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tesis de maestría
En el Perú, las producciones agrícolas en la costa están esencialmente relacionadas al uso de suelos de zonas áridas mediante sistemas de irrigación, como por ejemplo el cultivo de la vid en la Región Piura. En el presente trabajo, se analizó la composición microbiana de suelos prístinos y cultivados con vid mediante la metagenómica dirigida al gen ADNr 16S y cultivo bacteriano. En el suelo prístino, las bacterias más abundantes pertenecieron a los géneros Bacillus, Hymenobacter, Exyguobacterium, según el enfoque metagenómico; y los géneros Cronobacter, Bacillus y Bordetella, mediante cultivo. En el suelo cultivado con vid, los principales géneros identificados fueron: Flavobacterium, Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter y Nocardioides, según el enfoque metagenómico; y los géneros Enterobacter, Pseudomonas y Aeromonas, mediante cultivo. La mayoría de géneros identifi...
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Antecedentes: Pasteuria penetrans es una bacteria no cultivable que parasita obligadamente a varias especies de nemátodos fitopatógenos. Factores endógenos reproductivos femeninos, vegetales o microbianos desconocidos son indispensables para la multiplicación y formación de endosporas de P. penetrans. Objetivo: Caracterizar las endosporas de P. penetrans mediante la secuenciación del gen 16S ARNr en muestras de hembras adultas de Meloidogyne javanica infectadas y microbiota de hembras adultas de M. javanica infectadas y no infectadas con P. penetrans mediante secuenciamiento de alto rendimiento de la región hipervariable V4 del gen 16S ARNr. Metodología: Se colectaron las raíces infectadas de viñedos, se extrajo nemátodos juveniles (J2) infectivos frescos para fijación de endosporas de P. penetrans y su inoculación en plantas de tomate. El ADN genómico y metagenómico de he...
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La principal problemática del cultivo de vid son los nematodos agalladores de la raíz causan serios problemas en el rendimiento en la mayoría de cultivos en todo el mundo. A través de sus diferentes mecanismos de infección estos nematodos sintetizan y secretan una mezcla de efectores a base de compuestos proteicos que utilizan para penetrar la raíz, migrar y desarrollarse en células gigantes de alimentación radicular en las plantas hospederas. El uso de nuevas herramientas moleculares como la espectrometría de masas MALDI TOF/TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - Time-Of-Flight) y la técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction) han permitido conocer estas proteínas y genes en diferentes microorganismos. Objetivo: Caracterizar al nematodo agallador de la raíz Meloidogyne javanica mediante la secuenciación del gen ARNr 18S a partir de muestras radiculares infectadas...