Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease
Descripción del Articulo
The fique crop has great potential for the development of the natural fiber market as a beneficial alternative for the protection of the environment. In Colombia, one of the main limitations of fiber production in fique plants is the viral disease Macana caused by Furcraea Necrotic Streak Virus (FNS...
Autores: | , , , , |
---|---|
Formato: | artículo |
Fecha de Publicación: | 2023 |
Institución: | Universidad Nacional Agraria La Molina |
Repositorio: | Revistas - Universidad Nacional Agraria La Molina |
Lenguaje: | inglés |
OAI Identifier: | oai:revistas.lamolina.edu.pe:article/1957 |
Enlace del recurso: | https://revistas.lamolina.edu.pe/index.php/jpagronomy/article/view/1957 |
Nivel de acceso: | acceso abierto |
Materia: | Macana iral diagnosis RT-PCR DBIA fique FNSV natural fiber validation diagnóstico viral fibra natural validación |
id |
REVUNALM_3ac52a23fb8db77c5ccfc4ce4725a68d |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:revistas.lamolina.edu.pe:article/1957 |
network_acronym_str |
REVUNALM |
network_name_str |
Revistas - Universidad Nacional Agraria La Molina |
repository_id_str |
|
dc.title.none.fl_str_mv |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease Detección del virus de la raya necrótica del fique en semillas de fique (Furcraea macrophylla Baker) para prevenir la dispersión de la enfermedad de la macana |
title |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease |
spellingShingle |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease Gamero, Maira Macana iral diagnosis RT-PCR DBIA fique FNSV natural fiber validation Macana diagnóstico viral RT-PCR DBIA fique FNSV fibra natural validación |
title_short |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease |
title_full |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease |
title_fullStr |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease |
title_full_unstemmed |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease |
title_sort |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Gamero, Maira Ortíz, Daniel Barrera , Gloria Gamero, Maira Ortiz, Daniel Barrera, Gloria |
author |
Gamero, Maira |
author_facet |
Gamero, Maira Ortíz, Daniel Barrera , Gloria Ortiz, Daniel Barrera, Gloria |
author_role |
author |
author2 |
Ortíz, Daniel Barrera , Gloria Ortiz, Daniel Barrera, Gloria |
author2_role |
author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
Macana iral diagnosis RT-PCR DBIA fique FNSV natural fiber validation Macana diagnóstico viral RT-PCR DBIA fique FNSV fibra natural validación |
topic |
Macana iral diagnosis RT-PCR DBIA fique FNSV natural fiber validation Macana diagnóstico viral RT-PCR DBIA fique FNSV fibra natural validación |
description |
The fique crop has great potential for the development of the natural fiber market as a beneficial alternative for the protection of the environment. In Colombia, one of the main limitations of fiber production in fique plants is the viral disease Macana caused by Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV). This work aimed to validate the detection of FNSV in asexual planting material from one of the main producing areas and thus contribute to preventing the spread of the disease in the country. The analysis of plants from different geographic altitudes in Cauca, Colombia, showed a positive correlation with the prevalence of Macana disease (being more significant at higher altitudes) but not with the severity of the symptoms. The detection of FNSV on seeds by dot blot immunobinding assay (DBIA) using a polyclonal antibody IgY showed sensitivity (79 %) and specificity (80 %) when sprouts were analyzed, at the same time, for bulbils, the sensitivity was higher (100 %). Moreover, when sprouts were analyzed by the RT-PCR based on FNSV movement protein and polymerase-associated proteins, the sensitivity and specificity were 94 % and 50 %, respectively, in contrast, in the case of bulbils, the specificity was higher (100 %). Additionally, the results showed no uniformity in the distribution of the viral particles on vegetal tissue of infected plants, which is necessary to use the largest amount of tissue possible to perform the detection. As part of the optimization of the techniques, it was shown that plant tissue samples could be collected, transported, and stored on filter paper, allowing the detection of the virus 60 days after collection. |
publishDate |
2023 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2023-04-27 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
https://revistas.lamolina.edu.pe/index.php/jpagronomy/article/view/1957 10.21704/pja.v7i1.1957 |
url |
https://revistas.lamolina.edu.pe/index.php/jpagronomy/article/view/1957 |
identifier_str_mv |
10.21704/pja.v7i1.1957 |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.none.fl_str_mv |
https://revistas.lamolina.edu.pe/index.php/jpagronomy/article/view/1957/2665 |
dc.rights.none.fl_str_mv |
Derechos de autor 2023 Maira Gamero, Daniel Ortiz, Gloria Barrera https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Derechos de autor 2023 Maira Gamero, Daniel Ortiz, Gloria Barrera https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Nacional Agraria La Molina |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Nacional Agraria La Molina |
dc.source.none.fl_str_mv |
