Identificación molecular de fitoplasmas en el cultivo de papa (Solanum tuberosum L.) en el Valle del Mantaro
Descripción del Articulo
El cultivo de papa es de gran importancia para la alimentación en el Valle de Mantaro, pero está siendo atacado por enfermedades causadas por un complejo de fitoplasmas y virus en las dos últimas décadas, ocasionando pérdidas económicas considerables. Con el objetivo de identificar molecularmente al...
Autor: | |
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Formato: | tesis de grado |
Fecha de Publicación: | 2022 |
Institución: | Universidad Nacional del Centro del Perú |
Repositorio: | UNCP - Institucional |
Lenguaje: | español |
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Nivel de acceso: | acceso abierto |
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El cultivo de papa es de gran importancia para la alimentación en el Valle de Mantaro, pero está siendo atacado por enfermedades causadas por un complejo de fitoplasmas y virus en las dos últimas décadas, ocasionando pérdidas económicas considerables. Con el objetivo de identificar molecularmente al o a los fitoplasmas que infectan al cultivo de papa Solanum tuberosum L. en el Valle del Mantaro, se realizó una investigación en el Centro de Investigación Biología Molecular Vegetal de la UNCP. El muestreo de plantas se hizo de manera dirigida no probabilística. Para ello se colectaron plantas con síntomas de: enrollamiento de la hoja, clorosis, punta morada, achaparramiento, mosaico, hojas erectas, proliferación de brotes, tuberización aérea y antocianescencia, así como plantas asintomáticas; la cantidad de muestras por localidad fue de 10 sintomáticas y 2 asintomáticas en los distritos de: Manzanares, Orcotuna, Sicaya, Pilcomayo y Huachac. La extracción de ADN total, se realizó con el método de cromatografía de columna con el kit innuPREP Plant DNA. La detección de fragmentos se realizó mediante PCR anidada con los primers universales (P1/P7 y P1A/16S-SR). El secuenciamiento se hizo en Macrogen Inc. en Seul, Korea del Sur. Y el análisis Bioinformático se hizo con los softwares Blastn y Mega V.6. La especie de fitoplasma identificado en Manzanares, Concepción fue:Candidatus phytoplasma pruni, el análisis filogenético indica que pertenece al grupo III y al subgrupo J. Este fitoplasma viene constituyéndose en una amenaza para el cultivo de papa. |
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Para ello se colectaron plantas con síntomas de: enrollamiento de la hoja, clorosis, punta morada, achaparramiento, mosaico, hojas erectas, proliferación de brotes, tuberización aérea y antocianescencia, así como plantas asintomáticas; la cantidad de muestras por localidad fue de 10 sintomáticas y 2 asintomáticas en los distritos de: Manzanares, Orcotuna, Sicaya, Pilcomayo y Huachac. La extracción de ADN total, se realizó con el método de cromatografía de columna con el kit innuPREP Plant DNA. La detección de fragmentos se realizó mediante PCR anidada con los primers universales (P1/P7 y P1A/16S-SR). El secuenciamiento se hizo en Macrogen Inc. en Seul, Korea del Sur. Y el análisis Bioinformático se hizo con los softwares Blastn y Mega V.6. La especie de fitoplasma identificado en Manzanares, Concepción fue:Candidatus phytoplasma pruni, el análisis filogenético indica que pertenece al grupo III y al subgrupo J. 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Facultad de AgronomíaIngeniero Agrónomohttps://orcid.org/0000-0002-6262-237X19936653811036Gamarra Gamarra, Delia PalmiraLópez Orihuela, GlicerioTorres Suarez, Gilbertohttp://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttp://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional44876962ORIGINALT010_44876962_T_removed.pdfT010_44876962_T_removed.pdfapplication/pdf2840819http://repositorio.uncp.edu.pe/bitstream/20.500.12894/8627/1/T010_44876962_T_removed.pdfecf9a5636fccf684c8bf9294a899a4bfMD51THUMBNAILT010_44876962_T_removed.pdf.jpgT010_44876962_T_removed.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6639http://repositorio.uncp.edu.pe/bitstream/20.500.12894/8627/3/T010_44876962_T_removed.pdf.jpgdda58ba826bd550979337b8ef9647f81MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81327http://repositorio.uncp.edu.pe/bitstream/20.500.12894/8627/2/license.txtc52066b9c50a8f86be96c82978636682MD5220.500.12894/8627oai:repositorio.uncp.edu.pe:20.500.12894/86272023-02-28 03:00:57.726DSpacerepositorio@uncp.edu.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 |
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