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tesis de grado
Publicado 2022
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El tizón tardío, causado por el oomyceto patógeno Phytophthora infestans, es la principal enfermedad que afecta al cultivo de la papa. Debido a que es un riesgo para la seguridad alimentaria, se han identificado genes de resistencia a P. infestans en cultivares comerciales de papa para ser empleados en programas de cruza y fitomejoramiento; sin embargo, son pocos los estudios que han evaluado la resistencia a nivel molecular en variedades locales. En el presente trabajo, se utilizaron herramientas bioinformáticas para determinar las funciones biológicas, rutas metabólicas y relaciones funcionales existentes entre las proteínas putativas de genes diferencialmente expresados (DEGs) en Solanum goniocalyx por su reacción resistente y susceptible a Phytophthora infestans cepa POX-67 a las 0 y 48 horas post-inoculación (hpi). Los resultados evidencian genes más expresados que codific...
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tesis doctoral
Publicado 2025
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Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencia Animal
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tesis de maestría
Publicado 2025
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La fijación de la larva metacéstode de Taenia solium al intestino humano es fundamental para la transición del parásito a su estadio adulto. Un proceso clave es la evaginación del escólex, la cual es inducida por sales biliares y enzimas digestivas. Los mecanismos moleculares asociados a este evento no están completamente entendidos. El presente proyecto busca caracterizar la evaginación del escólex a nivel transcriptómico en un modelo in vitro de inducción por ácido taurocólico (AT). Se validaron las condiciones experimentales de acuerdo con los perfiles de expresión de parásitos antes y después de evaginar el escólex mediante PCA y agrupamiento jerárquico. Se anotó funcionalmente el transcriptoma de T. solium mediante Blast2GO y se identificaron transcritos diferencialmente expresados entre parásitos evaginados y no evaginados en presencia o ausencia de AT mediante ...
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tesis de grado
Publicado 2021
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El presente trabajo tuvo como finalidad evaluar la interacción in vivo, mediante ensayos de pull-down, de la proteína de Werner (WRN), con los ARNm totales, ambos aislados de células HeLa. Los dominios N-terminal, ATPasa y DEAD, de la proteína WRN fueron clonados utilizando el sistema de expresión de E. coli y luego purificados mediante cromatografía de afinidad a Glutationa Sefarosa con los cuales se realizaron ensayos EMSA (ensayo de cambio de movilidad electroforética) y RT-qPCR para esclarecer que dominios de la proteína de WRN podrían estar involucrados en la formación de complejos de unión al ARNm. Mediante ensayos de pull-down con Oligo(dT) conjugado a esferas magnéticas se determinó que la proteína de Werner era capaz de interactuar con los ARNm in vivo. Para el control de la interacción de proteínas con los ARNm se utilizaron las proteínas NXF1 y CBP80, evidenci...
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tesis de grado
Publicado 2006
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ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS POR REPETICIONES INESTABLES ENFERMEDAD DE HUNTINGTON HUNTINGTINA PATOGENICIDAD DE LA HUNTINGTINA MUTADA NEUROPATOLOGÍA DE LA ENFERMEDAD DE HUNTINGTON FISIOPATOLOGÍA SÍNTOMAS FÍSICOS Y PSICOLÓGICOS TRATAMIENTO INCIDENCIA DE LA ENFERMEDAD DE HUNTINGTON EN EL MUNDO TERAPIA CON OSMOPROTECTORES OSMOLITOS FUNCIÓN DE LOS OSMOLITOS ORGÁNICOS BIOINFORMÁTICA MODELAMIENTO MOLECULAR MODELAMIENTO PROTEICO CAMPOS DE FUERZA PARA MODELAMIENTO MOLECULAR OPTIMIZACIÓN GEOMÉTRICA DINÁMICA MOLECULAR INTERACCIÓN PROTEÍNA-LIGANDO VALIDACIÓN DE ESTRUCTURAS TERMODINÁMICA ESTADÍSTICA METODOLOGÍA Y DETALLES COMPUTACIONALES EQUIPOS Y SOFTWARE ANÁLISIS DE LA ESTRUCTURA PRIMARIA DE LA PROTEÍNA HUNTINGTINA CONSTRUCCIÓN DEL PRIMER EXÓN DE LA HUNTINGTINA NATIVA CONSTRUCCIÓN DEL PRIMER EXÓN DE LA HUNTINGTINA MUTADA CONSTRUCCIÓN DE LOS...
