Nuclear and plastidial SNP and INDEL markers for genetic tracking studies of Jacaranda copaia
Descripción del Articulo
Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL nucleares y plastidiales utilizando la secuenciación del ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura con fines de genética de poblaciones y seguimiento de la madera en la es...
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Formato: | artículo |
Fecha de Publicación: | 2019 |
Institución: | Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruana |
Repositorio: | IIAP-Institucional |
Lenguaje: | inglés |
OAI Identifier: | oai:repositorio.iiap.gob.pe:20.500.12921/443 |
Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12921/443 https://doi.org/10.1007/s12686-019-01097-9 |
Nivel de acceso: | acceso cerrado |
Materia: | Jacaranda copaia Genotipos Muestreo secuencial Huellas genéticas ADN Trazabilidad Madera tropical Polimorfismo de un solo nucleótido |
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Sebbenn, Alexandre M.Blanc‑Jolivet, CelineMader, MalteMeyer‑Sand, BarbaraParedes Villanueva, KathelynHonorio Coronado, EurídiceGarcía Dávila, CarmenTysklind, NiklasTroispoux, ValerieDelcamp, AdlineDegen, Bernd2020-03-05T17:08:22Z2020-03-05T17:08:22Z2019-05Sebbenn, A.M., Blanc-Jolivet, C., Mader, M. et al. Nuclear and plastidial SNP and INDEL markers for genetic tracking studies of Jacaranda copaia. Conservation Genet Resour 11, 341–343 (2019). https://doi.org/10.1007/s12686-019-01097-91877-7260https://hdl.handle.net/20.500.12921/443Conservation Genetics Resourceshttps://doi.org/10.1007/s12686-019-01097-9Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL nucleares y plastidiales utilizando la secuenciación del ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura con fines de genética de poblaciones y seguimiento de la madera en la especie maderera neotropical Jacaranda copaia. Se utilizaron 407 SNPs nucleares, 29 de cloroplasto y 31 de loci mitocondriales para genotipar 92 individuos de Brasil, Bolivia, Guayana Francesa y Perú. Sobre la base de las elevadas tasas de amplificación y la diferenciación genética entre poblaciones, se seleccionaron 113 SNP nucleares, 11 de cloroplasto y 4 loci mitocondriales, y se validó su uso para el seguimiento genético del origen de la madera.Revisión por pares.application/pdfengSpringer Natureinfo:eu-repo/semantics/articlehttps://link.springer.com/article/10.1007/s12686-019-01097-9info:eu-repo/semantics/closedAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/Instituto de Investigaciones de la Amazonía PeruanaRepositorio Institucional - IIAPreponame:IIAP-Institucionalinstname:Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruanainstacron:IIAPJacaranda copaiaGenotiposMuestreo secuencialHuellas genéticas ADNTrazabilidadMadera tropicalPolimorfismo de un solo nucleótidoNuclear and plastidial SNP and INDEL markers for genetic tracking studies of Jacaranda copaiainfo:eu-repo/semantics/articleORIGINALsebbenn_articulo_2019.pdfsebbenn_articulo_2019.pdfTexto Completoapplication/pdf516887https://repositorio.iiap.gob.pe/bitstream/20.500.12921/443/1/sebbenn_articulo_2019.pdf49ff2e38a17e5943c5cd647f437f5066MD51licence.txtlicence.txtLicenciatext/plain; charset=utf-8564https://repositorio.iiap.gob.pe/bitstream/20.500.12921/443/2/licence.txtd01e77160199194c1e849481498182e2MD52TEXTsebbenn_articulo_2019.pdf.txtsebbenn_articulo_2019.pdf.txtExtracted texttext/plain11856https://repositorio.iiap.gob.pe/bitstream/20.500.12921/443/9/sebbenn_articulo_2019.pdf.txt532639d341900bf416949a99f6821c9eMD59THUMBNAILsebbenn_articulo_2019.pdf.jpgsebbenn_articulo_2019.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9703https://repositorio.iiap.gob.pe/bitstream/20.500.12921/443/10/sebbenn_articulo_2019.pdf.jpgb0267c45873b0de3191092380f169992MD51020.500.12921/443oai:repositorio.iiap.gob.pe:20.500.12921/4432022-12-29 19:07:24.598Repositorio Institucional del IIAPrepositorioIIAP-help@iiap.gob.pe |
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Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL nucleares y plastidiales utilizando la secuenciación del ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura con fines de genética de poblaciones y seguimiento de la madera en la especie maderera neotropical Jacaranda copaia. Se utilizaron 407 SNPs nucleares, 29 de cloroplasto y 31 de loci mitocondriales para genotipar 92 individuos de Brasil, Bolivia, Guayana Francesa y Perú. Sobre la base de las elevadas tasas de amplificación y la diferenciación genética entre poblaciones, se seleccionaron 113 SNP nucleares, 11 de cloroplasto y 4 loci mitocondriales, y se validó su uso para el seguimiento genético del origen de la madera. |
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