Micrornas circulantes en saliva y orina como potenciales biomarcadores de enfermedad mínima residual en leucemia linfoblástica aguda pediátrica

Descripción del Articulo

A pesar del incremento significativo de la sobrevida, alrededor del 20% de los niños con leucemia linfoblástica aguda (LLA) sufren de recaída luego del tratamiento. La determinación de la enfermedad mínima residual (EMR), en la médula ósea, es un poderoso predictor de recaída. Los microRNAs son secr...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Pando Caciano, Alejandra
Formato: tesis doctoral
Fecha de Publicación:2024
Institución:Universidad Peruana Cayetano Heredia
Repositorio:UPCH-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/16688
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12866/16688
Nivel de acceso:acceso abierto
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description A pesar del incremento significativo de la sobrevida, alrededor del 20% de los niños con leucemia linfoblástica aguda (LLA) sufren de recaída luego del tratamiento. La determinación de la enfermedad mínima residual (EMR), en la médula ósea, es un poderoso predictor de recaída. Los microRNAs son secretados por las células tumorales en fluidos como la orina y la saliva, en niveles que reflejan el estado fisiológico de un individuo, y pueden servir como biomarcadores no invasivos de EMR. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la utilidad de los microRNAs circulantes en saliva y orina como biomarcadores de EMR. Se recolectaron muestras de saliva y orina el día 15 de quimioterapia de pacientes menores de 18 años diagnosticados con LLA. Los pacientes se clasificaron en el grupo de riesgo alto (GRA) o el grupo de riesgo estándar-intermedio (GRSI) de recaída, según la EMR del día 15. Inicialmente, se examinó el perfil de expresión de microRNAs en 6pacientes de cada grupo mediante secuenciación de RNAs pequeños. La sobreexpresión de microRNAs se confirmó mediante RT-q PCR en 23 pacientes del GRA y 26 del GRSI. El secuenciación reveló 30 microRNAs expresados diferencialmente en saliva y 2 en orina. Entre estos, miR-1246, miR-223-3p y miR-1290 mostraron los niveles más altos de sobreexpresión en saliva (Log2 FC = 4.00, 3.95 y 3.73, respectivamente). Los 2 microRNAs expresados diferencialmente en orina estuvieron sub expresados. Durante la validación, se confirmó la sobreexpresión del miR-223-3p en saliva (Log2 FC = 1.19, p = 0.025). El uso individual de este microRNA y la combinación del miR-1246, miR-223-3p y miR-1290permitió discriminar entre pacientes del grupo GRA y GRSI (AUC = 0.71, IC 95%: 0.55-0.86, y AUC = 0.72, IC 95%: 0.57-0.87, respectivamente). Los resultados sugieren que miR-223-3p, solo o en combinación con miR-223-3p y miR-1290, podría representar un potencial biomarcador no invasivo de EMR en la LLA pediátrica; sin embargo, es necesaria una validación en una cohorte de pacientes más grande.
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Los pacientes se clasificaron en el grupo de riesgo alto (GRA) o el grupo de riesgo estándar-intermedio (GRSI) de recaída, según la EMR del día 15. Inicialmente, se examinó el perfil de expresión de microRNAs en 6pacientes de cada grupo mediante secuenciación de RNAs pequeños. La sobreexpresión de microRNAs se confirmó mediante RT-q PCR en 23 pacientes del GRA y 26 del GRSI. El secuenciación reveló 30 microRNAs expresados diferencialmente en saliva y 2 en orina. Entre estos, miR-1246, miR-223-3p