Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita

Descripción del Articulo

Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencias e Ingeniería Biológicas
Detalles Bibliográficos
Autor: Camel Paucar, Vladimir Fernando
Formato: tesis doctoral
Fecha de Publicación:2024
Institución:Universidad Nacional Agraria La Molina
Repositorio:UNALM-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/6667
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12996/6667
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:PhotosynQ
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.01
id UNAL_dffa163e31ef032ba47650ea39fb6bfc
oai_identifier_str oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/6667
network_acronym_str UNAL
network_name_str UNALM-Institucional
repository_id_str 3039
dc.title.es_PE.fl_str_mv Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
title Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
spellingShingle Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
Camel Paucar, Vladimir Fernando
PhotosynQ
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.01
title_short Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
title_full Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
title_fullStr Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
title_full_unstemmed Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
title_sort Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
author Camel Paucar, Vladimir Fernando
author_facet Camel Paucar, Vladimir Fernando
author_role author
dc.contributor.advisor.fl_str_mv Zolla Benites, Gastón Enrique
Jiménez Dávalos, Jorge Eduardo
dc.contributor.author.fl_str_mv Camel Paucar, Vladimir Fernando
dc.subject.es_PE.fl_str_mv PhotosynQ
topic PhotosynQ
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.01
dc.subject.ocde.es_PE.fl_str_mv https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.01
description Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencias e Ingeniería Biológicas
publishDate 2024
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-08-13T01:38:14Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2024-08-13T01:38:14Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2024
dc.type.es_PE.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type.version.es_PE.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12996/6667
url https://hdl.handle.net/20.500.12996/6667
dc.language.iso.es_PE.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.fl_str_mv SUNEDU
dc.rights.es_PE.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.es_PE.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.format.es_PE.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.es_PE.fl_str_mv Universidad Nacional Agraria La Molina
dc.publisher.country.es_PE.fl_str_mv PE
dc.source.none.fl_str_mv reponame:UNALM-Institucional
instname:Universidad Nacional Agraria La Molina
instacron:UNALM
instname_str Universidad Nacional Agraria La Molina
instacron_str UNALM
institution UNALM
reponame_str UNALM-Institucional
collection UNALM-Institucional
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/8b3147c4-1cdb-4289-8845-f53dd602911f/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/f9b48a16-51ae-40af-91a8-14a9630f1f1c/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/624a2e39-9f14-4c2b-9422-3e4ff5f931b5/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/5d00f1af-a76a-4ceb-ae80-e41c4d5cc138/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/9f3775c4-0039-47e4-9cc0-2e01c720516e/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/1f320e34-bc56-457d-a7a4-88ec9e3c2d7d/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/d09d314d-5651-4460-8e63-cc9f53ba1ca4/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/6866261b-a34e-4457-a121-9dd6c62c2a8c/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/ba989c84-d5af-4dcc-9c6e-50d031d9c892/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/14df40e0-ef0b-4a8c-8699-deaf9995516a/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 3622643ef3249cc9556b7dbd6a9d58f8
102ae1ad6c7476d820d76de5893a3b99
f7dae53de091a83b8cf6d64d82ce3799
97c5bee00fbb4c4f8867bd742b579336
9d2cac9b2c335b5589da64ad792c681c
676547192cceda7c246a43cd8ddd1264
91c98e1c6a819dae9d6894570a1951bf
d17e2242ddf0fb5fc6358e242acefc73
9cde7097c08324108ef7ac383505fd99
2da44967471a15595831acc0f335f6f9
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad Nacional Agraria La Molina
repository.mail.fl_str_mv dspace@lamolina.edu.pe
_version_ 1853951659196022784
spelling Zolla Benites, Gastón EnriqueJiménez Dávalos, Jorge Eduardoe0536ecb-0d5d-4969-a690-af5a1999b509Camel Paucar, Vladimir Fernando2024-08-13T01:38:14Z2024-08-13T01:38:14Z2024https://hdl.handle.net/20.500.12996/6667Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencias e Ingeniería BiológicasLa presente tesis tuvo como objetivos caracterizar la fenología fotosintética, analizar la evolución estructural de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa oxigenasa (RuBisCO) y realizar un análisis transcriptómico para identificar genes asociados a la xilogénesis en Guazuma crinita Mart. (Bolaina) y Calycophyllum spruceanum Benth Hook f. ex Schumann (Capirona). Como resultados principales, G. crinita presentó altos índices de rendimiento cuántico (Phi2) durante todo el año. En invierno, sus hojas jóvenes presentaron mayor Phi2 que las hojas viejas y se relacionaron positivamente con el mayor diámetro de lumen de las fibras. Contrario a ello, en las hojas caducas de C. spruceanum, disminuyeron abruptamente los valores de Phi2 en invierno, además no se encontró correlación entre Phi2 y diámetro del lumen de la fibra a lo largo del tallo. En ambas especies se incrementaron los valores de enfriamiento no fotoquímico (NPQt) en invierno, ayudando a disipar la energía luminosa en forma de calor para la adaptación al frio y minimizar el daño del PSII. Por otra parte, el estudio de la evolución estructural de RuBisCO en las isoformas I, II y III exhibieron mayor fluctuación en el loop entre αB y βC, además presentaron correlación positiva con el loop 6, la cual es una región importante en la actividad enzimática y en los estados conformacionales de la RuBisCO. Asimismo, un aumento en la flexibilidad de la estructura loop entre αB y βC, Lys322 (loop6) estaría afectando la actividad catalítica de la enzima. Respecto a los resultados del transcriptoma, se