In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd
Descripción del Articulo
La quinua (Chenopodium quinoa) es reconocida por su tolerancia al estrés abiótico, incluida la salinidad, y la secuenciación reciente de su genoma ha facilitado el estudio de los mecanismos subyacentes a esta adaptación. Este estudio se centró en caracterizar los genes ZAT de la subfamilia C2H2 en q...
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | tesis de grado |
| Fecha de Publicación: | 2025 |
| Institución: | Universidad Nacional de San Agustín |
| Repositorio: | UNSA-Institucional |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.unsa.edu.pe:20.500.12773/21020 |
| Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12773/21020 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Chenopodium quinoa Genes ZAT Factores de transcripción Estrés salino Expresión génica Tolerancia al estrés https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16 |
| id |
UNSA_c69f73e2c5bb344b408a95b108c68eb9 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unsa.edu.pe:20.500.12773/21020 |
| network_acronym_str |
UNSA |
| network_name_str |
UNSA-Institucional |
| repository_id_str |
4847 |
| spelling |
Condori Pacsi, Sandro JhonatanAlvarez Vasquez, Andrea Pilar2025-10-14T19:34:56Z2025-10-14T19:34:56Z2025La quinua (Chenopodium quinoa) es reconocida por su tolerancia al estrés abiótico, incluida la salinidad, y la secuenciación reciente de su genoma ha facilitado el estudio de los mecanismos subyacentes a esta adaptación. Este estudio se centró en caracterizar los genes ZAT de la subfamilia C2H2 en quinua, evaluando su expresión bajo estrés salino. Se identificaron y analizaron ocho genes ZAT in silico utilizando bases de datos genómicas y herramientas de bioinformática, evaluando sus dominios conservados, motivos cis-regulatorios y características fisicoquímicas. Además, se realizaron ensayos de germinación, cultivo hidropónico y análisis de expresión génica mediante qPCR en accesiones halotolerantes (UNSA_VP033) y halosensibles (UNSA_VP021) expuestas a diferentes concentraciones de NaCl. Los genes CqZAT4 y CqZAT6 mostraron alta expresión en la accesión halotolerante bajo estrés salino, correlacionando con un aumento en la materia seca, longitud de raíz y retención de agua. En contraste, la accesión halosensible mostró menor tolerance, con reducciones significativas en estas métricas. El análisis de promotores reveló elementos cis asociados con respuestas hormonales y al estrés. Los genes ZAT desempeñan un papel clave en la respuesta de la quinoa al estrés salino, destacando CqZAT4 y CqZAT6 en el accession halotolerante. Estos hallazgos podrían impulsar el desarrollo de variedades más resistentes, contribuyendo a la sostenibilidad agrícola en suelos salinos.application/pdfhttps://hdl.handle.net/20.500.12773/21020spaUniversidad Nacional de San Agustín de ArequipaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Universidad Nacional de San Agustín de ArequipaRepositorio Institucional - UNSAreponame:UNSA-Institucionalinstname:Universidad Nacional de San Agustíninstacron:UNSAChenopodium quinoaGenes ZATFactores de transcripciónEstrés salinoExpresión génicaTolerancia al estréshttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willdinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisSUNEDU45612996https://orcid.org/0000-0002-6792-508973026951511206Lazo Rodriguez, Herbert OmarMestas Valdivia, Bertha RoxanaCondori Pacsi, Sandro Jhonatanhttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesionalhttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesisBiologíaUniversidad Nacional de San Agustín de Arequipa.Facultad de Ciencias BiológicasBiólogaTesis Formato ArtículoORIGINALTesis.pdfapplication/pdf7232690https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/8d5fe855-4973-457b-811f-6547c5147381/downloadc46b06d621577adebd04768734226874MD51Reporte de Similitud.pdfapplication/pdf9149517https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/9c7f1eda-b098-4422-98f4-9d7e60d30e36/download4a6e786f9c9a95fbbd397d9bec7e98d3MD52Autorización de Publicación Digital.pdfapplication/pdf677732https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/e7981bbc-2db4-4546-89ea-3086153027bf/download760ca1b34b3ed5c824b4631a4db34361MD5320.500.12773/21020oai:repositorio.unsa.edu.pe:20.500.12773/210202025-10-14 14:35:05.954http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://repositorio.unsa.edu.peRepositorio Institucional UNSAvridi.gestioninformacion@unsa.edu.pe |
| dc.title.es.fl_str_mv |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| title |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| spellingShingle |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd Alvarez Vasquez, Andrea Pilar Chenopodium quinoa Genes ZAT Factores de transcripción Estrés salino Expresión génica Tolerancia al estrés https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16 |
