El objetivo del presente trabajo fue identificar polimorfismos de nucleótido simple (PNSs) en genes de proteínas asociadas a las queratinas (KRTAPs) en alpacas (Vicugna pacos). Se realizó el estudio en un total de 34 KRTAPs que se encuentran anotados en el genoma de referencia VicPac3.1 en la base de datos del National Center for Biotechnology Information (NCBI). El genoma de referencia VicPac3.1 de alpaca, nueve genomas (NCBI) y reads de 300 bibliotecas de representación reducida de ADN de alpacas se usaron para comparar secuencias de KRTAPs e identificar PNSs mediante el uso del BLASTN.  Se halló la frecuencia del alelo menor (MAF) y la tasa de genotipificacion (TG) de PNSs, mediante el uso de los programas KGD y PLINK. Así como, el Illumina Score para cada PNS, mediante el uso del programa Illumina Design Studio. Se seleccionaron marcadores con MAF ≥ 0.05, TG ≥ 45% por ...

The Peruvian creole cattle (PCC) is a neglected breed and an essential livestock resource in the Andean region of Peru. To develop a modern breeding program and conservation strategies for the PCC, a better understanding of the genetics of this breed is needed. We sequenced the whole genome of the PCC using a de novo assembly approach with a paired-end 150 strategy on the Illumina HiSeq 2500 platform, obtaining 320 GB of sequencing data. A reference scaffolding was used to improve the draft genome. The obtained genome size of the PCC was 2.81 Gb with a contig N50 of 108 Mb and 92.59% complete BUSCOs. This genome size is similar to the genome references of Bos taurus and B. indicus. In addition, we identified 40.22% of repetitive DNA of the genome assembly, of which retroelements occupy 32.39% of the total genome. A total of 19,803 protein-coding genes were annotated in the PCC genome. Fo...