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informe técnico
Publicado 2016
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Realizar un análisis de las relaciones filogenéticas de la conglutina gamma de L. albus con otras proteínas vegetales y evaluar mediante docking molecular su interacción con moléculas relacionadas al control de la glicemia. Materiales y métodos: Se evaluaron las secuencias de aminoácidos del GenBank mediante BLAST, del cual se obtuvieron similitudes del 20% a 80%. Se usó la aplicación ModelGenerator_v_85 para encontrar el mejor modelo de sustitución y el servidor PHYML para generar un árbol de máxima verosimilitud. Se modeló la proteína en su forma monomérica con Phyre2. Se descargaron del PDB estructuras de insulina humana y relacionadas, se refinaron con 3DRefine y se prepararon con Chimera 1.10.2 para docking. Los análisis de docking se realizaron en ClusPro y se compararon las energías mínimas de los 3 mejores modelos elegidos por CONSRANK. Resultados: Las secuencia...
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tesis de grado
Publicado 2022
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Introducción. Desde el descubrimiento de los anticuerpos monoclonales (mAbs) y nanocuerpos (VHH), nuevas investigaciones buscan la aplicación de la inmunología en el diagnóstico de la Enfermedad de Alzheimer (EA), teniendo como blanco de interacción la proteína beta-amiloide (ßA), sin embargo, sus resultados aún son expectantes. El objetivo del estudio fue evaluar las interacciones de anticuerpos monoclonales (Solanezumab, Gantenerumab y Crenezumab) y nanocuerpos de camélidos (llama, vicuña y camello) sobre las estructuras de la proteína betaamiloide para el diagnóstico de la Enfermedad de Alzheimer, mediante herramientas computacionales. Materiales y Métodos. Fue un estudio experimental in silico, las estructuras se obtuvieron del Protein Data Bank (PDB), la simulación de dinámica molecular (DM) se realizó en el software GROMACS v.5.0.5., RMSD (Root mean square deviation...
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tesis de grado
Publicado 2023
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La infección pulmonar por Mycobacterium tuberculosis se asocia con el cáncer de pulmón. Así, las personas con historial de tuberculosis pulmonar tienen más riesgo de desarrollar cáncer de pulmón que aquellas que no tuvieron tuberculosis. Sin embargo, existe poca información sobre la participación de M. tuberculosis en la etiología de la neoplasia pulmonar. Se ha descrito que M. tuberculosis daña el ADN de las células humanas, aunque no se sabe cómo. Un posible mecanismo sería a través de proteínas secretadas como parte de su virulencia, que se dirijan al núcleo. Por ello, en este estudio nos propusimos predecir las proteínas secretadas por M. tuberculosis que se dirigen al núcleo de la célula huésped, mediante una difusión pasiva, y su potencial interacción con el ADN. Utilizando programas bioinformáticos, descubrimos que de las 972 proteínas que componen el secr...
9
tesis de maestría
Publicado 2018
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La pirazinamida (PZA) es una pro-droga de primera línea utilizada en la lucha contra la tuberculosis, su importancia radica en el acortamiento del tiempo de tratamiento y su acción sobre micobacterias persistentes no replicantes. Hasta la fecha los mecanismos de acción y resistencia a PZA en Mycobacterium tuberculosis (MTB) no son conocidos completamente. Se postuló que PZA podría inhibir el proceso de transtraducción, debido a que el ácido pirazinoico (POA), forma activa de PZA, puede unirse al RpsA y competir con el tmRNA, cofactor natural de la proteína. La deleción en alanina 438 en el extremo carboxilo terminal de RpsA (∆A438) fue asociada a la pérdida de afinidad por POA, causando resistencia a PZA. El objetivo del estudio fue entender la manera en que ∆Ala438 en RpsA estaría asociada a la resistencia a PZA en MTB. Para esto se expresaron RpsA nativa, RpsA ∆Ala438,...
