59% complete BUSCOs. This genome size is similar to the genome references of Bos taurus and B. indicus. In addition, we identified 40.22% of repetitive DNA of the genome assembly, of which retroelements occupy 32.39% of the total genome. A total of 19,803 protein-coding genes were annotated in the PCC genome. Fo...
9
documento de trabajo
Publicado 2022
Enlace
Enlace
The Peruvian creole cattle (PCC) is a neglected breed, and is an essential livestock resource in the Andean region of Peru. To develop a modern breeding program and conservation strategies for the PCC, a better understanding of the genetics of this breed is needed. We sequenced the whole genome of the PCC using a paired-end 150 strategy on the Illumina HiSeq 2500 platform, obtaining 320 GB of sequencing data. The obtained genome size of the PCC was 2.77 Gb with a contig N50 of 108Mb and 92.59% complete BUSCOs. Also, we identified 40.22% of repetitive DNA of the genome assembly, of which retroelements occupy 32.39% of the total genome. A total of 19,803 protein-coding genes were annotated in the PCC genome. We downloaded proteomes and genomes of the Bovinae subfamily, and conducted a comparative analysis with our draft genome. Phylogenomic analysis showed that PCC is related to Bos indicu...
10
tesis de maestría
Publicado 2021
Enlace
Enlace
Históricamente la problemática de los accidentes mortales en la minería ha tenido impactos negativos para las empresas, familias y la sociedad. Con el avance del tiempo las empresas han implementado sistemas de gestión en seguridad y salud y el cumplimiento de la legislación han contribuido en la reducción de la tasa de accidentes; Sin embargo, esto no ha sido suficiente. En el caso particular de investigación se analizará una empresa minera transnacional y su sede en Perú en su desempeño de seguridad. Por lo que se planteó la siguiente interrogante: ¿De qué manera el fortalecimiento del aspecto cultural en la gestión de Seguridad y Salud, disminuye los indicadores de accidentabilidad en una Compañía Minera Transnacional con sede en Perú? ¿De qué manera influye la aplicación del aspecto técnico en la gestión de la Seguridad disminuye los indicadores de accidentabili...
11
tesis de grado
Publicado 2024
Enlace
Enlace
Mundialmente existe una preocupación por la pérdida de la diversidad del ganado vacuno, y el Perú no es ajeno a este problema, considerando que no existen programas de conservación del ganado vacuno y son pocos los estudios de caracterización genética. A su vez, conocer las variantes genotípicas de una población es crucial porque permite conocer sus características para tomar medidas de manejo que garanticen la seguridad alimentaria y la conservación. En este contexto, el presente estudio tuvo como objetivo caracterizar genotípicamente las proteínas lácteas αS1-caseína y αS2-caseína en vacunos Brown Swiss, Holstein, criollos de Apurímac y Amazonas. Los genotipos de las proteínas αs1-caseína (CSN1S1*BB, CSN1S1*BC y CSN1S1*CC) y αs2-caseína (CSN1S2*AA, CSN1S2*AB y CSN1S2*BB) fueron determinados en 361 muestras de ADN de vacunos del Banco de ADN de la Dirección de Re...
12
tesis doctoral
Publicado 2022
Enlace
Enlace
Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencia Animal
13
artículo
Publicado 2023
Enlace
Enlace
The alpaca population mostly consists of the Huacaya phenotype and is widely distributed in Southern Peru. This study aimed to estimate the genetic diversity and population structure of two Huacaya alpaca populations (Ajoyani and Quimsachata) using fourteen and twelve microsatellite markers for each population, respectively. A total of 168 alpaca biological samples were outsourced to Peruvian laboratories for DNA extraction and genotyping. For genetic diversity, observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), polymorphism information content (PIC), and fixation indices values were estimated. An admixture analysis was performed for the population structure analysis. Different programs were used for these estimations. In total, 133 (Ajoyani) and 129 (Quimsachata) alleles were found, with a range of 4 to 17 by locus. The mean HO, HE, and PIC per marker for Ajoyani were 0.764 ± ...
14
artículo
Publicado 2024
Enlace
Enlace
The Arnaucho chili pepper (ACP) is a traditional vegetable used in Peru because of its gastronomic properties. Due to its importance in the Peruvian diet and economy, this species is a resource that can be a candidate to plant breeding programs. In this study, the complete genome nucleotide sequence of this chili pepper was generated using the Illumina Hiseq 2500 sequencing technology. We sequenced the whole genome of the ACP using a paired-end 150 strategy, obtaining 330.46 GB of sequencing data. The genome size of the ACP was 2.98 Gb with a contig N50 of 237 Mb and 95.39% complete BUSCOs. Also, we identified 71.96% of repetitive DNA of the genome assembly, of which retroelements occupy 37.95% of the total genome. We downloaded genomes of the Solanoideae subfamily and conducted a comparative analysis of simple sequence repeats (SSRs) with our draft genome, and we identified lower number...
15
artículo
Publicado 2018
Enlace
Enlace
Camu camu is a typical Amazon native fruit shrub that possesses a diploid genome, moderate genetic diversity, and population structure. The fruits accumulate several essential nutrients and synthesize L-ascorbic acid (vitamin C) in great quantities and an array of diverse secondary metabolites with corroborated in vitro and in vivo health-promoting activities. These beneficial effects include antioxidative and antiinflammatory activities, antiobesity, hypolipidemic, antihypertensive and antidiabetic effects, DNA damage and cancer protection effects, and other bioactivities. Many health-promoting phytochemicals are biosynthesized in several metabolic pathways of camu camu. Their reconstruction from the fruit transcriptome database was accomplished by our research group. These include basic metabolic pathways such as glycolysis and pentose phosphate pathway, vitamin C biosynthesis pathways...
16
tesis de grado
Publicado 2019
Enlace
Enlace
La identificación de especies de Hongos Micorrízicos Arbusculares (HMA), presentes en áreas donde se cultiva el café (Coffea arabica L.) en nuestra Región son de gran importancia, pues constituye la base para la investigación de especies que pueden ser aprovechadas en el futuro como bioprotectores y biofertilizantes en este cultivo y así contribuir al mejoramiento sostenible de la producción. En este sentido, se identificó 31 especies de HMA, en suelos de doce localidades (fuentes de inóculo) de plantaciones de café, de la cuales se reportó una especie nueva (Funneliglomus sanmartinense), estando presente especialmente en Alto Palmiche (Lamas). De las localidades muestreadas, Pueblo Nuevo (Lamas) y Nuevo Lamas (San Martín) fueron las fuentes de inóculo que tuvieron mayor densidad de esporas y riqueza de especies, siendo de las dos, Nuevo Lamas la localidad que proporcionó ...