y miR-1290 mostraron los niveles más altos de sobreexpresión en saliva (Log2 FC = 4.00, 3.95 y 3.73, respectivamente). Los 2 microRNAs expresados diferencialmente en orina estuvieron sub expresados. Durante la validación, se confirmó la sobreexpresión del miR-223-3p en saliva (Log2 FC = 1.19, p = 0.025). El uso individual de este microRNA y la combinación del miR-1246, miR-223-3p y miR-1290permitió discriminar entre pacientes del grupo GRA y GRSI (AUC = 0.71, IC 95%: 0.55-0.86, y AUC = 0.72, IC 95%: 0.57-0.87, respectivamente). Los resultados sugieren que miR-223-3p, solo o en combinación con miR-223-3p y miR-1290, podría representar un potencial biomarcador no invasivo de EMR en la LLA pediátrica; sin embargo, es necesaria una validación en una cohorte de pacientes más grande.Despite significant advancements in the treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL),about 20% of pediatric patients experience a relapse. Minimal residual disease (MRD)measurement in the bone marrow is a strong predictor of relapse. Tumor cells releasemicroRNAs into bodily fluids, such as urine and saliva, at levels that accurately reflect anindividual's physiological state. Thus, microRNAs represent potential noninvasive MRDbiomarkers. This study aimed to evaluate the use of circulating microRNAs in urine andsaliva as noninvasive biomarkers of MRD. Saliva and urine samples were collected frompediatric ALL patients under 18 on day 15 of chemotherapy. Patients were categorized intohigh-risk (HRR) and standard-intermediate risk of relapse (SIRR) groups based on MRD onday 15. Small RNA sequencing was conducted to examine the microRNA expression profilein six patients from each risk group. Subsequently, the upregulation of microRNAs wasconfirmed using RT-qPCR in 23 patients from the HRR group and 26 patients from theSIRR group. The sequencing analysis identified 30 differentially expressed microRNAs insaliva and 2 in urine. Among these, miR-1246, miR-223-3p, and miR-1290 showed thehighest levels of upregulation in saliva. Upon validation, the upregulation of miR-223-3p insaliva was confirmed (Log2 FC = 1.19, p = 0.025). The use of miR-223-3p alone, as well asin combination with miR-1246 and miR-1290, was capable of distinguishing between HRRand SIRR patients (AUC = 0.71, 95% CI: 0.55-0.86, and AUC = 0.72, 95% CI: 0.57-0.87,respectively). These results suggest that miR-223-3p, alone and in combination with miR-223-3p and miR-1290, could potentially serve as noninvasive biomarkers of MRD inpediatric ALL; however, further validation in a larger patient cohort is necessary.Submitted by Margarita Sánchez (margarita.sanchez.o@upch.pe) on 2025-02-10T19:32:10Z No. of bitstreams: 1 Micrornas_PandoCaciano_Alejandra.pdf: 2996038 bytes, checksum: 3cb2a53dd1d6d8cae34ddced4a636a07 (MD5)Approved for entry into archive by Andrea Rojas (andrea.rojas.a@upch.pe) on 2025-02-10T20:36:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Micrornas_PandoCaciano_Alejandra.pdf: 2996038 bytes, checksum: 3cb2a53dd1d6d8cae34ddced4a636a07 (MD5)Approved for entry into archive by Jennifer Giles (jennifer.giles@upch.pe) on 2025-02-10T20:48:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Micrornas_PandoCaciano_Alejandra.pdf: 2996038 bytes, checksum: 3cb2a53dd1d6d8cae34ddced4a636a07 (MD5)Made available in DSpace on 2025-02-10T20:48:51Z (GMT). 