Development of nuclear and plastid SNP and INDEL markers for population genetic studies and timber traceability of Carapa species
Descripción del Articulo
Se utilizó la secuenciación genómica MiSeq de baja cobertura y la secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADseq) para identificar marcadores genéticos SNP e INDEL nucleares y plastídicos en Carapa guianensis. Se describen 261 marcadores genéticos que incluyen 237 SNP nucleares, 22 SNP plast...
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Formato: | artículo |
Fecha de Publicación: | 2019 |
Institución: | Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruana |
Repositorio: | IIAP-Institucional |
Lenguaje: | inglés |
OAI Identifier: | oai:repositorio.iiap.gob.pe:20.500.12921/442 |
Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12921/442 https://doi.org/10.1007/s12686-019-01090-2 |
Nivel de acceso: | acceso cerrado |
Materia: | Carapa guianensis Meliaceae Genotipos Trazabilidad Huellas genéticas ADN Polimorfismo de un solo nucleótido Madera tropical Carapa surinamensis |
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Se utilizó la secuenciación genómica MiSeq de baja cobertura y la secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADseq) para identificar marcadores genéticos SNP e INDEL nucleares y plastídicos en Carapa guianensis. Se describen 261 marcadores genéticos que incluyen 237 SNP nucleares, 22 SNP plastídicos y 2 INDEL plastídicos, basados en 96 individuos genotipados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Los 117 mejores SNPs para identificar la estructura de la población y realizar la asignación de individuos se reúnen en cuatro multiplex para el genotipado MassARRAY. |
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