Rendimiento diagnóstico de dos métodos moleculares para la detección de SARS- CoV -2 en un Laboratorio Privado del Perú durante 2022

Descripción del Articulo

Antecedentes: La pandemia ocasionada por el COVID-19, ha causado graves repercusiones en la salud pública. Los métodos basados en la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR), son ahora el estándar de oro para la detección del SARS-CoV-2. Por ello, la importancia de prue...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: Cochachin Luna, Susett Anahi, Melendez Villalobos, Paola Lucia
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2023
Institución:Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas
Repositorio:UPC-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorioacademico.upc.edu.pe:10757/668876
Enlace del recurso:http://hdl.handle.net/10757/668876
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Diagnóstico molecular
SARS-Cov-2
PCR en tiempo real
Pruebas comerciales
Eficacia diagnóstica
COVID-19
Molecular diagnosis
Real-Time PCR
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description Antecedentes: La pandemia ocasionada por el COVID-19, ha causado graves repercusiones en la salud pública. Los métodos basados en la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR), son ahora el estándar de oro para la detección del SARS-CoV-2. Por ello, la importancia de pruebas con mayor facilidad de uso, más rápidas y un adecuado rendimiento. Objetivo: Determinar el rendimiento diagnóstico de las pruebas Logix smart ™ Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) y WGene SARS -CoV -2 para la detección del virus SARS -CoV -2  en comparación con la prueba RT PCR Cobas® SARS-CoV-2. Métodos: Estudio de prueba diagnóstica que incluyó 180 remanentes de muestra de hisopado nasofaríngeo de pacientes del Laboratorio Clínico Privado ROE. Las muestras fueron analizadas por la RT-PCR Cobas® SARS -CoV-2 y las pruebas Logix smart ™ Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) y WGene SARS -CoV -2.  Resultados: La sensibilidad y la especificidad para la detección del virus SARS -CoV -2 fue mayor al 95% para ambas pruebas. La especificidad de la prueba WGene SARS -CoV -2 fue del 100%. El nivel de concordancia obtenido por el índice de Kappa para ambas plataformas fue de 0.94. Conclusiones: Las pruebas Logix smart ™ Coronavirus Disease 2019 y WGene SARS -CoV -2 permiten la detección del virus SARS -CoV -2 con una sensibilidad y especificidad adecuadas; por lo que, se recomienda un estudio comparativo posterior con otras pruebas de alto rendimiento. 
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Métodos: Estudio de prueba diagnóstica que incluyó 180 remanentes de muestra de hisopado nasofaríngeo de pacientes del Laboratorio Clínico Privado ROE. Las muestras fueron analizadas por la RT-PCR Cobas® SARS -CoV-2 y las pruebas Logix smart ™ Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) y WGene SARS -CoV -2.  Resultados: La sensibilidad y la especificidad para la detección del virus SARS -CoV -2 fue mayor al 95% para ambas pruebas. La especificidad de la prueba WGene SARS -CoV -2 fue del 100%. El nivel de concordancia obtenido por el índice de Kappa para ambas plataformas fue de 0.94. Conclusiones: Las pruebas Logix smart ™ Coronavirus Disease 2019 y WGene SARS -CoV -2 permiten la detección del virus SARS -CoV -2 con una sensibilidad y especificidad adecuadas; por lo que, se recomienda un estudio comparativo posterior con otras pruebas de alto rendimiento. Background: The pandemic caused by COVID-19 has had a serious impact on public health. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) methods are now the gold standard for SARS-CoV-2 detection. Therefore, the importance of new tests with greater ease of use, faster and adequate performance. Objective: To determine the diagnostic performance of the Logix smart Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) and WGene SARS -CoV -2 tests for the detection of SARS -CoV -2 compared to the RT-PCR Cobas® SARS -CoV-2 test.  Methods: Diagnostic test study that included 180 remaining nasopharyngeal swab samples from ROE Private Clinical Laboratory patients. The samples were analyzed by the RT-PCR Cobas‍ SARS -CoV-2 and the tests Logix smart ‍Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) and WGene SARS -CoV -2.  