1
artículo
Publicado 2019
Enlace

Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL nucleares y plastidiales utilizando la secuenciación del ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura con fines de genética de poblaciones y seguimiento de la madera en la especie maderera neotropical Jacaranda copaia. Se utilizaron 407 SNPs nucleares, 29 de cloroplasto y 31 de loci mitocondriales para genotipar 92 individuos de Brasil, Bolivia, Guayana Francesa y Perú. Sobre la base de las elevadas tasas de amplificación y la diferenciación genética entre poblaciones, se seleccionaron 113 SNP nucleares, 11 de cloroplasto y 4 loci mitocondriales, y se validó su uso para el seguimiento genético del origen de la madera.
2
artículo
Publicado 2019
Enlace

Desarrollamos marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) y de inserción/deleción (INDEL) para especies de Dipteryx utilizando una combinación de secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura. Del total de 315 loci genotipados utilizando una plataforma MassARRAY, 292 loci fueron variables y polimórficos entre los 73 individuos muestreados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Se desarrolló un conjunto final de 56 SNPs nucleares, 26 SNPs de cloroplasto, 2 INDELs de cloroplasto y 32 SNPs mitocondriales que identifican una estructura poblacional significativa. Este conjunto de loci será útil para los estudios de genética poblacional de las especies de Dipteryx en la Amazonia.
3
artículo
Publicado 2019
Enlace

Se utilizó la secuenciación genómica MiSeq de baja cobertura y la secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADseq) para identificar marcadores genéticos SNP e INDEL nucleares y plastídicos en Carapa guianensis. Se describen 261 marcadores genéticos que incluyen 237 SNP nucleares, 22 SNP plastídicos y 2 INDEL plastídicos, basados en 96 individuos genotipados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Los 117 mejores SNPs para identificar la estructura de la población y realizar la asignación de individuos se reúnen en cuatro multiplex para el genotipado MassARRAY.
4
artículo
Publicado 2019
Enlace

Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL (inserción/eliminación) nucleares y cloroplásticos utilizando la secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación genómica MiSeq de baja cobertura para establecer un método de seguimiento genético del origen geográfico de Hymenaea sp. A partir de dos conjuntos iniciales de 358 y 32 loci utilizados para genotipar al menos 94 individuos, se desarrolló un conjunto final de 75 nSNPs, 50 cpSNPs y 6 INDELs que identifican una estructura poblacional significativa.
5
artículo
Publicado 2024
Enlace

The speed of growth in height of Swietenia macrophylla stands out in terms of resistance to attack by the Hypsipyla grandella borer and the selection of fast-growing families can make commercial plantings viable. The characters height, diameter, number of leaves and stem form of trees from 4 families of S. macrophylla, aged 47.5 months, planted in Ucayali, Peru, were used to investigate the possibility of selecting fast-growing genotypes. The average heritability (h2m) and selective accuracy (Acprog) between families were moderate for total height (Ht: h2m: 0.407; Acprog: 0.638) and commercial height (Hc: h2m: 0.472; Acprog: 0.687), in addition to Hc positively correlating with susceptibility to the drill attack. The stem form showed statistical differences between families and great h2m (0.984) and Acprog (0.921). The genetic (rg) and phenotypic (rf) correlations between traits showed t...