Identificación de especies de Leishmania spp aisladas de pacientes procedentes de áreas endémicas mediante análisis de curvas de disociación de los minicírculos del kADN

Descripción del Articulo

En el Perú, la Leishmaniasis es una enfermedad producida por las especies Leishmania (Viannia) peruviana, Leishmania (V.) braziliensis, Leishmania (L.) amazonensis, Leishmania (V.) guyanensis, Leishmania (V.) lainsoni y Leishmania (V.) shawi. Dado la diversidad de especies involucradas en la enferme...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Rojas Palomino, Nyshon Máximo
Formato: tesis de maestría
Fecha de Publicación:2021
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/16735
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Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Leishmania
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description En el Perú, la Leishmaniasis es una enfermedad producida por las especies Leishmania (Viannia) peruviana, Leishmania (V.) braziliensis, Leishmania (L.) amazonensis, Leishmania (V.) guyanensis, Leishmania (V.) lainsoni y Leishmania (V.) shawi. Dado la diversidad de especies involucradas en la enfermedad, la identificación rápida y precisa de la especie infectante de Leishmania permitiría el mejor manejo clínico de los pacientes, pronóstico de la enfermedad y un adecuado monitoreo de tratamiento según la especie, así como la evaluación de nuevas alternativas terapéuticas. La técnica de la PCR-HRM, es una novedosa y potencial herramienta molecular, que permite a través de la detección de energía térmica que generan las curvas de disociación, la identificación de los microorganismos a nivel de género y subgénero. El objetivo del presente estudio fue identificar las especies de Leishmania de las cepas referenciales OMS y de muestras de pacientes con Leishmaniasis, mediante el análisis de las curvas de disociación y evaluar la asociación estadística entre los resultados obtenidos por análisis de las curvas de disociación frente al secuenciamiento del gen citocromo B. Empleando las cepas OMS como referencia o patrón, se identificó la especie de Leishmania a partir del ADNgenómico extraído de las muestras biológicas de pacientes con Leishmaniasis, mediante el análisis de las curvas de disociación generadas por la PCR-HRM de la región conservada de los minicirculos del kADN, los cuales presentaron una similitud en las frecuencias encontradas en la identificación de Leishmania spp mediante el secuenciamiento del gen citocromo B y la PCR-HRM a un nivel de confianza del 95%. Se concluye que el análisis de las curvas de disociación generadas mediante PCR-HRM con oligonucleótidos dirigidos a la región conservada de los minicírculos permite la identificación eficiente de las especies de Leishmania comparable a la identificación por secuenciamiento del gen citocromo B.
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Dado la diversidad de especies involucradas en la enfermedad, la identificación rápida y precisa de la especie infectante de Leishmania permitiría el mejor manejo clínico de los pacientes, pronóstico de la enfermedad y un adecuado monitoreo de tratamiento según la especie, así como la evaluación de nuevas alternativas terapéuticas. La técnica de la PCR-HRM, es una novedosa y potencial herramienta molecular, que permite a través de la detección de energía térmica que generan las curvas de disociación, la identificación de los microorganismos a nivel de género y subgénero. El objetivo del presente estudio fue identificar las especies de Leishmania de las cepas referenciales OMS y de muestras de pacientes con Leishmaniasis, mediante el análisis de las curvas de disociación y evaluar la asociación estadística entre los resultados obtenidos por análisis de las curvas de disociación frente al secuenciamiento del gen citocromo B. Empleando las cepas OMS como referencia o patrón, se identificó la especie de Leishmania a partir del ADNgenómico extraído de las muestras biológicas de pacientes con Leishmaniasis, mediante el análisis de las curvas de disociación generadas por la PCR-HRM de la región conservada de los minicirculos del kADN, los cuales presentaron una similitud en las frecuencias encontradas en la identificación de Leishmania spp mediante el secuenciamiento del gen citocromo B y la PCR-HRM a un nivel de confianza del 95%. Se concluye que el análisis de las curvas de disociación generadas mediante PCR-HRM con oligonucleótidos dirigidos a la región conservada de los minicírculos permite la identificación eficiente de las especies de Leishmania comparable a la identificación por secuenciamiento del gen citocromo B.application/pdfspaUniversidad Nacional Mayor de San MarcosPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Universidad Nacional Mayor de San MarcosRepositorio de Tesis - UNMSMreponame:UNMSM-Tesisinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMLeishmaniaLeishmaniasis - Identificaciónhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.06https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.07https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08Identificación de especies de Leishmania spp aisladas de pacientes procedentes de áreas endémicas mediante análisis de curvas de disociación de los minicírculos del kADNinfo:eu-repo/semantics/masterThesisSUNEDUMagíster en GenéticaUniversidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Unidad de PosgradoGenética06120091https://orcid.org/0000-0002-2160-242842376003919217Paredes Anaya, Mónica YolandaMartínez Rojas, Rosa NéridaVivas Ruiz, Dan Erickhttps://purl.org/pe-repo/renati/level#maestrohttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis079018150842669841951131ORIGINALRojas_pn.pdfRojas_pn.pdfapplication/pdf7273027https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/99a22b6f-c88d-478f-a648-9eabc14e01d0/downloadd247ffb51e0cdf4313aa37e0f67d9da9MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/4404179c-3266-4c31-99bd-16d20e2aeb11/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTRojas_pn.pdf.txtRojas_pn.pdf.txtExtracted texttext/plain101460https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/808f64e0-da77-44e4-bb7d-110c69bf8737/download24823c65db38222f38ca08748dac8e4fMD55THUMBNAILRojas_pn.pdf.jpgRojas_pn.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg15371https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/d883399b-ac59-422d-a9f8-1df716a0f788/download495cb187583e3fc27be7c6f0afae35a9MD5620.500.12672/16735oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/167352024-08-15 23:17:46.134https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://cybertesis.unmsm.edu.peCybertesis UNMSMcybertesis@unmsm.edu.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