| title_short |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| title_full |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| title_fullStr |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| title_full_unstemmed |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| title_sort |
In silico characterization and determination of gene expression levels under saline stress conditions in the zinc finger family of the C1-2i subclass in Chenopodium quinoa Willd |
| author |
Alvarez Vasquez, Andrea Pilar |
| author_facet |
Alvarez Vasquez, Andrea Pilar |
| author_role |
author |
| dc.contributor.advisor.fl_str_mv |
Condori Pacsi, Sandro Jhonatan |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Alvarez Vasquez, Andrea Pilar |
| dc.subject.es.fl_str_mv |
Chenopodium quinoa Genes ZAT Factores de transcripción Estrés salino Expresión génica Tolerancia al estrés |
| topic |
Chenopodium quinoa Genes ZAT Factores de transcripción Estrés salino Expresión génica Tolerancia al estrés https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16 |
| dc.subject.ocde.none.fl_str_mv |
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16 |
| description |
La quinua (Chenopodium quinoa) es reconocida por su tolerancia al estrés abiótico, incluida la salinidad, y la secuenciación reciente de su genoma ha facilitado el estudio de los mecanismos subyacentes a esta adaptación. Este estudio se centró en caracterizar los genes ZAT de la subfamilia C2H2 en quinua, evaluando su expresión bajo estrés salino. Se identificaron y analizaron ocho genes ZAT in silico utilizando bases de datos genómicas y herramientas de bioinformática, evaluando sus dominios conservados, motivos cis-regulatorios y características fisicoquímicas. Además, se realizaron ensayos de germinación, cultivo hidropónico y análisis de expresión génica mediante qPCR en accesiones halotolerantes (UNSA_VP033) y halosensibles (UNSA_VP021) expuestas a diferentes concentraciones de NaCl. Los genes CqZAT4 y CqZAT6 mostraron alta expresión en la accesión halotolerante bajo estrés salino, correlacionando con un aumento en la materia seca, longitud de raíz y retención de agua. En contraste, la accesión halosensible mostró menor tolerance, con reducciones significativas en estas métricas. El análisis de promotores reveló elementos cis asociados con respuestas hormonales y al estrés. Los genes ZAT desempeñan un papel clave en la respuesta de la quinoa al estrés salino, destacando CqZAT4 y CqZAT6 en el accession halotolerante. Estos hallazgos podrían impulsar el desarrollo de variedades más resistentes, contribuyendo a la sostenibilidad agrícola en suelos salinos. |
| publishDate |
2025 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2025-10-14T19:34:56Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2025-10-14T19:34:56Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2025 |
| dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| format |
bachelorThesis |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/20.500.12773/21020 |
| url |
https://hdl.handle.net/20.500.12773/21020 |
| dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.ispartof.fl_str_mv |
SUNEDU |
| dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| dc.rights.uri.none.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.es.fl_str_mv |
Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa |
| dc.publisher.country.none.fl_str_mv |
PE |
| dc.source.es.fl_str_mv |
Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa Repositorio Institucional - UNSA |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:UNSA-Institucional instname:Universidad Nacional de San Agustín instacron:UNSA |
| instname_str |
Universidad Nacional de San Agustín |
| instacron_str |
UNSA |
| institution |
UNSA |
| reponame_str |
UNSA-Institucional |
| collection |
UNSA-Institucional |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/8d5fe855-4973-457b-811f-6547c5147381/download https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/9c7f1eda-b098-4422-98f4-9d7e60d30e36/download https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/e7981bbc-2db4-4546-89ea-3086153027bf/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
c46b06d621577adebd04768734226874 4a6e786f9c9a95fbbd397d9bec7e98d3 760ca1b34b3ed5c824b4631a4db34361 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional UNSA |
| repository.mail.fl_str_mv |
vridi.gestioninformacion@unsa.edu.pe |
| _version_ |
1850325531745058816 |
| score |
13.916713 |
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).