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RT-PCR tiempo real 6 relative quantification 6 PCR 5 RT-PCR 5 Porcino 4 RT-PCR en tiempo real 4 cuantificación relativa 4 más ...
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tesis doctoral
Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencias e Ingeniería Biológicas
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tesis de grado
Esta Tesis fue posible gracias al Financiamiento del Consejo Nacional de Ciencia Tecnología e Innovación Tecnológica (CONCYTEC). Esta institución apostó en mi y otros compañeros de la maestría dándonos la oportunidad de una Beca que me permitió desarrollar y concluir mis estudios y publicar la Tesis para la obtención del Grado de Magister Scientiae. Asimismo, quisiera expresar un especial agradecimiento a la Srta. Erika Saavedra, del FONDECYT, quien con su paciencia y predisposición pude lograr terminar esta Tesis.
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tesis de maestría
Determina el impacto de los factores tafonómicos (ácido, alcalino, húmedo/fúngico) en el ADN extraído de muestras óseas antiguas, para comparar tres métodos de extracción y evaluar la eficacia y rendimiento de esta molécula en la investigación. Las metodologías de extracción de la molécula de ADN, a partir de muestras óseas, se rigen con el empleo de técnicas complejas, que con frecuencia tienen que lidiar a diario con serios problemas como el que la muestra se encuentre degradada, la ausencia o escasa cantidad de ADN; así como la presencia de inhibidores que pueden ser extraídos conjuntamente con el ADN. La investigación se realizó para comparar la eficacia de tres procedimientos de extracción de ADN, que a su vez resulten amplificables mediante la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR por sus siglas en inglés) a partir de restos óseos antiguos. De ...
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tesis de grado
Los programas de mejoramiento genético requieren de herramientas versátiles y de bajo costo que permitan lograr en menor tiempo nuevas variedades. En el caso del cacao, se disponen de una serie de técnicas moleculares que facilitan el trabajo al fitomejorador. Sin embargo, la utilidad y conveniencia de tales, serán elegibles dependiendo de las condiciones y objetivos del trabajo. Por este motivo, se trazaron los objetivos de ensayar los marcadores ISSR, determinar su poder discriminante y determinar parámetros de diversidad genética en una colección de cacao de Tingo María. Ésta consistió en 50 individuos o accesiones, de diversas procedencias genéticas y geográficas. El ISSR es una técnica basada en PCR que amplifica el fragmento entre dos secuencias de microsatélites, utilizando un iniciador complementario a éstos. Las muestras fueron colectadas en la provincia de Leonci...
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tesis de grado
Esta investigación se enfocó en realizar el análisis fisicoquímico de las aguas del río Ronquillo usadas para consumo humano en la ciudad de Cajamarca en el año 2020, tomándose muestras en dos puntos diferentes durante enero, febrero, agosto, setiembre y octubre. Se analizó el pH, la conductividad eléctrica, turbiedad y metales; comparando los resultados obtenidos con los Estándares de Calidad Ambiental (ECA) para aguas subcategoría A1, A2 y A3, aprobados con el DS N° 004-2017-MINAM. La investigación fue cualitativa-descriptiva. Se rechazó la hipótesis referida a los resultados del análisis fisicoquímico del agua, ya que los valores de estos parámetros cumplen con los ECA para aguas subcategoría A1, a excepción del pH, ya que obtuvimos un valor máximo de 8,86 excediendo en 0,4 unidades de pH a lo establecido en la norma vigente, por lo cual se acepta la hipótesis pl...
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informe técnico
Debido a los múltiples efectos beneficiosos de la vitamina C (ácido L-ascórbico, AA) para el buen funcionamiento y conservación de nuestra salud, el AA tiene una gran demanda en la industria. Por ese motivo desde inicios de los años 1930 se han desarrollado sistemas químicos de producción industrial. Aunque se han incorporado algunas innovaciones mediante biotransformaciones microbianas, aún tienen serias limitaciones porque son ineficientes, tienen una gran demanda energética, son costosos y causan polución ambiental. Por tanto, es urgente desarrollar sistemas de producción biotecnológica. El reciente descubrimiento de vías metabólicas para la síntesis de AA en plantas nos ofrece una buena oportunidad, en particular de Myrciaria dubia, una especie amazónica caracterizada por sintetizar y almacenar altas concentraciones de AA. Recientemente hemos analizado su transcriptom...