logró obtener 3580 genes diferencialmente expresos (GDEs) del xilema secundario para G. crinita y 3470 para C. spruceanum. Estos genes incluyen factores de transcripción NAC y MYB relacionados con la biosíntesis de la pared celular secundaria, genes relacionados con la mayoría de los pasos metabólicos de la biosíntesis de celulosa, hemicelulosa y lignina. En conclusión, este estudio contribuye a la comprensión de los mecanismos fotosintéticos y de xilogénesis en Bolaina y Capirona, dos árboles endémicos de la amazonia que tienen gran importancia económica, social y ambiental.The present thesis aimed to characterize the photosynthetic phenology, analyze the structural evolution of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase oxygenase (RuBisCO), and perform a transcriptomic analysis to identify genes associated with xylogenesis in Guazuma crinita Mart. (Bolaina) and Calycophyllum spruceanum Benth Hook f. ex Schumann (Capirona). As the main results, G. crinita presented high quantum yield (Phi2) indices throughout the year. In winter, its young leaves presented higher Phi2 than old leaves and were positively related to the greater lumen diameter of the fibers. Contrary to this, in deciduous leaves of C. spruceanum, Phi2 values decreased abruptly in winter, and no correlation was found between Phi2 and fiber lumen diameter along the stem. In both species, non-photochemical cooling (NPQt) values increased in winter, helping to dissipate light energy as heat for cold adaptation and minimizing PSII damage. On the other hand, the study of the structural evolution of RuBisCO in isoforms I, II, and III exhibited greater fluctuation in the loop between αB and βC. Also, I presented a positive correlation with loop 6, which is an important region in the enzymatic activity and the conformational states of RuBisCO. Likewise, an increase in the flexibility of the loop structure between αB and βC, Lys322 (loop6) would be affecting the catalytic activity of the enzyme. Regarding the transcriptome results, 3580 differentially expressed genes (DEGs) of the secondary xylem were obtained for G. crinita and 3470 for C. spruceanum. These genes include NAC and MYB transcription factors related to secondary cell wall biosynthesis and genes related to most metabolic steps of cellulose, hemicellulose, and lignin biosynthesis. In conclusion, this study significantly contributes to the understanding of photosynthetic and xylogenesis mechanisms in Bolaina and Capirona, two endemic trees of the Amazon that have great economic, social, and environmental importance, thereby highlighting the practical implications of our research for the preservation and sustainable use of these speciesapplication/pdfspaUniversidad Nacional Agraria La MolinaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/PhotosynQhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.01Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinitainfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:UNALM-Institucionalinstname:Universidad Nacional Agraria La Molinainstacron:UNALMSUNEDUCiencias e Ingeniería BiológicasUniversidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de PosgradoDoctoris Philosophiae - Ciencias e Ingeniería Biológicas71271603https://orcid.org/0000-0002-0432-1050https://orcid.org/0000-0002-2366-63100799986306058138https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#doctor511018Gonzales Mora, Héctor EnriqueSamolski Klein, IlanitKitazono Sugahara, Ana AkemiGaleano Gómez, EstebanORIGINALcamel-paucar-vladimir-fernando.pdfcamel-paucar-vladimir-fernando.pdfTexto completoapplication/pdf11513184https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/8b3147c4-1cdb-4289-8845-f53dd602911f/download3622643ef3249cc9556b7dbd6a9d58f8MD514. Tesis Doctoral.pdf4. Tesis Doctoral.pdfInforme originalidadapplication/pdf44883347https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/f9b48a16-51ae-40af-91a8-14a9630f1f1c/download102ae1ad6c7476d820d76de5893a3b99MD52Formato de REPOSITORIO.pdfFormato de REPOSITORIO.pdfAutorizacionapplication/pdf627970https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/624a2e39-9f14-4c2b-9422-3e4ff5f931b5/downloadf7dae53de091a83b8cf6d64d82ce3799MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81664https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/5d00f1af-a76a-4ceb-ae80-e41c4d5cc138/download97c5bee00fbb4c4f8867bd742b579336MD54TEXTcamel-paucar-vladimir-fernando.pdf.txtcamel-paucar-vladimir-fernando.pdf.txtExtracted texttext/plain382690https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/9f3775c4-0039-47e4-9cc0-2e01c720516e/download9d2cac9b2c335b5589da64ad792c681cMD554. Tesis Doctoral.pdf.txt4. Tesis Doctoral.pdf.txtExtracted texttext/plain927https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/1f320e34-bc56-457d-a7a4-88ec9e3c2d7d/download676547192cceda7c246a43cd8ddd1264MD57Formato de REPOSITORIO.pdf.txtFormato de REPOSITORIO.pdf.txtExtracted texttext/plain2699https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/d09d314d-5651-4460-8e63-cc9f53ba1ca4/download91c98e1c6a819dae9d6894570a1951bfMD59THUMBNAILcamel-paucar-vladimir-fernando.pdf.jpgcamel-paucar-vladimir-fernando.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3629https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/6866261b-a34e-4457-a121-9dd6c62c2a8c/downloadd17e2242ddf0fb5fc6358e242acefc73MD564. Tesis Doctoral.pdf.jpg4. Tesis Doctoral.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2839https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/ba989c84-d5af-4dcc-9c6e-50d031d9c892/download9cde7097c08324108ef7ac383505fd99MD58Formato de REPOSITORIO.pdf.jpgFormato de REPOSITORIO.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4327https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/14df40e0-ef0b-4a8c-8699-deaf9995516a/download2da44967471a15595831acc0f335f6f9MD51020.500.12996/6667oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/66672024-09-03 09:08:38.723https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://repositorio.lamolina.edu.peRepositorio Universidad Nacional Agraria La Molinadspace@lamolina.edu.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
score 12.616793
Fenotipado fotosintético, evolución estructural de rubisco y transcriptómica de Calycophyllum spruceanum y Guazuma crinita
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).

Ejemplares Similares