Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos

Descripción del Articulo

Evalúa patrones biogeográficos entre las subcuencas hidrográficas del Amazonas mediante el análisis de secuencias obtenidas en bases de datos de código de barras de DNA. Se recopiló información geográfica de HydroSHEDS (www.hydrosheds.org) y datos genéticos (BINs) de BOLD Systems (www.boldsystems.or...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Bedoya Benites, Kiefer Andre
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2024
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/22980
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12672/22980
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Amazonas
Biodiversidad
Peces
Lenguajes de programación
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
id UNMS_57a15c28f6433de6e4ec5ad325bd36b9
oai_identifier_str oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/22980
network_acronym_str UNMS
network_name_str UNMSM-Tesis
repository_id_str 410
dc.title.none.fl_str_mv Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
title Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
spellingShingle Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
Bedoya Benites, Kiefer Andre
Amazonas
Biodiversidad
Peces
Lenguajes de programación
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
title_short Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
title_full Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
title_fullStr Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
title_full_unstemmed Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
title_sort Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
author Bedoya Benites, Kiefer Andre
author_facet Bedoya Benites, Kiefer Andre
author_role author
dc.contributor.advisor.fl_str_mv Ramirez Malaver, Jorge Luis
dc.contributor.author.fl_str_mv Bedoya Benites, Kiefer Andre
dc.subject.none.fl_str_mv Amazonas
Biodiversidad
Peces
Lenguajes de programación
topic Amazonas
Biodiversidad
Peces
Lenguajes de programación
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
dc.subject.ocde.none.fl_str_mv https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
description Evalúa patrones biogeográficos entre las subcuencas hidrográficas del Amazonas mediante el análisis de secuencias obtenidas en bases de datos de código de barras de DNA. Se recopiló información geográfica de HydroSHEDS (www.hydrosheds.org) y datos genéticos (BINs) de BOLD Systems (www.boldsystems.org) de 13 órdenes de la clase Actinopterygii. Tras la obtención, filtrado, procesamiento y evaluación de los datos se ubicaron en total 645 BINs con 3373 secuencias, combinando el registro de coordenadas presentes en BOLD Systems y la revisión de más de 500 artículos científicos. Fueron propuestas tres métricas de distancias genéticas intraBIN como estimadores de la variabilidad de las subcuencas; mostrando menor divergencia en Negro y Tocantins y mayor en Tapajós y Trombetas. Adicionalmente, la comparación entre subcuencas distinguió dos agrupaciones que minimizan la divergencia interna: (1) Xingú y Tocantins y (2) Alto Amazonas, Negro, Madeira. Los resultados obtenidos son concordantes con investigaciones previas. Estas agrupaciones respaldan la hipótesis de una subdivisión este-oeste en la cuenca Amazónica desde un aspecto genético y con amplia cobertura taxonómica. La baja representación de BINs en ciertas subcuencas, causada por la presencia de información incompleta en BOLD, supuso un factor limitante. Por ello, se recomienda intensificar el trabajo en estas regiones para robustecer futuros análisis.
publishDate 2024
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-08-01T20:13:17Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2024-08-01T20:13:17Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2024
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
dc.identifier.citation.none.fl_str_mv Bedoya, K. (2024). Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos. [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12672/22980
identifier_str_mv Bedoya, K. (2024). Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos. [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.
url https://hdl.handle.net/20.500.12672/22980
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.fl_str_mv SUNEDU
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.publisher.country.none.fl_str_mv PE
publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:UNMSM-Tesis
instname:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
instacron:UNMSM
instname_str Universidad Nacional Mayor de San Marcos
instacron_str UNMSM
institution UNMSM
reponame_str UNMSM-Tesis
collection UNMSM-Tesis
bitstream.url.fl_str_mv https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f4e26f10-9f50-408b-a8a5-cf03190683ba/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/9f873b1b-73b1-47d9-856f-46ab89ecd520/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/cd1f8e6d-1e3d-4e7e-b00e-d02ab7ed7dfd/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/36fb9410-ad76-4e8d-9f29-b9eee779dad3/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/ef86b0e0-bb74-42f5-b326-b5cc936e142e/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/20f26351-3eec-4950-b776-f9af51ed3ebe/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/2b49ac9a-f732-4b77-bc96-2fd84d622e2d/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/436e8e6b-b9ab-45fd-824e-cc07294628ec/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/74c3963c-737e-4653-8d2d-7e7ba946db63/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f5b8baa3-2683-497c-81b8-7476c39566f3/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/5283fc10-69d2-4bd6-980b-54bf177eb626/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 9e0e3616cb3ce74ea8d128dde9b9b727
5f66462bdba4e4732b75e40b32875a51
d2780e012d5b62fd02f98df239ce3171
1f14487299a8a795dc379bc1df9968a0
bb9bdc0b3349e4284e09149f943790b4
8d7c3f2b3291f103be49466314ccaf24
ce3f68d35069767a5f852fea3123171e
931a265d47608cc4b171082dc17fbe23
a194764883bac7e0cfe66d85cebb79c1
77ad278242122a3447d2906f7e61ca64
a8088b5e5a37b8e219be0b0597fb6104
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Cybertesis UNMSM
repository.mail.fl_str_mv cybertesis@unmsm.edu.pe
_version_ 1847887821805715456