Results: The sensitivity and specificity for the detection of the SARS-CoV-2 virus was greater than 95% for both tests. The specificity of the WGene SARS -CoV -2 test was 100%. The level of agreement obtained by the Kappa index for both platforms was almost perfect. Conclusions: The Logix smart Coronavirus Disease 2019 and WGene SARS -CoV -2 tests allow the detection of SARS -CoV -2 virus with adequate sensitivity and specificity; therefore, a further comparative study with other high-performance tests is recommended.TesisODS 3: Salud y bienestarODS 9: Industria, innovación e infraestructuraODS 4: Educación de calidadapplication/pdfapplication/epubapplication/mswordspaUniversidad Peruana de Ciencias Aplicadas (UPC)PEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas (UPC)Repositorio Académico - UPCreponame:UPC-Institucionalinstname:Universidad Peruana de Ciencias Aplicadasinstacron:UPCDiagnóstico molecularSARS-Cov-2PCR en tiempo realPruebas comercialesEficacia diagnósticaCOVID-19Molecular diagnosisReal-Time PCRCommercial kitsDiagnostic efficacyhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.00https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.00.00Rendimiento diagnóstico de dos métodos moleculares para la detección de SARS- CoV -2 en un Laboratorio Privado del Perú durante 2022Diagnostic performance of two molecular methods for the detection of SARS-CoV -2 in a Private Laboratory in Peru during 2022info:eu-repo/semantics/bachelorThesisTesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fSUNEDUUniversidad Peruana de Ciencias Aplicadas (UPC). Facultad de Ciencias de la SaludLicenciaturaMedicinaMédico cirujano2023-10-04T21:37:57Zhttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://orcid.org/0000-0002-5068-098640852288https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional912016Del Valle Mendoza, JuanaSilva Caso, WilmerMarzal Melendez, Miguel7317434176276407CONVERTED2_3880653Meléndez_VP.pdfMeléndez_VP.pdfapplication/pdf357726https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/17/Mel%c3%a9ndez_VP.pdf7e79f0a92dee842a60ca0fa934a183e0MD517falseCONVERTED2_3831577THUMBNAILMeléndez_VP_Fichaautorizacion.pdf.jpgMeléndez_VP_Fichaautorizacion.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg28312https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/9/Mel%c3%a9ndez_VP_Fichaautorizacion.pdf.jpg089933cccd555ed9cef421b797b6b1a3MD59falseMeléndez_VP_Reportesimilitud.pdf.jpgMeléndez_VP_Reportesimilitud.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg41401https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/11/Mel%c3%a9ndez_VP_Reportesimilitud.pdf.jpga180b1bac85bbd3b6643311656314831MD511falseMeléndez_VP_Actasimilitud.pdf.jpgMeléndez_VP_Actasimilitud.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg41345https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/13/Mel%c3%a9ndez_VP_Actasimilitud.pdf.jpge82cd778b2464a3493462846aa0905abMD513falseMeléndez_VP.pdf.jpgMeléndez_VP.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg29814https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/16/Mel%c3%a9ndez_VP.pdf.jpga103757fdd998db6e92d06e08de38b07MD516falseTEXTMeléndez_VP.pdf.txtMeléndez_VP.pdf.txtExtracted texttext/plain52032https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/6/Mel%c3%a9ndez_VP.pdf.txt26e1ec7021c570927bbe0517ac16e4a3MD56falseMeléndez_VP_Fichaautorizacion.pdf.txtMeléndez_VP_Fichaautorizacion.pdf.txtExtracted texttext/plain2742https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/8/Mel%c3%a9ndez_VP_Fichaautorizacion.pdf.txtbaaa80aae2cec29370eafa027d10903fMD58falseMeléndez_VP_Reportesimilitud.pdf.txtMeléndez_VP_Reportesimilitud.pdf.txtExtracted texttext/plain2234https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/10/Mel%c3%a9ndez_VP_Reportesimilitud.pdf.txt6be73637bb1c3bb1eb96c9bda6780c1aMD510falseMeléndez_VP_Actasimilitud.pdf.txtMeléndez_VP_Actasimilitud.pdf.txtExtracted texttext/plain1236https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/12/Mel%c3%a9ndez_VP_Actasimilitud.pdf.txt919b42525b4dc1b7494921d774654863MD512falseORIGINALMeléndez_VP.pdfMeléndez_VP.pdfapplication/pdf548736https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/14/Mel%c3%a9ndez_VP.pdf2729957a2b012d512de502a0e5ae3ad5MD514trueMeléndez_VP.docxMeléndez_VP.docxapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document304342https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/15/Mel%c3%a9ndez_VP.docxcdd0cde45be0e4b8317fe4d0268fbdbfMD515falseMeléndez_VP_Fichaautorizacion.pdfMeléndez_VP_Fichaautorizacion.pdfapplication/pdf288022https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/3/Mel%c3%a9ndez_VP_Fichaautorizacion.pdfaada759d64de16f550859730a3278cc3MD53falseMeléndez_VP_Reportesimilitud.pdfMeléndez_VP_Reportesimilitud.pdfapplication/pdf4084835https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/4/Mel%c3%a9ndez_VP_Reportesimilitud.pdfc649812a3f69b6c16a7a9b06adf25708MD54falseMeléndez_VP_Actasimilitud.pdfMeléndez_VP_Actasimilitud.pdfapplication/pdf119637https://repositorioacademico.upc.edu.pe/bitstream/10757/668876/5/Mel%c3%a9ndez_VP_Actasimilitud.pdf82b5e3927a2e893669b89c64c96055ddMD55false10757/668876oai:repositorioacademico.upc.edu.pe:10757/6688762025-08-18 17:45:07.005Repositorio académico upcupc@openrepository.com
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