10
tesis de grado
Publicado 2019
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Las calpaínas son proteasas dependientes de calcio de la familia de las cistein proteasas, cuya participación en enfermedades neurodegenerativas está siendo documentada y estudiada. En nuestro laboratorio se han encontrado evidencias de la interacción entre calpaína 10 y los canales de sodio dependientes de voltaje (NaV). Los canales NaV son elementos clave en el proceso de la señalización neuronal, que inicia con la despolarización de la neurona con la subsecuente activación de canales dependientes de voltaje. La actividad anormal de los NaV ha sido asociada a desórdenes de la excitabilidad y la muerte neuronal. La calpaína 10 es una calpaína atípica que es expresada en el cerebro, entre otros tejidos, la cual ha sido asociada al riesgo de padecer diabetes mellitus tipo 2. En nuestro laboratorio se ha visto también que el ARNm de la calpaína 10 es sobre expresada en neuro...
11
tesis de maestría
Publicado 2019
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Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Maestría en Nutrición
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tesis de grado
Publicado 2022
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SARS-CoV-2 es un coronavirus zoonótico cuyo impacto se extiende más allá del ámbito de la salud humana, pues se ha reportado infección natural y experimental en animales, siendo el grupo de mamíferos el más afectado para ambos casos (1). Esta situación es preocupante, puesto que no sólo los animales domésticos están en riesgo sino también los que habitan ambientes naturales como el hábitat acuático. Se ha reportado la presencia de SARS-CoV-2 en aguas residuales (2), lo que puede contribuir con la dispersión del virus por cuerpos de agua dulce y salada. También, la interacción directa entre personas y fauna marina facilita la propagación de SARS-CoV-2 (3). Dado el potencial de SARS-CoV-2 de afectar la biodiversidad, los estudios in silico contribuyen a predecir la susceptibilidad de diversas especies al virus. Por ejemplo, mediante el análisis comparativo de secuencias ...
13
tesis de grado
Publicado 2015
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Esta Investigación se realizo durante año 2015, mide efectos de interacción animal y humana en comunicación y comportamiento molecular, observando cómo se presentan la conexiones entre la variable dependiente emisión de sonidos (trino o canto de ave) (relincho de equinos) protestas (de jinetes) cuando están sometidos como variable de control a privación de ingesta de comida por 24 horas, efectos que se correlacionaron con estado de ánimo emocional de los sujetos participantes (aves, yeguas y jinetes ) con la variable independiente neuropeptidos en disminución o aumento de proteáceas (neuro péptidos) a nivel molecular de células ganglionares y del hipocampo observadas vía hematológica. Todos estos comportamientos son interactivos en la comunicación haciendo posible la observación experimental descriptiva del comportamiento sonoro auditivo de aves , mamíferos (equinos y j...
14
tesis de maestría
Publicado 2022
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Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Maestría en Nutrición
15
tesis de grado
Publicado 2022
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El cáncer es la enfermedad que más vidas cobra anualmente, aunque las opciones de tratamiento más modernas han logrado aumentar la sobrevida. Aún queda mucho por investigar en esta área. Objetivos: Identificar las posibles interacciones moleculares entre compuestos de origen natural y la quinasa dependiente de ciclina 4 (CDK4). Método: se realizó una búsqueda en las bases de datos PubChem y ChEMBL de compuestos naturales y se modeló la proteína CDK4 mediante el programa template 2W96. Posteriormente se realizó un screening virtual mediante AutoDock Vina y se comparó la afinidad de las distintas interacciones. Resultados: Se recopiló 60 compuestos naturales, de los cuales 1,3-dibenzyl-2,4,5-trimethylimidazolium, alcaloide de la maca, y el dímero 3 de la curcumina mostraron mayor afinidad a CDK4 que el Adenosín trifosfato, ligando natural de esta. Conclusiones: estos ligando...
