Códigos de barras de ADN de los condrictios en el Perú y su aplicación para detectar potenciales nuevas especies

Descripción del Articulo

El presente estudio tuvo como finalidad aplicar el código de barras de ADN del gen mitocondrial Citocromo C oxidasa subunidad I (COI), así como tres métodos de delimitación de especies, el Modelo Generalizado Mixto de Yule y Coalescencia (GMYC), Árboles por Procesos de Poisson (PTP), y la implementa...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Cañedo Apolaya, Rosa María Lorena
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2024
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/23387
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12672/23387
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Moléculas
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description El presente estudio tuvo como finalidad aplicar el código de barras de ADN del gen mitocondrial Citocromo C oxidasa subunidad I (COI), así como tres métodos de delimitación de especies, el Modelo Generalizado Mixto de Yule y Coalescencia (GMYC), Árboles por Procesos de Poisson (PTP), y la implementación Bayesiana del método PTP (bPTP), para construir una biblioteca de referencias de secuencias genéticas de peces condrictios (tiburones, rayas y quimeras) muestreados en el Perú. En el presente estudio un total de 119 secuencias fueron generadas para 43 especies nominales muestreadas en Perú, durante cruceros oceanográficos, desembarques, capturas dirigidas e incidentales. Para el análisis de delimitación de especies estas secuencias se alinearon junto con un set de secuencias obtenidas del repositorio público del Sistema BOLD. A partir de este análisis, se obtuvieron un total de 82 MOTUS. Un total de 5 especies nominales de tiburones y 16 especies de rayas (principalmente del orden Myliobatiformes) presentaron discordancia entre la identificación morfológica externa y los métodos moleculares. Específicamente para el Perú, se ha podido identificar 17 tiburones y 12 rayas (26 % de las especies reportadas en aguas peruanas) así como una potencial nueva especie del género Squatina (angelotes) en el norte del Perú, las cuales presentaron concordancia entre su identificación morfológica y la delimitación molecular. Futuros estudios necesitan ser desarrollados para poder esclarecer las discordancias entre la taxonomía usando morfología externa y los métodos moleculares de estas especies con la finalidad de poder determinar la verdadera diversidad de condrictios a lo largo de la costa del Per˙ y a lo largo de Pacífico Este.
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En el presente estudio un total de 119 secuencias fueron generadas para 43 especies nominales muestreadas en Perú, durante cruceros oceanográficos, desembarques, capturas dirigidas e incidentales. Para el análisis de delimitación de especies estas secuencias se alinearon junto con un set de secuencias obtenidas del repositorio público del Sistema BOLD. A partir de este análisis, se obtuvieron un total de 82 MOTUS. Un total de 5 especies nominales de tiburones y 16 especies de rayas (principalmente del orden Myliobatiformes) presentaron discordancia entre la identificación morfológica externa y los métodos moleculares. Específicamente para el Perú, se ha podido identificar 17 tiburones y 12 rayas (26 % de las especies reportadas en aguas peruanas) así como una potencial nueva especie del género Squatina (angelotes) en el norte del Perú, las cuales presentaron concordancia entre su identificación morfológica y la delimitación molecular. Futuros estudios necesitan ser desarrollados para poder esclarecer las discordancias entre la taxonomía usando morfología externa y los métodos moleculares de estas especies con la finalidad de poder determinar la verdadera diversidad de condrictios a lo largo de la costa del Per˙ y a lo largo de Pacífico Este.Perú. Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica (FONDECYT). Código de barras de ADN de la biodiversidad marina del Perú. Círculos de Investigación 023- 2016FONDECYT. Perú. Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Vicerrectorado de Investigación y Posgrado. Programa de Promoción de Tesis de Pregrado. 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