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tesis de grado
El presente trabajo de investigación lleva por título, Propuesta Arquitectónica para Mejorar la Calidad de Vida del adulto Mayor en la Ciudad de Juliaca, ubicada en la zona urbana de la ciudad, emplazada en la región natural de la sierra peruana. El problema se fundamenta en la transición demográfica del incremento del envejecimiento de la población y que ellos se encuentran en desventaja en los aspectos físicos, psíquicos, económicos, desvinculación familiar, entre otros, además de la actual residencia de adultos mayores, es una casona muy antigua, que cumplió su ciclo de vida proyectada. La pregunta es. ¿Cómo hacer la propuesta arquitectónica que contribuya a mejorar la calidad de vida del adulto mayor en la ciudad de Juliaca El objetivo es, ¿Desarrollar un proyecto arquitectónico que permita acoger un envejecimiento saludable, que retrase los procesos de deterioro, c...
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tesis de maestría
El gen Lvp53 del langostino Litopenaeus vannamei (Lvp53) ha sido caracterizado a nivel del ADN complementario (ADNc), encontrando motivos homólogos a p53 de humanos y relación con la respuesta a diferentes tipos de estrés. Sin embargo, aún se desconoce la estructura de este gen, así como su funcionalidad. En este estudio se propuso caracterizar parcialmente la secuencia genómica del gen Lvp53, estudiar su expresión ante un estrés térmico e implementar metodologías de transfección in vivo y mutagénesis dirigida mediada por TALENs para determinar la relación entre la pérdida de la actividad de Lvp53 con el ciclo celular. Se identificaron dos regiones intrónicas putativas con posibles sitios funcionales de Lvp53. Se observó regulación positiva de la expresión del transcrito ante variaciones de temperatura alcanzando mayores niveles cuando ésta es incrementada. Además, se...
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tesis de grado
El presente estudio de investigación comprende DISEÑO SÍSMICO ESTRUCTURAL de la Institución Educativa N° 16651 “Petronila Abad Carrión”, bajo la estructura de expediente técnico de ingeniería civil, como posterior material académico de referencia y propuesta de ejecución. El documento de investigación está enfocado bajo la metodología no experimental – mixta; la cual comprende los objetivos específicos de Identificar el estado situacional de la infraestructura, elaborar los estudios básicos de ingeniería, diseño la infraestructura a través de su memoria de cálculo, planos de diseño, metrados, costos, presupuesto y programación de obras y la propuesta de plan de operación y mantenimiento de la infraestructura. La infraestructura de proyecto a nivel primaria y secundaria comprende su diseño de siete edificaciones, con un máximo de dos pisos de altura; dispuest...
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artículo
Dicistroviruses are a family of viruses that affect invertebrates of sanitary and economic importance. Pigeons are also natural reservoirs of pathogens that have caused emerging and re-emerging diseases in humans. Twenty-five pigeons (24 Columba livia and one Zenaida auriculata) were captured in La Plata, Buenos Aires, between May and June 2019. Oropharyngeal/choana and then cloacal swabs were taken from each bird. RNA extraction was performed with Trizol®. For the analysis, 5 μl of total RNA was used for complementary DNA (cDNA) synthesis. The reaction was carried out using multiplex PCR (mPCR) as screening methodology in a final volume of 25 μl. This multiplex PCR amplifies six viruses. As a positive control, a sample previously isolated and characterized in the authors' laboratory as Israeli acute paralysis virus (IAPV) was used, and whose presence was confirmed by screening using ...
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artículo
El objetivo de este estudio fue determinar la expresión de genes del receptor TCRγδ (gamma y delta) en el epitelio yeyunal de 16 crías de alpaca aparentemente sanas, de 2 a 47 días de edad, mediante la cuantificación de ARN mensajero (ARNm) utilizando cebadores específicos. Se tomaron porciones de yeyuno (2 cm de longitud). El ARNm total de la mucosa de la porción media del yeyuno actuó como molde para la síntesis de ADN complementario mediante transcripción reversa (RT), seguida de un PCR-tiempo real para la amplificación y cuantificación de los ARNm de los polipéptidos que conforman las cadenas gamma y delta del TCR. Se utilizó el método 2-ΔΔCt para la cuantificación relativa de ARNm, teniendo como calibrador a dos crías neonatas que no habían consumido calostro. Las crías de 1, 2, 3 y ≥4 semanas de edad expresaron el gen gamma en 4.75, 6.78, 16.24 y 103.11 vece...
