Diseño de una vacuna multiepitópica contra el dengue mediante el uso de herramientas inmunoinformáticas

• Autor: Pacheco Silva, Alejandro Zahí
• Formato: tesis de grado
• Fecha de Publicación: 2024
• Institución: Universidad Ricardo Palma
• Repositorio: URP-Tesis
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:repositorio.urp.edu.pe:20.500.14138/8623
• Enlace del recurso: https://hdl.handle.net/20.500.14138/8623
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: Virus del dengue; Inmunoinformática; Vacuna multiepitópica; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.00

El objetivo de estudio fue diseñar in silico una vacuna a partir de epítopos inmunogénicos basados en el domino III de la proteína de envoltura (EDIII) del virus del Dengue utilizando herramientas inmunoinformáticas. Para ello se recuperaron secuencias de aminoácidos de la base de datos de NCBI pertenecientes al dominio III de la proteína E de los 4 serotipos del virus del Dengue. Mediante herramientas de predicción de epítopos de IEDB se predijeron epítopos inmunogénicos y afines a MHC- I y MHC-II y se evaluó la antigenicidad, alergenicidad y toxicidad con Vaxijen, Allertop y ToxinPred, respectivamente. Se eligieron 2 epítopos de cada serotipo (uno de MHC- I y uno de MHC-II) para la conformación de la vacuna y se predijo su estructura tridimensional con Robetta, el cual pudo modelar 108 residuos (52%) con un 69% de confianza. Una vez obtenida la estructura tridimensional, se realizó una simulación de acoplamiento molecular entre un receptor como TLR4 y la vacuna utilizando elservidor ClusPro, el cual predijo un modelo donde se obtuvieron 4 puentes salinos, 16 puentes de hidrógenos y 168 contactos no enlazados. Mediante C-IMMSIM se simuló 3 inyecciones cada 4 semanas y se observó un incremento de la inmunoglobulina IgM después de la primera y segunda inyección, mientras que la IgG superó a la IgM después de la tercera inyección reflejando una respuesta inmune adquirida, así como una rápida eliminación del antígeno. Se concluye que gracias a las herramientas inmuno- informáticas se logró diseñar una vacuna multiepitópica basada en el dominio III de la proteína de envoltura del virus del Dengue que bajo predicciones in silico puede generar una respuesta inmune eficiente