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informe técnico
Publicado 2015
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La amazonía peruana sobresale por su mega biodiversidad de especies vegetales. Esta biodiversidad viene siendo aprovechada por pobladores de comunidades indígenas y pueblos ribereños como fuente de alimentos, fitofármacos y materiales para construcción, entre otros diversos usos. Pero es necesario explorar nuevas alternativas para aprovechar sosteniblemente la biodiversidad amazónica. Es por tanto esperable que muchos de los genes únicos que poseen estas especies sean potencialmente útiles para realizar mejora genética y desarrollar procesos biotecnológicos para la producción de compuestos bioactivos de alta cotización en el mercado mundial. Esta mina de genes con valor incalculable debe ser estudiada y explotada para posicionarnos favorablemente a nivel regional y mundial. Para lograr esta meta debemos realizar análisis estructurales y funcionales de los genomas de especies...
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artículo
Publicado 2015
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Myrciaria dubia is an Amazonian fruit shrub that produces numerous bioactive phytochemicals, but is best known by its high L-ascorbic acid (AsA) content in fruits. Pronounced variation in AsA content has been observed both within and among individuals, but the genetic factors responsible for this variation are largely unknown. The goals of this research, therefore, were to assemble, characterize, and annotate the fruit transcriptome of M. dubia in order to reconstruct metabolic pathways and determine if multiple pathways contribute to AsA biosynthesis.RESULTS: In total 24,551,882 high-quality sequence reads were de novo assembled into 70,048 unigenes (mean length = 1150 bp, N50 = 1775 bp). Assembled sequences were annotated using BLASTX against public databases such as TAIR, GR-protein, FB, MGI, RGD, ZFIN, SGN, WB, TIGR_CMR, and JCVI-CMR with 75.2 % of unigenes having annotations. Of the...