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artículo
The aim of this study was to determine the expression of TCRγδ receptor genes (gamma and delta) in the jejunal epithelium of 16 apparently healthy baby alpacas (2 to 47 days of age), by quantifying messenger RNA (mRNA) using specific primers. Jejunumsamples (2 cm long) were collected. Total mRNA of the medium portion of the jejunum acted as template for complementary DNA synthesis by reverse transcription (RT), followed by real-time PCR for the amplification and quantification of the mRNAs of the polypeptides that make up the gamma and delta chains of the TCR. The 2-ΔΔCt method was used for the relative mRNA quantification, using as calibrator two neonatal alpacas that had not consumed colostrum. The alpacas of 1, 2, 3 and >4 weeks of age expressed the gamma gene at 4.75, 6.78, 16.24 and 103.11 folds as expressed by the calibrator animals, respectively, and the delta gene was expr...
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artículo
El presente estudio tuvo como objetivo determinar y comparar los niveles de expresión relativa de ARN mensajero (ARNm) de IgA en el epitelio intestinal de las crías de alpacas en aparente buen estado de salud (n=35) o enfermas con enteropatía (n=35). Encada grupo se incluyeron cinco animales recién nacidos antes del consumo de calostro y cinco por cada semana de edad hasta la sexta semana. Se tomaron 2 cm de yeyuno por animal y se almacenaron en congelación a -196 °C. Se realizó la extracción de ARN total con Trizol® y luego se sintetizó el ADN complementario (ADNc). Posteriormente se realizó el PCR y la RT-PCR Tiempo Real empleando oligonucleótidos diseñados para la detección del exón 1 de la región Fc IgA de alpaca. Se realizó la cuantificación de la expresión relativa mediante normalización con ARNm del gen GAPDH y los cálculos de la expresión relativa se realiza...
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artículo
The objective of the present study was to determine and compare the levels of the relative expression of messenger RNA (mRNA) of IgA in intestinal epithelium of newborn alpaca up to 45 days old, that were in good health status (n=35) and ill with enteropathy (n=35). In each group, five animals were newborns before the consumption of colostrum and five for each week of age until the sixth week. Samples consisted in 2 cm length of jejunum, which was immediately preserved at -196 °C. The extraction was done with Trizol®, then complementary DNA (cDNA) was synthesized. Subsequently, the conventional PCR and real time RT-PCR was conducted using oligonucleotides designed for detecting the exon 1 of the Fc IgA region of alpaca. The quantification of the relative expression was made through normalization with the GAPDH gene mRNA and the relative expression calculations were conducted using the ...
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artículo
Se estandarizó y validó la técnica de Transcriptasa Reversa - Reacción en Cadena de la Polimerasa (RT-T-PCR) en tiempo real para el diagnóstico de la Peste Porcina Clásica (PPC). Se utilizó extractos de tonsilas y nódulos linfáticos de porcinos positivos (n=36) y negativos (n=30) a PPC mediante inmunofluorescencia (IF). La extracción de ARN viral, síntesis del ADN complementario y PCR en tiempo real se realizaron utilizando kits comerciales. Se utilizaron tres pares de cebadores para amplificar una región conservada (5’UTR) del virus PPC (VPPC) y del panpestivirus (virus de la DVB y EF) y una región codificante de la proteína E2 del VPPC frente a cepas de referencia del VPPC Alfort/187, Brescia y cepa China vacunal como controles positivos y cepas de los virus diarrea viral bovina, enfermedad de la frontera y rotavirus porcino como controles negativos. El 83.3 ± 12.3% (3...