16
tesis de grado
Publicado 2017
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Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Zootecnia. Departamento Académico de Nutrición
17
tesis de grado
Publicado 2018
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En el presente estudio se pudo analizar la naturaleza de la interacción entre la quinurenina amino transferasa II (KAT-II) y 16 potenciales fármacos, logrando en primer término la generación de campos de fuerza necesarios para el inicio del estudio en fármacos, mediante adaptación al potencial tipo OPLSAA. Así mismo, tanto la proteína como los fármacos, fueron estabilizados mediante simulaciones de dinámica molecular, logrando determinar sus estructuras promedio en las zonas de equilibrio de las dinámicas moleculares en un ensamble canónico (NVT). El acoplamiento entre la KAT-II y los 16 fármacos y su posterior simulación de dinámica molecular, nos mostró que el fármaco, aunque reacciona directamente con el PLP, requiere de un ambiente adecuado para que la reacción se produzca, y ese ambiente en mayor o menor grado dependerá de los aminoácidos más cercanos, luego de ...
18
tesis de grado
Publicado 2009
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En las zonas alto-andinas del Perú, donde la agricultura y ganadería común no son viables, la crianza de camélidos, como la alpaca, constituye el único medio de subsistencia y principal actividad económica de las familias campesinas. Por tanto, el estudio de la fisiología reproductiva de la alpaca es indispensable para el establecimiento de proyectos de mejoramiento genético y reproducción asistida. Las proteínas que participan en la interacción de los gametos de las alpacas son desconocidas, es por ello que el presente trabajo planteó determinar la expresión proteica y la caracterización de una proteína de Zona Pelúcida (ZP) que induzca espontáneamente la reacción acrosómica (RA) en ovocitos de alpacas. En la mayoría de mamíferos la ZP está conformada por tres glicoproteínas ZP1, ZP2 y ZP3. En el presente trabajo se demostró que en las alpacas existen también 3 ...
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artículo
High world population and the increase in global food demands results in an indiscriminate use of chemical fertilizers by farmers, causing soil deterioration and other environmental problems. In recent years there has been a collective concern to preserve the environment through sustainable and environmentally friendly techniques. Plant growth-promoting bacteria (PGPB) are widely known to benefit plants in a sustainable manner, reducing chemical fertilizers application. Many studies have shown that these bacteria not only improve crop yields but also its quality, increasing certain nutrients and molecules that are important for human health such as aminoacids, proteins, vitamins, flavonoids, antioxidants, essential oils, among others. This work compiles recent information of PGPB as an alternative of chemical fertilizer for improving crop yields and plant metabolites production.
20
tesis de grado
Publicado 2022
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El objetivo del presente trabajo de investigación fue optimizar las condiciones de operación para la hidrólisis de proteínas de residuos de langostinos (RL), que permita, mediante el empleo de una cepa proteolítica, desproteinizar los RL, como paso preliminar para su adecuado manejo obteniendo una variedad de productos como hidrolizados proteicos, quitina, quitosano, astaxantina, sales de calcio, etc. Se evaluaron dos cepas bacterianas RL-08 y RL-42, de los géneros Shewanella sp. y Bacillus sp. respectivamente. Estas cepas fueron escogidas por su capacidad proteolítica, las cuales provienen del Laboratorio de Biotecnología del Instituto Tecnológico de la Producción (ITP) el cual, cuenta con un banco de cepas. Los resultados indicaron que la cepa RL-08 tuvo un mayor crecimiento en residuos de langostinos y fue más efectiva en desproteinizar los mismos en comparación a la cepa ...
