Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú

Descripción del Articulo

Permite la diseminación de bacterias multidrogorresistentes (MDR). Los integrones incorporan cassette de genes de resistencia garantizando su expresión. Este estudio describe la resistencia antimicrobiana, detecta y caracteriza los integrones de clase 1 y 2 en aislados de Escherichia coli provenient...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Riveros Ramirez, Maribel Denise
Formato: tesis de maestría
Fecha de Publicación:2019
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/15508
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12672/15508
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Escherichia coli
Bacteriología - Cultivos y medios de cultivo
Bacterias patógenas - Identificación
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
id UNMS_869060e46a91dbb7722a2818d38beef6
oai_identifier_str oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/15508
network_acronym_str UNMS
network_name_str UNMSM-Tesis
repository_id_str 410
dc.title.none.fl_str_mv Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
title Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
spellingShingle Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
Riveros Ramirez, Maribel Denise
Escherichia coli
Bacteriología - Cultivos y medios de cultivo
Bacterias patógenas - Identificación
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
title_short Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
title_full Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
title_fullStr Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
title_full_unstemmed Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
title_sort Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú
author Riveros Ramirez, Maribel Denise
author_facet Riveros Ramirez, Maribel Denise
author_role author
dc.contributor.advisor.fl_str_mv García de la Guarda, Ruth Hortensia
Ochoa Woodell, Theresa Jean
dc.contributor.author.fl_str_mv Riveros Ramirez, Maribel Denise
dc.subject.none.fl_str_mv Escherichia coli
Bacteriología - Cultivos y medios de cultivo
Bacterias patógenas - Identificación
topic Escherichia coli
Bacteriología - Cultivos y medios de cultivo
Bacterias patógenas - Identificación
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
dc.subject.ocde.none.fl_str_mv https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
description Permite la diseminación de bacterias multidrogorresistentes (MDR). Los integrones incorporan cassette de genes de resistencia garantizando su expresión. Este estudio describe la resistencia antimicrobiana, detecta y caracteriza los integrones de clase 1 y 2 en aislados de Escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia. Para ello, se obtuvieron 355 aislados de E. coli de diarrea y bacteremia de pacientes pediátricos de dos estudios previos recolectados aleatoriamente: 129 E. coli enteropatogénica (EPEC), 90 E. coli enteroagregativa (EAEC), 66 E. coli enterotoxigénica (ETEC) y 70 E. coli de bacteremia. La presencia de genes de integrasa (intI) e integrones de clase 1 (IntI1) y 2 (IntI2) fue detectada mediante la reacción en cadena de polimerasa, los cassettes génicos fueron caracterizados por RFLP y secuenciamiento. Los integrones solo de clase 1 fueron más frecuentes y asociados significativamente con los aislados de bacteremia 31 % (22/70), en E. coli diarreogénicas, EAEC fue la más frecuente con 24% (22/90), seguido de EPEC con 9% (11/129) y ETEC con 6% (4/66). La presencia de solo integrasa 2 fue similar en EPEC 4% (5/129), EAEC 3% (3/90) y bacteremia 6% (4/70). Solo ETEC presentó un aislado con ambos tipos de integrones. En total se detectaron 15 cassettes génicos, 12 de clase 1 y 3 de clase 2, que confieren resistencia a los aminoglucósidos (aadA1, aadA2, aadA5), a gentamicina / tobramicina / kanamicina (aadB), a trimetoprima (dfrA1, dfrA5, dfrA7, dfrA12, dfrA15, dfrA17), a cloranfenicol (catB3) y 1 ORF (marco de lectura abierta). Solo en integrones de clase 2 se identificaron tres cassettes génicos de estreptotricina acetiltransferasa (sat 1, 2 y 3) que confieren resistencia a la estreptotricina. La mayoría de aislados con integrones 1 y 2 fueron mutiresistentes. Aislados de bacteremia con integrones de tipo 1 presentaron β-Lactamasas de Espectro Extendido en 59% (13/33). Por lo tanto E. coli provenientes de heces y sangre en niños peruanos presentan multiresistencia y albergan integrones de clase 1 y 2 con una variedad de genes cassette.
publishDate 2019
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2020-11-24T15:11:47Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2020-11-24T15:11:47Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2019
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
dc.identifier.citation.none.fl_str_mv Riveros, M. (2019). Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú. Tesis para optar el grado de Magíster en Biología Molecular. Unidad de Posgrado, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú.
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12672/15508
identifier_str_mv Riveros, M. (2019). Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú. Tesis para optar el grado de Magíster en Biología Molecular. Unidad de Posgrado, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú.