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artículo
The objective of this study was to standardize and validate the real-time RT-PCR technique for diagnosis of Infectious Pancreatic Necrosis virus (IPNV) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) from Central Sierra of Peru. Samples of kidney and spleen (n=61) of rainbow trout with apparent clinical signs of IPN and from rainbow trout apparently healthy (n=60) were collected from two fish farms located in the central sierra. Before standardization of the real-time RT-PCR technique, the kidney and spleen samples of 121 rainbow trout were tested for antigen of IPNV by indirect immunofluorescent (IIF) test. In addition, kidney and spleen samples of 10 rainbow trout negative to IPNV by IIF were inoculated with a serial dilution of IPNV strain (from initial concentration of 103 PFU/ml). The RNA extraction of the 121 samples and of the 10 samples inoculated with IPNV strain, the cDNA and the real-t...
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artículo
A real time RT-PCR assay was standardized and validated for detection of classical swine fever virus (CSFV). Tonsil tissue and lymph nodules that were positive (n=36) and negative (n= 30) to CSFV by immunofluorescence test (IF) were selected. The viral RNA extraction, the complementary DNA (cDNA) synthesis and real time RT- PCR were performed using commercial kits. Three sets of primers were tested for amplification of a conserved region (5’UTR) of panpestivirus and 5’UTR Chinese strain and the E2 glycoprotein region (E2 PPC) against reference strains of CSFV: Alfort/187, Brescia, and a vaccine Chinese strain as positive controls, and strains of the bovine viral diarrhea virus, border disease virus and porcine rotavirus as negative controls. The 83.3 ± 12.3% (30/36) of positive simples to CSFV by IF test was positive for virus isolation and the 96.7 ± 3.3% (29/30) of negative sampl...
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artículo
The objective of this study was to standardize and validate the real-time RT-PCR technique for diagnosis of Infectious Pancreatic Necrosis virus (IPNV) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) from Central Sierra of Peru. Samples of kidney and spleen (n=61) of rainbow trout with apparent clinical signs of IPN and from rainbow trout apparently healthy (n=60) were collected from two fish farms located in the central sierra. Before standardization of the real-time RT-PCR technique, the kidney and spleen samples of 121 rainbow trout were tested for antigen of IPNV by indirect immunofluorescent (IIF) test. In addition, kidney and spleen samples of 10 rainbow trout negative to IPNV by IIF were inoculated with a serial dilution of IPNV strain (from initial concentration of 103 PFU/ml). The RNA extraction of the 121 samples and of the 10 samples inoculated with IPNV strain, the cDNA and the real-t...
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artículo
The aim of this study was to isolate and genotyping the Porcine Respiratory and Reproductive Syndrome Virus (PRRSV) strain in pig farms in Lima and Arequipa, Peru. Seropositive pig farms to PRRSV were identified by ELISA test. Blood samples were collected from weaned pigs from positive pig farms in Lima (A=44, B=20; C=16) and Arequipa (D=32, E=92). The serum samples (n=204) were processed in 51 pools of 4 samples each for virus isolation using Porcine Alveolar Macrophage (PAM) cell line. The genome of the virus isolated was identified by Reverse Transcription-nested Polimerase Chain Reaction (RT-nPCR). The complementary DNA (cDNA) of genotype 1 and 2 of PRRSV vaccine strains were used as positive controls and cDNA of equine viral arteritis virus, classical swine fever virus and PAM cells as negative controls in the RT-nPCR. Three blind passages in PAM cell line with each of the 51 pool w...
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artículo
The aim of this study was to isolate and genotyping the Porcine Respiratory and Reproductive Syndrome Virus (PRRSV) strain in pig farms in Lima and Arequipa, Peru. Seropositive pig farms to PRRSV were identified by ELISA test. Blood samples were collected from weaned pigs from positive pig farms in Lima (A=44, B=20; C=16) and Arequipa (D=32, E=92). The serum samples (n=204) were processed in 51 pools of 4 samples each for virus isolation using Porcine Alveolar Macrophage (PAM) cell line. The genome of the virus isolated was identified by Reverse Transcription-nested Polimerase Chain Reaction (RT-nPCR). The complementary DNA (cDNA) of genotype 1 and 2 of PRRSV vaccine strains were used as positive controls and cDNA of equine viral arteritis virus, classical swine fever virus and PAM cells as negative controls in the RT-nPCR. Three blind passages in PAM cell line with each of the 51 pool w...