GENETIC VARIABILITY OF NATURAL POPULATIONS OF CHESTNUT Bertholletia excelsa IN THE MADRE DE DIOS REGION, PERUVIAN AMAZON
Descripción del Articulo
Population genetic variability of Brazil nut Bertholletia excelsa in the Madre de Dios region was determined by analyzing 11 microsatellites markers in a total of 108 trees. The global results showed a great allelic diversity (89 alleles, with a mean of 8.09 alleles per locus), at the localities lev...
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| Formato: | artículo |
| Fecha de Publicación: | 2022 |
| Institución: | Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruana |
| Repositorio: | Folia Amazónica |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:ojs.pkp.sfu.ca:article/606 |
| Enlace del recurso: | https://revistas.iiap.gob.pe/index.php/foliaamazonica/article/view/606 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Amazonia peruana genética de poblaciones microsatélites nuez de Brasil Peruvian Amazon population genetics microsatellites brazilian nut |
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GENETIC VARIABILITY OF NATURAL POPULATIONS OF CHESTNUT Bertholletia excelsa IN THE MADRE DE DIOS REGION, PERUVIAN AMAZON VARIABILIDAD GENÉTICA DE POBLACIONES NATURALES DE CASTAÑA Bertholletia excelsa EN LA REGIÓN DE MADRE DE DIOS, AMAZONIA PERUANA |
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PANDURO, Hugo CORVERA-GOMRINGER, Ronald CASTRO-RUIZ, Diana RENNO, Jean-François CASTILLO-TORRES, Dennis del GARCÍA, Mildred CUSI, Edgar RÍOS-ZUMAETA, Richer ANGULO, Carlos ALVARADO, Jhon GARCIA-DAVILA, Carmen |
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Amazonia peruana genética de poblaciones microsatélites nuez de Brasil Peruvian Amazon population genetics microsatellites brazilian nut |
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Population genetic variability of Brazil nut Bertholletia excelsa in the Madre de Dios region was determined by analyzing 11 microsatellites markers in a total of 108 trees. The global results showed a great allelic diversity (89 alleles, with a mean of 8.09 alleles per locus), at the localities level the highest allelic richness was found in Iberia (AR = 4.82) and the lowest in Itahuania (AR = 3.64), this the same localities were the only ones that presented an excess of heterozygotes. The results of the correspondence factor analysis (AFC) show a strong genetic overlap between most of the analyzed localities. The results of the Fixation Index (Fst) show that the localities of Iñapari and Iberia are more related to each other (Fst = 0.048), but slightly differentiated with the other localities (the values of Fst with the other localities varied between -0.001 to 0.193). The dendrogram based on the genetic distance of Nei (1978) shows that the 11 localities are forming three different genetic groupings, (A): Amigos, Pukiri, Itahuania and Manuripe; (B): Heath, Tambopata, Virgen del Carmen, Pariamanu, Iberia and Iñapari; and (C) made up only of the Alert locality. The groups within the clusters could be attributed to the few physical barriers between the localities within each cluster, while the differentiations between the clusters could be related to the presence of rivers between these groups, which could constitute insurmountable physical barriers to for gene flow between these clusters. |
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Folia Amazonica; Vol. 30 No. 2 (2021); 217-233 Folia Amazónica; Vol. 30 Núm. 2 (2021); 217-233 Folia Amazónica; v. 30 n. 2 (2021); 217-233 2410-1184 1018-5674 10.24841/fa.v30i2 reponame:Folia Amazónica instname:Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruana instacron:IIAP |