url https://hdl.handle.net/20.500.12672/15508
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.fl_str_mv SUNEDU
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.none.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.publisher.country.none.fl_str_mv PE
publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.source.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio de Tesis - UNMSM
reponame:UNMSM-Tesis
instname:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
instacron:UNMSM
instname_str Universidad Nacional Mayor de San Marcos
instacron_str UNMSM
institution UNMSM
reponame_str UNMSM-Tesis
collection UNMSM-Tesis
bitstream.url.fl_str_mv https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f97b6b6b-cc0b-4636-b3b3-47f8d55dd6ff/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/31bdd620-a6c7-4242-87f7-e452d12d3b15/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/dbeed7f2-946f-4249-ba11-0f2f07c926ae/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/e05bc4af-49aa-49b4-99de-e180ff616a83/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 106914ecc9a527632e8d3c7d53bd0684
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
f660770466ca23122780d280726d5f71
50d47f9527cbf627921e1c74de528bd1
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Cybertesis UNMSM
repository.mail.fl_str_mv cybertesis@unmsm.edu.pe
_version_ 1846618155536875520
spelling García de la Guarda, Ruth HortensiaOchoa Woodell, Theresa JeanRiveros Ramirez, Maribel Denise2020-11-24T15:11:47Z2020-11-24T15:11:47Z2019Riveros, M. (2019). Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perú. Tesis para optar el grado de Magíster en Biología Molecular. Unidad de Posgrado, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú.https://hdl.handle.net/20.500.12672/15508Permite la diseminación de bacterias multidrogorresistentes (MDR). Los integrones incorporan cassette de genes de resistencia garantizando su expresión. Este estudio describe la resistencia antimicrobiana, detecta y caracteriza los integrones de clase 1 y 2 en aislados de Escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia. Para ello, se obtuvieron 355 aislados de E. coli de diarrea y bacteremia de pacientes pediátricos de dos estudios previos recolectados aleatoriamente: 129 E. coli enteropatogénica (EPEC), 90 E. coli enteroagregativa (EAEC), 66 E. coli enterotoxigénica (ETEC) y 70 E. coli de bacteremia. La presencia de genes de integrasa (intI) e integrones de clase 1 (IntI1) y 2 (IntI2) fue detectada mediante la reacción en cadena de polimerasa, los cassettes génicos fueron caracterizados por RFLP y secuenciamiento. Los integrones solo de clase 1 fueron más frecuentes y asociados significativamente con los aislados de bacteremia 31 % (22/70), en E. coli diarreogénicas, EAEC fue la más frecuente con 24% (22/90), seguido de EPEC con 9% (11/129) y ETEC con 6% (4/66). La presencia de solo integrasa 2 fue similar en EPEC 4% (5/129), EAEC 3% (3/90) y bacteremia 6% (4/70). Solo ETEC presentó un aislado con ambos tipos de integrones. En total se detectaron 15 cassettes génicos, 12 de clase 1 y 3 de clase 2, que confieren resistencia a los aminoglucósidos (aadA1, aadA2, aadA5), a gentamicina / tobramicina / kanamicina (aadB), a trimetoprima (dfrA1, dfrA5, dfrA7, dfrA12, dfrA15, dfrA17), a cloranfenicol (catB3) y 1 ORF (marco de lectura abierta). Solo en integrones de clase 2 se identificaron tres cassettes génicos de estreptotricina acetiltransferasa (sat 1, 2 y 3) que confieren resistencia a la estreptotricina. La mayoría de aislados con integrones 1 y 2 fueron mutiresistentes. Aislados de bacteremia con integrones de tipo 1 presentaron β-Lactamasas de Espectro Extendido en 59% (13/33). Por lo tanto E. coli provenientes de heces y sangre en niños peruanos presentan multiresistencia y albergan integrones de clase 1 y 2 con una variedad de genes cassette.TesisspaUniversidad Nacional Mayor de San MarcosPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Universidad Nacional Mayor de San MarcosRepositorio de Tesis - UNMSMreponame:UNMSM-Tesisinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMEscherichia coliBacteriología - Cultivos y medios de cultivoBacterias patógenas - Identificaciónhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03Identificación y caracterización de integrones asociados a la resistencia antimicrobiana, en aislados de escherichia coli provenientes de niños menores de dos años con diarrea y bacteremia de Lima, Perúinfo:eu-repo/semantics/masterThesisSUNEDUMagíster en Biología MolecularUniversidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Educación. Unidad de PosgradoMaestriaBiología Molecular0604108125304360https://orcid.org/0000-0003-4801-5642https://orcid.org/0000-0002-3227-3906Mujica Albán, Elydia CorneliaAlvarado Iparraguirre, Débora ElizabethCruz Pio, Liz Erikahttps://purl.org/pe-repo/renati/level#maestrohttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis077695670757692941509033ORIGINALRiveros_rm.pdfRiveros_rm.pdfapplication/pdf3658053https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f97b6b6b-cc0b-4636-b3b3-47f8d55dd6ff/download106914ecc9a527632e8d3c7d53bd0684MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/31bdd620-a6c7-4242-87f7-e452d12d3b15/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTRiveros_rm.pdf.txtRiveros_rm.pdf.txtExtracted texttext/plain102658https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/dbeed7f2-946f-4249-ba11-0f2f07c926ae/downloadf660770466ca23122780d280726d5f71MD55THUMBNAILRiveros_rm.pdf.jpgRiveros_rm.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg15854https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/e05bc4af-49aa-49b4-99de-e180ff616a83/download50d47f9527cbf627921e1c74de528bd1MD5620.500.12672/15508oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/155082024-08-16 02:21:44.453https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://cybertesis.unmsm.edu.peCybertesis UNMSMcybertesis@unmsm.edu.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
score 13.0768795
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).