Vigilancia molecular de los parásitos de la malaria en comunidades remotas de la Amazonia peruana
Descripción del Articulo
Las comunidades remotas representan el último paso para eliminar malaria en Perú, pero la información sobre la transmisión es escasa. En este trabajo, se investigó la dinámica de transmisión y marcadores de resistencia en Plasmodium vivax (Pv) y P. falciparum (Pf) y deleciones en los genes pfhrp2/3...
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | tesis doctoral |
| Fecha de Publicación: | 2024 |
| Institución: | Universidad Peruana Cayetano Heredia |
| Repositorio: | UPCH-Institucional |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/15557 |
| Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12866/15557 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Población Indígena Ensayo AmpliSeq Dinámica de Transmisión Resistencia Antimaláricos Deleción pfhrp2/3 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.06 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.07 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08 |
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Vigilancia molecular de los parásitos de la malaria en comunidades remotas de la Amazonia peruana Cabrera Sosa, Luis Esteban Población Indígena Ensayo AmpliSeq Dinámica de Transmisión Resistencia Antimaláricos Deleción pfhrp2/3 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.06 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.07 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08 |
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Las comunidades remotas representan el último paso para eliminar malaria en Perú, pero la información sobre la transmisión es escasa. En este trabajo, se investigó la dinámica de transmisión y marcadores de resistencia en Plasmodium vivax (Pv) y P. falciparum (Pf) y deleciones en los genes pfhrp2/3 en Nueva Jerusalén (NJ), una comunidad indígena de Loreto. Para ello, se analizaron muestras de NJ (2019 – 2020, Pv = 68, Pf = 58) mediante los ensayos AmpliSeq. Además, se compararon NJ con otras áreas remotas, y el desempeño del ensayo AmpliSeq con otros métodos como microsatélites y PCR. La población de Pv de NJ mostró una diversidad moderada (He = 0.27) sin diferencias en el tiempo, mientras que la población de Pf mostró una baja diversidad (He = 0.08) y formaron clústeres temporales, uno relacionado con un brote en febrero de 2020. Además, los parásitos Pv de NJ estaban poco y altamente diferenciados de las muestras de Mazán y Yavari, respectivamente (Fst = 0.07 – 0.52). En cambio, Pf en NJ mostró una diferenciación moderada y cierta conectividad con los parásitos de Andoas, Santa Emilia y Mazán (Fst = 0.11 – 0.58). Los parásitos Pf tuvieron mutaciones de resistencia a cloroquina (57%) y sulfadoxina-pirimetamina (35 – 67%), pero ninguna a artemisinina. Además, los genes pfhrp2/3 estaban presentes (50 – 68%) en la mayoría de áreas. Por otro lado, el ensayo AmpliSeq tuvo una mejor resolución que los microsatélites para Pf y similar para Pv, pero no fue concordante con la PCR para la genotipificación de pfhrp2/3. Nuestro estudio muestra una dinámica de transmisión heterogénea y particular de la malaria en NJ y otras áreas alejadas, lo que lleva a proponer estrategias específicas. Los ensayos AmpliSeq representan una herramienta válida para la vigilancia molecular y podría servir para brindar evidencia que contribuya a la toma de decisiones hacia la eliminación de la malaria en Perú. |
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La población de Pv de NJ mostró una diversidad moderada (He = 0.27) sin diferencias en el tiempo, mientras que la población de Pf mostró una baja diversidad (He = 0.08) y formaron clústeres temporales, uno relacionado con un brote en febrero de 2020. Además, los parásitos Pv de NJ estaban poco y altamente diferenciados de las muestras de Mazán y Yavari, respectivamente (Fst = 0.07 – 0.52). En cambio, Pf en NJ mostró una diferenciación moderada y cierta conectividad con los parásitos de Andoas, Santa Emilia y Mazán (Fst = 0.11 – 0.58). Los parásitos Pf tuvieron mutaciones de resistencia a cloroquina (57%) y sulfadoxina-pirimetamina (35 – 67%), pero ninguna a artemisinina. Además, los genes pfhrp2/3 estaban presentes (50 – 68%) en la mayoría de áreas. Por otro lado, el ensayo AmpliSeq tuvo una mejor resolución que los microsatélites para Pf y similar para Pv, pero no fue concordante con la PCR para la genotipificación de pfhrp2/3. Nuestro estudio muestra una dinámica de transmisión heterogénea y particular de la malaria en NJ y otras áreas alejadas, lo que lleva a proponer estrategias específicas. Los