Development of nuclear and plastid SNP markers for genetic studies of Dipteryx tree species in Amazonia
Descripción del Articulo
Desarrollamos marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) y de inserción/deleción (INDEL) para especies de Dipteryx utilizando una combinación de secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura. Del total de 315 loci genotipados u...
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| Fecha de Publicación: | 2019 |
| Institución: | Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruana |
| Repositorio: | IIAP-Institucional |
| Lenguaje: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.iiap.gob.pe:20.500.12921/441 |
| Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12921/441 https://doi.org/10.1007/s12686-019-01081-3 |
| Nivel de acceso: | acceso cerrado |
| Materia: | Marcadores genéticos Polimorfismo de un solo nucleótido Dipteryx Procedencia Madera tropical Amazonía |
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Desarrollamos marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) y de inserción/deleción (INDEL) para especies de Dipteryx utilizando una combinación de secuenciación de ADN asociada a la restricción (RADSeq) y secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura. Del total de 315 loci genotipados utilizando una plataforma MassARRAY, 292 loci fueron variables y polimórficos entre los 73 individuos muestreados de Guayana Francesa, Brasil, Perú y Bolivia. Se desarrolló un conjunto final de 56 SNPs nucleares, 26 SNPs de cloroplasto, 2 INDELs de cloroplasto y 32 SNPs mitocondriales que identifican una estructura poblacional significativa. Este conjunto de loci será útil para los estudios de genética poblacional de las especies de Dipteryx en la Amazonia. |
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