Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín

Descripción del Articulo

Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Zootecnia. Departamento Académico de Producción Animal
Detalles Bibliográficos
Autor: Huamaní Torres, Anel Melina
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2025
Institución:Universidad Nacional Agraria La Molina
Repositorio:UNALM-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/7199
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12996/7199
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Genómica
Pendiente
id UNAL_05d0d67589155345efa414bc8a1ee8a8
oai_identifier_str oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/7199
network_acronym_str UNAL
network_name_str UNALM-Institucional
repository_id_str 3039
dc.title.none.fl_str_mv Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
title Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
spellingShingle Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
Huamaní Torres, Anel Melina
Genómica
Pendiente
title_short Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
title_full Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
title_fullStr Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
title_full_unstemmed Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
title_sort Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
author Huamaní Torres, Anel Melina
author_facet Huamaní Torres, Anel Melina
author_role author
dc.contributor.advisor.fl_str_mv Gutiérrez Reynoso, Gustavo Augusto
dc.contributor.author.fl_str_mv Huamaní Torres, Anel Melina
dc.subject.none.fl_str_mv Genómica
topic Genómica
Pendiente
dc.subject.ocde.none.fl_str_mv Pendiente
description Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Zootecnia. Departamento Académico de Producción Animal
publishDate 2025
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2025-07-17T20:30:52Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2025-07-17T20:30:52Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2025
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.version.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12996/7199
url https://hdl.handle.net/20.500.12996/7199
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.fl_str_mv SUNEDU
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.none.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Agraria La Molina
dc.publisher.country.none.fl_str_mv PE
publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Agraria La Molina
dc.source.none.fl_str_mv reponame:UNALM-Institucional
instname:Universidad Nacional Agraria La Molina
instacron:UNALM
instname_str Universidad Nacional Agraria La Molina
instacron_str UNALM
institution UNALM
reponame_str UNALM-Institucional
collection UNALM-Institucional
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/046c1183-a952-4c22-8ebb-02dd39dc1761/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/bfae6bbc-edc6-4181-bd35-54fcbe5bba48/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/e25a6997-b806-4eae-847d-89080d7531dc/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/a4012697-535a-4423-ac31-43d2b7a57b6b/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/63c60e30-d9a6-4cea-aa99-3e21160db302/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/8c52011f-a42c-472c-8be3-c1d245e2f41c/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/814734ff-4282-45b4-a90b-81f4a2e8db7d/download
https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/cbef7f33-a230-4a2f-b009-d5dbff1e6f51/download
bitstream.checksum.fl_str_mv c19b5e34837cd680a832b0f9bca02a07
ecbceaabbf80ea74f04dc73ac34d4816
129fb135fb2fee75b48401513127a271
97c5bee00fbb4c4f8867bd742b579336
44a9cf1d66bfd497e1ce74eeda67fc10
6d93d3216dc4a7f5df47d4876fbec4d3
7e7accc085e63395c0cab23a5d784c0e
fe7928b48930dc2712696a2a634bff85
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad Nacional Agraria La Molina
repository.mail.fl_str_mv dspace@lamolina.edu.pe
_version_ 1846341380767481856
spelling Gutiérrez Reynoso, Gustavo Augusto99e85ea5-1e0d-44f1-8c45-b5b19de7ebb2-1Huamaní Torres, Anel Melina2025-07-17T20:30:52Z2025-07-17T20:30:52Z2025https://hdl.handle.net/20.500.12996/7199Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Zootecnia. Departamento Académico de Producción AnimalEl presente estudio tuvo como objetivo estimar la consanguinidad y el parentesco en 159 animales de la raza Brown Swiss nacidas entre 2011 y 2022, utilizando métodos basados en pedigrí y genómica. Para el genotipado de las muestras se empleó la micromatriz Axiom™ Bovine Genotyping v3 (60k), mientras que los datos genealógicos abarcaron 832 individuos, conformada por 3 generaciones completas y un promedio de 2.28 generaciones equivalentes. El coeficiente de consanguinidad por pedigrí (FPED) fue 1.40% y el coeficiente de consanguinidad genómica (FROH) se calculó utilizando el método de series de homocigosidad (ROH) con tres umbrales: ROH ≥ 2 Mb, ROH ≥ 4 Mb y ROH ≥ 16 Mb, obteniéndose valores promedio de consanguinidad de 11.35%, 9.8% y 3.6%, respectivamente. El parentesco promedio por pedigrí fue 7.09% y el parentesco genómico se estimó con GCTA, obteniendo un promedio de 0.55%. Las correlaciones entre el FPED y FROH (ROH ≥ 2 Mb, ROH ≥ 4 Mb y ROH ≥ 16 Mb) fueron 23.5% 24.16% y 31.33%, respectivamente. La correlación entre el parentesco genómico y por pedigrí fue de 84.91%. Adicionalmente, se realizó un análisis de varianza (ANOVA) para evaluar las diferencias significativas entre los coeficientes de consanguinidad, seguido de una prueba de Tukey para comparaciones múltiples. Los resultados revelaron diferencias significativas (p < 0.001) entre los coeficientes analizados. Este estudio destaca la utilidad de los métodos genómicos para complementar las herramientas tradicionales en el manejo genético, por lo que implementación puede contribuir significativamente a la toma de decisiones en programas de mejoramiento genético y conservación de recursos zoogenéticos.The present study aimed to estimate inbreeding and relationship in 159 Brown Swiss cattle born between 2011 and 2022, using pedigree and genomics based methods. Sample genotyping was performed using the Axiom™ Bovine Genotyping v3 (60k) microarray, while genealogical data encompassed 832 individuals, comprising three complete generations with an average of 2.28 equivalent generations. The pedigree-based inbreeding coefficient (FPED) was 1.40%, whereas the genomic inbreeding coefficient (FROH) was calculated using the runs of homozygosity (ROH) method with three thresholds: ROH ≥ 2 Mb, ROH ≥ 4 Mb, and ROH ≥ 16 Mb, yielding average inbreeding values of 11.35%, 9.8%, and 3.6%, respectively. The average relationship estimated from pedigrees was 7.09%, while the genomic relatioship, estimated with GCTA, showed an average of 0.55%. The correlations between FPED and FROH were 23.5% (ROH ≥ 2 Mb), 24.16% (ROH ≥ 4 Mb), and 31.33% (ROH ≥ 16 Mb). The correlation between genomic and pedigree-based relationship was 84.91%. Additionally, an analysis of variance (ANOVA) was performed to evaluate significant differences among the inbreeding coefficients, followed by a Tukey test for multiple comparisons. The results revealed significant differences (p < 0.001) among the coefficients analyzed. This study highlights the utility of genomic methods as a complement to traditional tools in genetic management, and their implementation can significantly contribute to decision-making in genetic improvement programs and the conservation of zoogenetic resources.application/pdfspaUniversidad Nacional Agraria La MolinaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/GenómicaPendienteConsanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Juníninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:UNALM-Institucionalinstname:Universidad Nacional Agraria La Molinainstacron:UNALMSUNEDUZootecniaUniversidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de ZootecniaIngeniero Zootecnista73971774https://orcid.org/0000-0002-1896-004809091687https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional811306Barrón López, José AlbertoChávez Cossio, Juan FranciscoAlmeyda Matías, José MaximilianoORIGINALhuamani-torres-anel-melina.pdfhuamani-torres-anel-melina.pdfTexto completoapplication/pdf1031945https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/046c1183-a952-4c22-8ebb-02dd39dc1761/downloadc19b5e34837cd680a832b0f9bca02a07MD51turnitin.pdfturnitin.pdfInforme originalidadapplication/pdf1571443https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/bfae6bbc-edc6-4181-bd35-54fcbe5bba48/downloadecbceaabbf80ea74f04dc73ac34d4816MD52Anexo 9.pdfAnexo 9.pdfAutorizaciónapplication/pdf1479717https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/e25a6997-b806-4eae-847d-89080d7531dc/download129fb135fb2fee75b48401513127a271MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81664https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/a4012697-535a-4423-ac31-43d2b7a57b6b/download97c5bee00fbb4c4f8867bd742b579336MD54TEXThuamani-torres-anel-melina.pdf.txthuamani-torres-anel-melina.pdf.txtExtracted texttext/plain101458https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/63c60e30-d9a6-4cea-aa99-3e21160db302/download44a9cf1d66bfd497e1ce74eeda67fc10MD55Anexo 9.pdf.txtAnexo 9.pdf.txtExtracted texttext/plain6https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/8c52011f-a42c-472c-8be3-c1d245e2f41c/download6d93d3216dc4a7f5df47d4876fbec4d3MD57THUMBNAILhuamani-torres-anel-melina.pdf.jpghuamani-torres-anel-melina.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4149https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/814734ff-4282-45b4-a90b-81f4a2e8db7d/download7e7accc085e63395c0cab23a5d784c0eMD56Anexo 9.pdf.jpgAnexo 9.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4978https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/cbef7f33-a230-4a2f-b009-d5dbff1e6f51/downloadfe7928b48930dc2712696a2a634bff85MD5820.500.12996/7199oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/71992025-07-17 22:15:12.059https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://repositorio.lamolina.edu.peRepositorio Universidad Nacional Agraria La Molinadspace@lamolina.edu.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
score 13.040751
Consanguinidad y parentesco derivado de herramientas genómicas y pedigri de los vacunos del establo San Juan de Yanamuclo-Concepción, Junín
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).

Ejemplares Similares