ensayos AmpliSeq representan una herramienta válida para la vigilancia molecular y podría servir para brindar evidencia que contribuya a la toma de decisiones hacia la eliminación de la malaria en Perú.Hard-to-reach communities represent the last challenge for malaria elimination in Peru, but information about transmission is scarce. In this study, we investigated the Plasmodium vivax (Pv) and P. falciparum (Pf) populations in Nueva Jerusalén (NJ), an indigenous community in the Peruvian Amazon, regarding transmission dynamics, resistance markers, and Pf hrp2/3 deletions. We analyzed NJ samples (2019 – 2020, Pv = 68, Pf = 58) using the AmpliSeq assays. Additionally, we compared NJ isolates to other remotes areas, and the assay performance to other methods such as microsatellites and PCR. NJ’s Pv population had modest genetic diversity (He = 0.27) with no differences during the study time, while Pf population displayed low diversity (He = 0.08) and formed temporal clusters, one linked to an outbreak in February 2020. Additionally, NJ's Pv parasites were little and highly differentiated from Mazan and Yavari isolates, respectively (Fst = 0.07 – 0.52). In contrast, Pf in NJ showed modest differentiation and some connectivity with Andoas, Santa Emilia and Mazan parasites (Fst = 0.11 – 0.58). Pf parasites carried resistance mutations to chloroquine (57%) and sulfadoxine-pyrimethamine (35 – 67%), but none to artemisinin. Moreover, pfhrp2/3 genes were present (50 – 68%) in most places. On the other hand, the AmpliSeq assay had better genetic resolution than microsatellites for Pf and similar for Pv but was not concordant with PCR for pfhrp2/3 genotyping. Our study shows a heterogeneous and specific transmission dynamics of malaria in NJ and other remote areas, leading to proposing specific strategies. The AmpliSeq assays represent a valid tool for molecular surveillance and could contribute to malaria elimination in Peru.Submitted by Yazmin Zelaya (yazmin.zelaya.b@upch.pe) on 2024-06-24T17:49:23Z No. of bitstreams: 1 Vigilancia_CabreraSosa_Luis.pdf: 4178445 bytes, checksum: e19d806cab9b82ea9b4423fa56f7dcf3 (MD5)Approved for entry into archive by Gianella Pantoja (gianella.pantoja@upch.pe) on 2024-06-24T20:43:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Vigilancia_CabreraSosa_Luis.pdf: 4178445 bytes, checksum: e19d806cab9b82ea9b4423fa56f7dcf3 (MD5)Approved for entry into archive by Yazmin Zelaya (yazmin.zelaya.b@upch.pe) on 2024-06-24T21:28:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Vigilancia_CabreraSosa_Luis.pdf: 4178445 bytes, checksum: e19d806cab9b82ea9b4423fa56f7dcf3 (MD5)Made available in DSpace on 2024-06-24T21:29:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vigilancia_CabreraSosa_Luis.pdf: 4178445 bytes, checksum: e19d806cab9b82ea9b4423fa56f7dcf3 (MD5) Previous issue date: 2024application/pdfspaUniversidad Peruana Cayetano HerediaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Población IndígenaEnsayo AmpliSeqDinámica de TransmisiónResistencia AntimaláricosDeleción pfhrp2/3https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.06https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.07https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08Vigilancia molecular de los parásitos de la malaria en comunidades remotas de la Amazonia peruanainfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:UPCH-Institucionalinstname:Universidad Peruana Cayetano Herediainstacron:UPCHSUNEDUDoctor en Ciencias con mención en Bioquímica y Biología MolecularUniversidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora CastroCiencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular73089368https://orcid.org/0000-0002-1420-7729https://orcid.org/0000-0003-2300-51810747876741998018https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#doctor917018Rodríguez Bailón, Jorge EnriqueAdaui Sicheri, Vanessa KarinaMachicado Rivero, Claudia Inés GloriaLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81859https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/15557/2/license.txtf0cc608fbbde7146ed2121d53f577bd9MD52ORIGINALVigilancia_CabreraSosa_Luis.pdfVigilancia_CabreraSosa_Luis.pdfapplication/pdf4178445https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/15557/1/Vigilancia_CabreraSosa_Luis.pdfe19d806cab9b82ea9b4423fa56f7dcf3MD5120.500.12866/15557oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/155572024-10-07 11:25:30.953Repositorio Institucional Universidad Peruana Cayetano Herediarepositorio.institucional@oficinas-upch.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 |
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