In Silico Characterization of the RCC1 Family and the UVR8 Gene in Chenopodium quinoa Willd

• Autor: Paredes Malca, Jean Carlo
• Formato: tesis de grado
• Fecha de Publicación: 2025
• Institución: Universidad Nacional de San Agustín
• Repositorio: UNSA-Institucional
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:repositorio.unsa.edu.pe:20.500.12773/21720
• Enlace del recurso: https://hdl.handle.net/20.500.12773/21720
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: Chenopodium quinoa; RCC1; UVR8; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16

La quinua (Chenopodium quinoa Willd.), un cultivo andino con un valor nutricional excepcional, prospera en ecosistemas expuestos a una intensa radiación ultravioleta B (UV-B); sin embargo, los mecanismos moleculares que subyacen a su fotorrecepción siguen siendo en gran medida desconocidos. La proteína del locus 8 de resistencia a los rayos UV (UVR8), miembro de la familia del regulador de la condensación cromosómica 1 (RCC1), es el principal fotorreceptor de los rayos UV-B en las plantas. Aquí presentamos la primera caracterización in silico de la familia de genes RCC1 en C. quinoa, con el objetivo de identificar y analizar estructuralmente los homólogos de UVR8. El análisis genómico reveló 40 genes CqRCC1, que exhiben una gran diversidad estructural. La reconstrucción filogenética identificó dos proteínas, CqRCC1_20 y CqRCC1_23, como los homólogos más cercanos de AtUVR8 de Arabidopsis thaliana. El modelado de homología reveló que CqRCC1_20 mantiene la arquitectura canónica de siete palas en forma de hélice β de UVR8, mientras que CqRCC1_23 presenta una deleción que da lugar a una estructura de seis palas. Ambas isoformas conservan los residuos críticos de triptófano (W233, W285, W337) y el motivo C-terminal valina-prolina (VP) necesario para la fotopercepción y la interacción con la fotomorfógena constitutiva 1 (COP1). Cabe destacar que el modelo CqRCC1_23 predice menos enlaces de hidrógeno en la interfaz del dímero y alteraciones estructurales en sitios clave de interacción reguladora. En conjunto, estos resultados indican que la quinua alberga isoformas UVR8 funcionalmente conservadas con divergencia estructural, como CqRCC1_23, que pueden influir en la estabilidad de los fotorreceptores y permitir una respuesta UV-B sostenida, lo que podría conferir una ventaja adaptativa en entornos con alta radiación.