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Escuela de Posgrado Víctor Alzamora CastroCiencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular70417451https://orcid.org/0000-0003-3662-2250https://orcid.org/0000-0001-5306-628X1051811123899940https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#doctor917018Cisneros Albino, Pablo TsukayamaAdaui Sicheri, Vanessa KarinaMachicado Rivero, Claudia Ines GloriaLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81859https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/16688/2/license.txtf0cc608fbbde7146ed2121d53f577bd9MD52ORIGINALMicrornas_PandoCaciano_Alejandra.pdfMicrornas_PandoCaciano_Alejandra.pdfapplication/pdf2996038https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/16688/1/Micrornas_PandoCaciano_Alejandra.pdf3cb2a53dd1d6d8cae34ddced4a636a07MD5120.500.12866/16688oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/166882025-02-10 15:48:51.742Repositorio Institucional Universidad Peruana Cayetano Herediarepositorio.institucional@oficinas-upch.peQmFqbyBsb3Mgc2lndWllbnRlcyB0w6lybWlub3MgeSBjb25kaWNpb25lcywgYXV0b3Jpem8gZWwgZGVww7NzaXRvIGRlIGVzdGEgb2JyYSBlbiBlbCBSZXBvc2l0b3JpbyBJbnN0aXR1Y2lvbmFsIGRlIGxhIFVQQ0gKeSBhIGFxdWVsbG9zIGRvbmRlIGxhIGluc3RpdHVjacOzbiBzZSBlbmN1ZW50cmUgYWRzY3JpdGEuCgpDb24gbGEgYXV0b3JpemFjacOzbiBkZSBkZXDDs3NpdG8gZGUgZXN0YSBvYnJhICwgb3RvcmdvIGEgbGEgVW5pdmVyc2lkYWQgUGVydWFuYSBDYXlldGFubyBIZXJlZGlhLCB1bmEgbGljZW5jaWEgbm8gZXhjbHVzaXZhCnBhcmEgcmVwcm9kdWNpciwgZGlzdHJpYnVpciwgdHJhbnNmb3JtYXIgKHPDs2xvIGNvbiBwcm9ww7NzaXRvcyBkZSBzZWd1cmlkYWQgIHkvbyBpZGVudGlmaWNhY2nDs24gZGUgbGEgaW5zdGl0dWNpw7NuKSB5IHBvbmVyIGEKZGlzcG9zaWNpw7NuIGRlbCBww7pibGljbyBsYSB2ZXJzacOzbiBkaWdpdGFsIGRlICBtaSBvYnJhIChpbmNsdWlkbyBlbCByZXN1bWVuKSBkZSBtb2RvIGxpYnJlIHkgZ3JhdHVpdG8gYSB0cmF2w6lzIGRlIEludGVybmV0Cm8gY3VhbHF1aWVyIG90cmEgdGVjbm9sb2fDrWEgc3VzY2VwdGlibGUgZGUgYWRzY3JpcGNpw7NuIGEgSW50ZXJuZXQsIGVuIGxvcyBwb3J0YWxlcyBpbnN0aXR1Y2lvbmFsZXMgZGUgbGEgVW5pdmVyc2lkYWQgUGVydWFuYQpDYXlldGFubyBIZXJlZGlhLCBlbiBlbCBSZXBvc2l0b3JpbyBkZSBUcmFiYWpvcyBkZSBJbnZlc3RpZ2FjacOzbiBkZSBTVU5FRFUgeSBlbiB0b2RvcyBsb3MgcmVwb3NpdG9yaW9zIGVsZWN0csOzbmljb3MgY29uIGxvcwpjdWFsZXMgbGEgVW5pdmVyc2lkYWQgZXN0ZSBhZHNjcml0byBlbiBsYSBhY3R1YWxpZGFkIHkgZnV0dXJvLiAKCkVuIHRvZG9zIGxvcyBjYXNvcyBsYSBVbml2ZXJzaWRhZCBQZXJ1YW5hIENheWV0YW5vIEhlcmVkaWEgZGViZXLDoSByZWNvbm9jZXIgZWwgbm9tYnJlIGRlbCBhdXRvciBvIGF1dG9yZXMsIGNvbmZvcm1lIGxhIGxleSBsbyBzZcOxYWxhLiAKCkFzaW1pc21vIGRlY2xhcm8gcXVlIGxhIG9icmEgZXMgdW5hIGNyZWFjacOzbiBkZSBtaSBhdXRvcsOtYSB5IGV4Y2x1c2l2YSB0aXR1bGFyaWRhZCwgbyBjb2F1dG9yw61hIGNvbiB0aXR1bGFyaWRhZCBjb21wYXJ0aWRhLCB5IG1lCmVuY3VlbnRybyBmYWN1bHRhZG8gKGEpIGEgY29uY2VkZXIgbGEgcHJlc2VudGUgbGljZW5jaWEgeSwgZGUgaWd1YWwgZm9ybWEsIGdhcmFudGl6w7MgcXVlIGRpY2hhIG9icmEgbm8gaW5mcmluZ2UgZGVyZWNob3MgZGUgYXV0b3IgZGUKdGVyY2VyYXMgcGVyc29uYXMuIAoKQ29uZmlybW8gcXVlIGNvbiByZXNwZWN0byBhIGxhIGluZm9ybWFjacOzbiBwcmV2aWFtZW50ZSBwcmVzZW50YWRhLCBvcmlnaW5hbGlkYWQgZGUgbGEgb2JyYSB5IGdvY2UgZGUgZGVyZWNob3MgY2VkaWRvcyBzZWfDum4gbGFzCmNvbmRpY2lvbmVzIGRlbCBwcmVzZW50ZSBkb2N1bWVudG8gZXMgdmVyYXouIFNpbiBwZXJqdWljaW8gZGUgY3VhbHF1aWVyIG90cm8gZGVyZWNobyBxdWUgcHVlZGEgY29ycmVzcG9uZGVybGUgYWwgYXV0b3IsIGxhClVuaXZlcnNpZGFkIHBvZHLDoSByZXNjaW5kaXIgdW5pbGF0ZXJhbG1lbnRlIGxhIHByZXNlbnRlIGF1dG9yaXphY2nDs24gZW4gY2FzbyBkZSBxdWUgdW4gdGVyY2VybyBoYWdhIHByZXZhbGVjZXIgY3VhbHF1aWVyIGRlcmVjaG8Kc29icmUgdG9kbyBvIHBhcnRlIGRlIGxhIG9icmEuIEVuIGNhc28gZGUgbGEgZXhpc3RlbmNpYSBkZSBjdWFscXVpZXIgcmVjbGFtYWNpw7NuIGRlIHVuIHRlcmNlcm8gcmVsYWNpb25hZGEgY29uIGxhIG9icmEsIHF1ZWRhIGxhClVuaXZlcnNpZGFkIGV4ZW50YSBkZSByZXNwb25zYWJpbGlkYWQuIAo=
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