Peruvian Journal of Agronomy; Vol. 7 No. 1 (2023): January to April; 69-81 Peruvian Journal of Agronomy; Vol. 7 Núm. 1 (2023): Enero a Abril; 69-81 2616-4477 reponame:Revistas - Universidad Nacional Agraria La Molina instname:Universidad Nacional Agraria La Molina instacron:UNALM |
instname_str |
Universidad Nacional Agraria La Molina |
instacron_str |
UNALM |
institution |
UNALM |
reponame_str |
Revistas - Universidad Nacional Agraria La Molina |
collection |
Revistas - Universidad Nacional Agraria La Molina |
repository.name.fl_str_mv |
|
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1842624227265478656 |
spelling |
Detection of Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV) in fique seed (Furcraea macrophylla Baker) to prevent the spread of the macana disease Detección del virus de la raya necrótica del fique en semillas de fique (Furcraea macrophylla Baker) para prevenir la dispersión de la enfermedad de la macanaGamero, MairaOrtíz, DanielBarrera , Gloria Gamero, MairaOrtiz, DanielBarrera, GloriaMacanairal diagnosisRT-PCRDBIAfiqueFNSVnatural fibervalidationMacanadiagnóstico viralRT-PCRDBIAfiqueFNSVfibra naturalvalidaciónThe fique crop has great potential for the development of the natural fiber market as a beneficial alternative for the protection of the environment. In Colombia, one of the main limitations of fiber production in fique plants is the viral disease Macana caused by Furcraea Necrotic Streak Virus (FNSV). This work aimed to validate the detection of FNSV in asexual planting material from one of the main producing areas and thus contribute to preventing the spread of the disease in the country. The analysis of plants from different geographic altitudes in Cauca, Colombia, showed a positive correlation with the prevalence of Macana disease (being more significant at higher altitudes) but not with the severity of the symptoms. The detection of FNSV on seeds by dot blot immunobinding assay (DBIA) using a polyclonal antibody IgY showed sensitivity (79 %) and specificity (80 %) when sprouts were analyzed, at the same time, for bulbils, the sensitivity was higher (100 %). Moreover, when sprouts were analyzed by the RT-PCR based on FNSV movement protein and polymerase-associated proteins, the sensitivity and specificity were 94 % and 50 %, respectively, in contrast, in the case of bulbils, the specificity was higher (100 %). Additionally, the results showed no uniformity in the distribution of the viral particles on vegetal tissue of infected plants, which is necessary to use the largest amount of tissue possible to perform the detection. As part of the optimization of the techniques, it was shown that plant tissue samples could be collected, transported, and stored on filter paper, allowing the detection of the virus 60 days after collection.El cultivo de fique tiene un gran potencial para el desarrollo del mercado de la fibra natural, como alternativa beneficiosa para la protección del medio ambiente. Una de las principales limitaciones en la producción de fibra de fique en Colombia es la enfermedad viral Macana, causada por Furcraea Necrotic Streak Virus. El objetivo de este trabajo fue validar la detección del FNSV en material de siembra asexual procedente de una de las principales zonas productoras, con el fin de contribuir a la prevención de la enfermedad en el país. El análisis de las plantas provenientes de diferentes altitudes geográficas en Cauca, Colombia, mostró una relación positiva con la prevalencia de la enfermedad de la Macana (a mayor altitud, mayor prevalencia), pero no hubo relación con la severidad de los síntomas. La detección del FNSV en semillas mediante inmunodetección por dot blot (DBIA) usando un anticuerpo polyclonal IgY, mostró una sensibilidad de 79% y una especificidad del 80%, en el caso de hijuelos, mientras que, para bulbillos la sensibilidad fue mayor (100%). Además, cuando los hijuelos fueron analizados por RT-PCR de dos regiones de genes específicos de proteína de movimiento y proteinas asociadas a la polimerasa del virus, la sensibilidad y especificidad fueron de 94 y 50%, respectivamente, mientras que, en bulbillos la especificidad fue más alta (100%). Adicionalmente, los resultados mostraron que no hay uniformidad en la distribución de las partículas virales en el tejido de plantas infectadas, siendo necesario el uso de gran cantidad de tejido para realizar la detección. Como parte de la optimización de las técnicas, se demostró que las muestras de tejido vegetal pueden ser recolectadas, transportadas y almacenadas en papel de filtro, lo que permite la detección del virus 60 días después de la recolección.Universidad Nacional Agraria La Molina2023-04-27info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://revistas.lamolina.edu.pe/index.php/jpagronomy/article/view/195710.21704/pja.v7i1.1957Peruvian Journal of Agronomy; Vol. 7 No. 1 (2023): January to April; 69-81Peruvian Journal of Agronomy; Vol. 7 Núm. 1 (2023): Enero a Abril; 69-812616-4477reponame:Revistas - Universidad Nacional Agraria La Molinainstname:Universidad Nacional Agraria La Molinainstacron:UNALMenghttps://revistas.lamolina.edu.pe/index.php/jpagronomy/article/view/1957/2665Derechos de autor 2023 Maira Gamero, Daniel Ortiz, Gloria Barrerahttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessoai:revistas.lamolina.edu.pe:article/19572025-04-23T14:07:45Z |
score |
12.660752 |
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).