spelling Ramirez Malaver, Jorge LuisBedoya Benites, Kiefer Andre2024-08-01T20:13:17Z2024-08-01T20:13:17Z2024Bedoya, K. (2024). Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos. [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.https://hdl.handle.net/20.500.12672/22980Evalúa patrones biogeográficos entre las subcuencas hidrográficas del Amazonas mediante el análisis de secuencias obtenidas en bases de datos de código de barras de DNA. Se recopiló información geográfica de HydroSHEDS (www.hydrosheds.org) y datos genéticos (BINs) de BOLD Systems (www.boldsystems.org) de 13 órdenes de la clase Actinopterygii. Tras la obtención, filtrado, procesamiento y evaluación de los datos se ubicaron en total 645 BINs con 3373 secuencias, combinando el registro de coordenadas presentes en BOLD Systems y la revisión de más de 500 artículos científicos. Fueron propuestas tres métricas de distancias genéticas intraBIN como estimadores de la variabilidad de las subcuencas; mostrando menor divergencia en Negro y Tocantins y mayor en Tapajós y Trombetas. Adicionalmente, la comparación entre subcuencas distinguió dos agrupaciones que minimizan la divergencia interna: (1) Xingú y Tocantins y (2) Alto Amazonas, Negro, Madeira. Los resultados obtenidos son concordantes con investigaciones previas. Estas agrupaciones respaldan la hipótesis de una subdivisión este-oeste en la cuenca Amazónica desde un aspecto genético y con amplia cobertura taxonómica. La baja representación de BINs en ciertas subcuencas, causada por la presencia de información incompleta en BOLD, supuso un factor limitante. Por ello, se recomienda intensificar el trabajo en estas regiones para robustecer futuros análisis.application/pdfspaUniversidad Nacional Mayor de San MarcosPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/AmazonasBiodiversidadPecesLenguajes de programaciónhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datosinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisreponame:UNMSM-Tesisinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMSUNEDUBiólogo Genetista BiotecnólogoUniversidad Nacional Mayor De San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Escuela Profesional de Genética y BiotecnologíaGenética y biotecnología43352480https://orcid.org/0000-0001-8138-920370619360919036Siccha Ramirez, Zoila RaquelRomero Condori, Pedro EduardoGarcia Quispes, Wilser Andreshttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesionalhttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesisORIGINALBedoya_bk.pdfBedoya_bk.pdfapplication/pdf5448514https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f4e26f10-9f50-408b-a8a5-cf03190683ba/download9e0e3616cb3ce74ea8d128dde9b9b727MD51C1931_2024_Bedoya_bk_AUTORIZACION.pdfC1931_2024_Bedoya_bk_AUTORIZACION.pdfapplication/pdf123780https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/9f873b1b-73b1-47d9-856f-46ab89ecd520/download5f66462bdba4e4732b75e40b32875a51MD52C1931_2024_Bedoya_bk_REPORTE.pdfC1931_2024_Bedoya_bk_REPORTE.pdfapplication/pdf13472316https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/cd1f8e6d-1e3d-4e7e-b00e-d02ab7ed7dfd/downloadd2780e012d5b62fd02f98df239ce3171MD53CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8905https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/36fb9410-ad76-4e8d-9f29-b9eee779dad3/download1f14487299a8a795dc379bc1df9968a0MD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/ef86b0e0-bb74-42f5-b326-b5cc936e142e/downloadbb9bdc0b3349e4284e09149f943790b4MD55TEXTBedoya_bk.pdf.txtBedoya_bk.pdf.txtExtracted texttext/plain103487https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/20f26351-3eec-4950-b776-f9af51ed3ebe/download8d7c3f2b3291f103be49466314ccaf24MD56C1931_2024_Bedoya_bk_AUTORIZACION.pdf.txtC1931_2024_Bedoya_bk_AUTORIZACION.pdf.txtExtracted texttext/plain3920https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/2b49ac9a-f732-4b77-bc96-2fd84d622e2d/downloadce3f68d35069767a5f852fea3123171eMD58C1931_2024_Bedoya_bk_REPORTE.pdf.txtC1931_2024_Bedoya_bk_REPORTE.pdf.txtExtracted texttext/plain3733https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/436e8e6b-b9ab-45fd-824e-cc07294628ec/download931a265d47608cc4b171082dc17fbe23MD510THUMBNAILBedoya_bk.pdf.jpgBedoya_bk.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg15231https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/74c3963c-737e-4653-8d2d-7e7ba946db63/downloada194764883bac7e0cfe66d85cebb79c1MD57C1931_2024_Bedoya_bk_AUTORIZACION.pdf.jpgC1931_2024_Bedoya_bk_AUTORIZACION.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg20796https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f5b8baa3-2683-497c-81b8-7476c39566f3/download77ad278242122a3447d2906f7e61ca64MD59C1931_2024_Bedoya_bk_REPORTE.pdf.jpgC1931_2024_Bedoya_bk_REPORTE.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9146https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/5283fc10-69d2-4bd6-980b-54bf177eb626/downloada8088b5e5a37b8e219be0b0597fb6104MD51120.500.12672/22980oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/229802024-08-16 00:17:40.237http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://cybertesis.unmsm.edu.peCybertesis UNMSMcybertesis@unmsm.edu.peTk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0IG93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLCB0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZyB0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sIGluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yIHB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZSB0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQgdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uIGFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LCB5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZSBjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdCBzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkIHdpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRCBCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUgRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSCBDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMgbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=
score 13.058573
Patrones biogeográficos y diversidad genética de peces de agua dulce en subcuencas hidrográficas del Amazonas usando minería de datos
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).

Ejemplares Similares