Péptidos marcadores en pelo para determinación de especie y metagenómica fecal para la evaluación de dieta y microbiota de Odocoileus virginianus en el CCEA-RBNOAM

• Autor: Carrillo Apolo, Geyby Tatiana
• Formato: tesis de maestría
• Fecha de Publicación: 2020
• Institución: Universidad Nacional de Tumbes
• Repositorio: UNTUMBES-Institucional
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:repositorio.untumbes.edu.pe:20.500.12874/2044
• Enlace del recurso: http://repositorio.untumbes.edu.pe/handle/UNITUMBES/2044
• Nivel de acceso: acceso restringido
• Materia: Odocoileus; Metagenómica; Proteómica; dieta; microbiota; MALDI TOF/TOF; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.14

La Reserva de Biósfera del Noroeste Amotapes-Manglares (RBNOAM), está localizada en los departamentos de Piura y Tumbes y alberga grandes mamíferos como Odocoileus virginianus, un determinante importante de la biodiversidad y una gran cantidad de servicios ecosistémicos. Los venados generalmente se ubican en áreas de difícil acceso y debido a su alto grado de estrés son difíciles de estudiar en estado silvestre, por lo que la aplicación de técnicas moleculares con uso de marcadores genéticos y proteómicos a partir de muestras no-invasivas surgen como una excelente alternativa, en ese sentido los objetivos de la presente investigación fueron obtener mediante espectrometría de masas MALDI TOF/TOF marcadores peptídicos de especie en pelo de O. virginianus, y por otro lado determinar su dieta y microbiota a través de metagenómica dirigida a 16S y RBCL en muestras fecales tomadas entre mayo (estación lluviosa) y noviembre (estación seca) del 2019. Los resultados de shotgun proteomics mostraron que los péptidos de alfa-queratina fueron dominantes en el análisis, estas se compararon con secuencias de otros mamíferos depositadas en bases de datos disponibles online, hallándose dos péptidos específicos para O. virginianus, mientras que el resto complementa la identificación taxonómica. Por otro lado, la microbiota fecal mostró que proteobacteria, bacteroidetes y firmicutes fueron dominantes en ambas estaciones, con géneros relacionados con la capacidad de obtención de nutrientes de material vegetal consumido, así mismo, la evaluación de la dieta mostró que la familia fabaceae fue la más consumida, y se determinó una mayor diversidad de familias en la época lluviosa que en la seca. Estos resultados muestran la eficiencia del uso de muestras no invasivas, y las herramientas moleculares en la obtención de información que permita la gestión para la conservación no sólo de O. virginianus, sino del ecosistema en el que se encuentra dada su importancia en los procesos y vías sucesionales.