Utilidad de la Citometría de Flujo par la detección de Pseudomonas aeruginosa productoras de metalo betalactamasas
Descripción del Articulo
ABSTRACT Considered one of the main opportunistic pathogens, Pseudomonas aeruginosa is the cause of a wide variety of nosocomial infections. Treatment is limited to certain classes of antibiotics, including carbapenems. Several phenotypic tests have been proposed for the screening of P. aeruginosa p...
Autor: | |
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Formato: | tesis de maestría |
Fecha de Publicación: | 2019 |
Institución: | Universidad Nacional de Trujillo |
Repositorio: | UNITRU-Tesis |
Lenguaje: | español |
OAI Identifier: | oai:dspace.unitru.edu.pe:20.500.14414/11503 |
Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.14414/11503 |
Nivel de acceso: | acceso abierto |
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ABSTRACT Considered one of the main opportunistic pathogens, Pseudomonas aeruginosa is the cause of a wide variety of nosocomial infections. Treatment is limited to certain classes of antibiotics, including carbapenems. Several phenotypic tests have been proposed for the screening of P. aeruginosa producing carbapenemases, which must be confirmed by molecular techniques and taking an average time of 55 hours between the collection for the culture and the delivery of the antibiogram report, being necessary to develop faster tests. In the present investigation, we seek to determine the usefulness of flow cytometry (CF) for the detection of P. aeruginosa producing metallo betalactamases (MBL) in two hours. We analyzed 35 isolates of P. aeruginosa characterized genotypically, with the Becton Dickinson Cell Viability Kit in the FACSCalibur instrument, using two treatments, one tube with Meropenem and the other Meropenem-EDTA, looking for an increase in fluorescence in the Meropenem-tube. EDTA We worked with 22 P. aeruginosa producers of MBL (18 with the blaIMP gene and 4 with the blaVIM gene) and 13 non-producers of MBL, genotypically confirmed. Using the ratio of fluorescence increase in non-living cells, T-student test showed significant difference between the producers of MBL and non-MBL (p: 0.002) and considering as a cut-off point a ratio greater than 1.6. Were detected 19/22 P. aeruginosa producers of MBL, giving 3 false negatives (2 blaIMP and 1 blaVIM) while 12/13 non-producers of MBL gave negative for CF, obtaining a false positive. Showing a sensitivity of 86.4%, a specificity of 92.3% and a positive predictive value (PPV) of 95%. Therefore, FC would constitute an alternative to phenotypically detect the production of metallo β lactamase in P. aeruginosa in 2 hours presumptively. |
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Saldaña Jiménez, José AntonioSalinas Salcedo, Iván Alexander2019-02-16T16:30:31Z2019-02-16T16:30:31Z2019https://hdl.handle.net/20.500.14414/11503ABSTRACT Considered one of the main opportunistic pathogens, Pseudomonas aeruginosa is the cause of a wide variety of nosocomial infections. Treatment is limited to certain classes of antibiotics, including carbapenems. Several phenotypic tests have been proposed for the screening of P. aeruginosa producing carbapenemases, which must be confirmed by molecular techniques and taking an average time of 55 hours between the collection for the culture and the delivery of the antibiogram report, being necessary to develop faster tests. In the present investigation, we seek to determine the usefulness of flow cytometry (CF) for the detection of P. aeruginosa producing metallo betalactamases (MBL) in two hours. We analyzed 35 isolates of P. aeruginosa characterized genotypically, with the Becton Dickinson Cell Viability Kit in the FACSCalibur instrument, using two treatments, one tube with Meropenem and the other Meropenem-EDTA, looking for an increase in fluorescence in the Meropenem-tube. EDTA We worked with 22 P. aeruginosa producers of MBL (18 with the blaIMP gene and 4 with the blaVIM gene) and 13 non-producers of MBL, genotypically confirmed. Using the ratio of fluorescence increase in non-living cells, T-student test showed significant difference between the producers of MBL and non-MBL (p: 0.002) and considering as a cut-off point a ratio greater than 1.6. Were detected 19/22 P. aeruginosa producers of MBL, giving 3 false negatives (2 blaIMP and 1 blaVIM) while 12/13 non-producers of MBL gave negative for CF, obtaining a false positive. Showing a sensitivity of 86.4%, a specificity of 92.3% and a positive predictive value (PPV) of 95%. Therefore, FC would constitute an alternative to phenotypically detect the production of metallo β lactamase in P. aeruginosa in 2 hours presumptively.RESUMEN Considerado uno de los principales patógenos oportunistas, Pseudomonas aeruginosa es la causante de una amplia variedad de infecciones nosocomiales. El tratamiento se encuentra limitado a ciertas clases de antibióticos, entre estos los carbapenemas. Diversas pruebas fenotípicas han sido propuestas para el tamizaje de P. aeruginosa productoras de carbapenemasas, debiendo ser confirmados por técnicas de biología molecular y tomando un tiempo promedio 55 horas entre la recolección para el cultivo y la entrega del reporte del antibiograma, siendo necesario desarrollar pruebas rápidas. En la presente investigación se busca determinar la utilidad de la citometría de flujo (CF) para la detección de P. aeruginosa productoras de metalo betalactamasas (MBL) en dos horas. Se analizó 35 aislamientos de P. aeruginosa caracterizados genotípicamente, con el Kit de Viabilidad Celular de Becton Dickinson en el equipo FACSCalibur, usando dos tratamientos, un tubo con Meropenem y el otro Meropenem-EDTA, buscando un aumento de fluorescencia en el tubo Meropenem-EDTA. Se trabajó con 22 P. aeruginosa productoras de MBL (18 con el gen blaIMP y 4 con el gen blaVIM) y 13 no productoras de MBL, confirmadas genotípicamente. Usando la razón de aumento de fluorescencia en las células no vivas, la T-student demostró diferencia significativa entre las productoras de MBL y las no MBL (p: 0.002) y considerando como punto de corte una razón mayor a 1.6. Se detectó 19/22 P. aeruginosa productoras de MBL, dando 3 falsos negativos (2 blaIMP y 1 blaVIM) mientras 12/13 no productoras de MBL dieron negativas por CF, obteniendo un falso positivo. Mostrando una sensibilidad de 86,4%, una especificidad de 92,3% y un valor predictivo positivo (VPP) de 95%. Por lo tanto, la CF constituiría una alternativa para detectar fenotípicamente la producción de metalo β lactamasa en P. aeruginosa en 2 horas de manera presuntiva.TesisspaUniversidad Nacional de Trujilloinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/Universidad Nacional de TrujilloRepositorio institucional - UNITRUreponame:UNITRU-Tesisinstname:Universidad Nacional de Trujilloinstacron:UNITRUPseudomonas aeruginosaMetalo betalactamasasCitometría de flujoUtilidad de la Citometría de Flujo par la detección de Pseudomonas aeruginosa productoras de metalo betalactamasasinfo:eu-repo/semantics/masterThesisSUNEDUMaestríaMaestro en CienciasMaestría en Ciencias mención Microbiología ClínicaUniversidad Nacional de Trujillo. 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