Conventionally, in Escherichia coli, phylogenetic groups A and B1 are associated with commensal strains while B2 and D are associated with extraintestinal strains. The aim of this study was to evaluate diarrheagenic (DEC) and commensal E. coli phylogeny and its association with antibiotic resistance and clinical characteristics of the diarrheal episode. Phylogenetic groups and antibiotic resistance of 369 E. coli strains (commensal strains and DEC from children with or without diarrhea) isolated from Peruvian children <1 year of age were determined by a Clermont triplex PCR and Kirby-Bauer method, respectively. The distribution of the 369 E. coli strains among the 4 phylogenetic groups was A (40%), D (31%), B1 (21%), and B2 (8%). DEC-control strains were more associated with group A while DEC-diarrhea strains were more associated with group D ( < 0.05). There was a tendency ( = 0.06) for...

AIG, CFL, SM, JR participaron en la concepción y diseño del estudio; AIG, CFL, MM, TJO y JR en el aporte de pacientes o material de estudio; CFL, TJO y JR en la obtención del financiamiento; TJO, SM, MJP, JR, y LJdV participaron el análisis e interpretación de los datos. Todos los autores participaron de la recolección de resultados, revisión crítica del manuscrito, aprobación de su versión final.

El objetivo principal del estudio fue establecer el nivel de resistencia a antimicrobianos en un total de 222 cepas comensales de E. coli de origen fecal, en Perú. Las frecuencias de resistencia encontrados, frente los antimicrobianos evaluados, fueron: ampicilina (62,6%), cotrimoxazol (48,6%), tetraciclina (43,0%) y cloranfenicol (15,8%). Destacan los elevados niveles de resistencia a quinolonas: 32% al ácido nalidíxico (NAL) y 12% a ciprofloxacino (CIP). Estos elevados niveles hacia las quinolonas en cepas comensales aisladas en niños de esta franja de edad, realzan el uso extendido y el impacto de consumo de este tipo de antimicrobianos en la comunidad, mostrando el riesgo potencial de su pérdida de utilidad en el área.