Insights from the genome of a high alkaline cellulase producing Aspergillus fumigatus strain obtained from Peruvian Amazon rainforest
Descripción del Articulo
Here, we report the complete genome sequence of a high alkaline cellulase producing Aspergillus fumigatus strain LMB-35Aa isolated from soil of Peruvian Amazon rainforest. The genome is ∼27.5 mb in size, comprises of 228 scaffolds with an average GC content of 50%, and is predicted to contain a tota...
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| Formato: | artículo |
| Fecha de Publicación: | 2017 |
| Institución: | Consejo Nacional de Ciencia Tecnología e Innovación |
| Repositorio: | CONCYTEC-Institucional |
| Lenguaje: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.concytec.gob.pe:20.500.12390/663 |
| Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12390/663 https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2017.04.010 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Soils Aspergillus Genetic engineering Scaffolds (biology) Amazon rain forest Aspergillus fumigatus CAZymes Lignocellulolytic enzymes https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.00 |
| Sumario: | Here, we report the complete genome sequence of a high alkaline cellulase producing Aspergillus fumigatus strain LMB-35Aa isolated from soil of Peruvian Amazon rainforest. The genome is ∼27.5 mb in size, comprises of 228 scaffolds with an average GC content of 50%, and is predicted to contain a total of 8660 protein-coding genes. Of which, 6156 are with known function; it codes for 607 putative CAZymes families potentially involved in carbohydrate metabolism. Several important cellulose degrading genes, such as endoglucanase A, endoglucanase B, endoglucanase D and beta-glucosidase, are also identified. The genome of A. fumigatus strain LMB-35Aa represents the first whole sequenced genome of non-clinical, high cellulase producing A. fumigatus strain isolated from forest soil. |
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Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
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