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tesis de grado
Publicado 2024
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Evalúa patrones biogeográficos entre las subcuencas hidrográficas del Amazonas mediante el análisis de secuencias obtenidas en bases de datos de código de barras de DNA. Se recopiló información geográfica de HydroSHEDS (www.hydrosheds.org) y datos genéticos (BINs) de BOLD Systems (www.boldsystems.org) de 13 órdenes de la clase Actinopterygii. Tras la obtención, filtrado, procesamiento y evaluación de los datos se ubicaron en total 645 BINs con 3373 secuencias, combinando el registro de coordenadas presentes en BOLD Systems y la revisión de más de 500 artículos científicos. Fueron propuestas tres métricas de distancias genéticas intraBIN como estimadores de la variabilidad de las subcuencas; mostrando menor divergencia en Negro y Tocantins y mayor en Tapajós y Trombetas. Adicionalmente, la comparación entre subcuencas distinguió dos agrupaciones que minimizan la diver...
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tesis de grado
Publicado 2023
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Construye una herramienta que sirva como complemento de las diferentes prácticas experimentales relacionadas con la aplicación de la técnica 16S rRNA PCR-RFLP para su uso en investigación y educación virtual (eLearning). El método de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) del gen 16S rRNA permite la identificación bacteriana utilizando enzimas de restricción que generen patrones de bandas únicos por especie. Por otra parte, el desarrollo de simuladores de técnicas experimentales y laboratorios virtuales ha adquirido una mayor relevancia debido al cierre de muchos laboratorios provocado por el confinamiento a raíz de la pandemia de COVID-19. RFLP-inator (https://kieferbedoya.shinyapps.io/RFLP-inator/) fue desarrollada con el lenguaje de programación R y el paquete Shiny para la elaboración de una interfaz web. La herramienta de software permite la simu...