Diseño de una vacuna multiepitópica contra el dengue mediante el uso de herramientas inmunoinformáticas

Descripción del Articulo

El objetivo de estudio fue diseñar in silico una vacuna a partir de epítopos inmunogénicos basados en el domino III de la proteína de envoltura (EDIII) del virus del Dengue utilizando herramientas inmunoinformáticas. Para ello se recuperaron secuencias de aminoácidos de la base de datos de NCBI pert...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Pacheco Silva, Alejandro Zahí
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2024
Institución:Universidad Ricardo Palma
Repositorio:URP-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.urp.edu.pe:20.500.14138/8623
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.14138/8623
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Virus del dengue
Inmunoinformática
Vacuna multiepitópica
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.00
Descripción
Sumario:El objetivo de estudio fue diseñar in silico una vacuna a partir de epítopos inmunogénicos basados en el domino III de la proteína de envoltura (EDIII) del virus del Dengue utilizando herramientas inmunoinformáticas. Para ello se recuperaron secuencias de aminoácidos de la base de datos de NCBI pertenecientes al dominio III de la proteína E de los 4 serotipos del virus del Dengue. Mediante herramientas de predicción de epítopos de IEDB se predijeron epítopos inmunogénicos y afines a MHC- I y MHC-II y se evaluó la antigenicidad, alergenicidad y toxicidad con Vaxijen, Allertop y ToxinPred, respectivamente. Se eligieron 2 epítopos de cada serotipo (uno de MHC- I y uno de MHC-II) para la conformación de la vacuna y se predijo su estructura tridimensional con Robetta, el cual pudo modelar 108 residuos (52%) con un 69% de confianza. Una vez obtenida la estructura tridimensional, se realizó una simulación de acoplamiento molecular entre un receptor como TLR4 y la vacuna utilizando elservidor ClusPro, el cual predijo un modelo donde se obtuvieron 4 puentes salinos, 16 puentes de hidrógenos y 168 contactos no enlazados. Mediante C-IMMSIM se simuló 3 inyecciones cada 4 semanas y se observó un incremento de la inmunoglobulina IgM después de la primera y segunda inyección, mientras que la IgG superó a la IgM después de la tercera inyección reflejando una respuesta inmune adquirida, así como una rápida eliminación del antígeno. Se concluye que gracias a las herramientas inmuno- informáticas se logró diseñar una vacuna multiepitópica basada en el dominio III de la proteína de envoltura del virus del Dengue que bajo predicciones in silico puede generar una respuesta inmune eficiente
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).