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GENETIC VARIABILITY OF NATURAL POPULATIONS OF CHESTNUT Bertholletia excelsa IN THE MADRE DE DIOS REGION, PERUVIAN AMAZONVARIABILIDAD GENÉTICA DE POBLACIONES NATURALES DE CASTAÑA Bertholletia excelsa EN LA REGIÓN DE MADRE DE DIOS, AMAZONIA PERUANAPANDURO, HugoCORVERA-GOMRINGER, RonaldCASTRO-RUIZ, DianaRENNO, Jean-FrançoisCASTILLO-TORRES, Dennis delGARCÍA, MildredCUSI, EdgarRÍOS-ZUMAETA, RicherANGULO, CarlosALVARADO, JhonGARCIA-DAVILA, CarmenAmazonia peruanagenética de poblacionesmicrosatélitesnuez de BrasilPeruvian Amazonpopulation geneticsmicrosatellitesbrazilian nutPopulation genetic variability of Brazil nut Bertholletia excelsa in the Madre de Dios region was determined by analyzing 11 microsatellites markers in a total of 108 trees. The global results showed a great allelic diversity (89 alleles, with a mean of 8.09 alleles per locus), at the localities level the highest allelic richness was found in Iberia (AR = 4.82) and the lowest in Itahuania (AR = 3.64), this the same localities were the only ones that presented an excess of heterozygotes. The results of the correspondence factor analysis (AFC) show a strong genetic overlap between most of the analyzed localities. The results of the Fixation Index (Fst) show that the localities of Iñapari and Iberia are more related to each other (Fst = 0.048), but slightly differentiated with the other localities (the values of Fst with the other localities varied between -0.001 to 0.193). The dendrogram based on the genetic distance of Nei (1978) shows that the 11 localities are forming three different genetic groupings, (A): Amigos, Pukiri, Itahuania and Manuripe; (B): Heath, Tambopata, Virgen del Carmen, Pariamanu, Iberia and Iñapari; and (C) made up only of the Alert locality. The groups within the clusters could be attributed to the few physical barriers between the localities within each cluster, while the differentiations between the clusters could be related to the presence of rivers between these groups, which could constitute insurmountable physical barriers to for gene flow between these clusters.Fue determinada la variabilidad genética poblacional de la castaña Bertholletia excelsa en la región de Madre de Dios, mediante el análisis de 11 marcadores microsatélites en un total de 108 árboles. Los resultados globales mostraron una gran diversidad alélica (89 alelos, con una media de 8.09 alelos por locus), a nivel poblacional la mayor riqueza alélica fue encontrada en Iberia (AR = 4.82) y la menor en Itahuania (AR = 3.64), estas mismas localidades fueron las únicas que presentaron exceso de heterocigotos. Los resultados del análisis factorial de correspondencia (AFC) muestra una fuerte sobreposición genética entre la mayoría de las localidades analizadas. Los resultados del índice de Fijación (Fst) muestra que las localidades de Iñapari y Iberia están más relacionadas entre sí (Fst = 0.048), pero ligeramente diferenciadas con las demás localidades (los valores de Fst con las demás poblaciones variaron entre -0.001 a 0.193). El dendrograma basado en la distancia genética de Nei (1978) muestra que las 11 localidades se encuentran conformando tres agrupaciones genéticas diferentes, (A): Amigos, Pukiri, Itahuania y Manuripe; (B): Heath, Tambopata, Virgen del Carmen, Pariamanu, Iberia e Iñapari; y (C) conformada solo por la localidad de Alerta. Las agrupaciones dentro de los clusters podrían ser atribuidos a las escasas barreras físicas entre las localidades dentro de cada cluster, en tanto que las diferenciaciones entre los clusters podrían estar relacionado a la presencia de ríos entre estas agrupaciones, los cuales podrían constituir barreras físicas infranqueables para el flujo de genes entre estas agrupaciones.Instituto de Investigaciones de la Amazonia Peruana2022-10-18info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionArticlesArtículosapplication/pdfhttps://revistas.iiap.gob.pe/index.php/foliaamazonica/article/view/60610.24841/fa.v30i2.606Folia Amazonica; Vol. 30 No. 2 (2021); 217-233Folia Amazónica; Vol. 30 Núm. 2 (2021); 217-233Folia Amazónica; v. 30 n. 2 (2021); 217-2332410-11841018-567410.24841/fa.v30i2reponame:Folia Amazónicainstname:Instituto de investigaciones de la Amazonía Peruanainstacron:IIAPspahttps://revistas.iiap.gob.pe/index.php/foliaamazonica/article/view/606/592Derechos de autor 2021 Hugo PANDURO, Ronald CORVERA-GOMRINGER, Diana CASTRO-RUIZ, Jean-François RENNO, Dennis del CASTILLO-TORRES, Mildred GARCÍA, Edgar CUSI, Tedi PACHECO-GÓMEZ, Carlos ANGULO, Jhon ALVARADO, Carmen GARCIA-DAVILAinfo:eu-repo/semantics/openAccessoai:ojs.pkp.sfu.ca:article/6062023-01-09T17:21:01Z |
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