Análisis bioinformático de la proteasa ClpP deStreptococcus mutans asociada a la formación decaries dental humana

• Autores: Chavez-Gamarra, Malú, Sandoval, Gustavo A.
• Formato: artículo
• Fecha de Publicación: 2014
• Institución: Universidad María Auxiliadora
• Repositorio: Agora
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:revistaagora.com:article/10
• Enlace del recurso: https://revistaagora.com/index.php/cieUMA/article/view/10
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: Streptococcus mutans; Streptococcus pneumoniae; ClpP; endopeptidasa

Objetivo: Realizar el análisis bioinformático de la proteasa ClpP de Streptococcusmutans relacionada con su tolerancia al estrés químico durante la formación decaries dental humana. Material y métodos: Para llevar a cabo este análisis se ha empleado la secuencia aminoacídica de la proteasa ClpPde S. mutans cepa UA159 obtenida a partir de la base de datos del GenBank(código de accesión Q8DST7.1), la cual fue utilizada para la determinación de susparámetros bioquímicos, dominios conservados, predicción de estructurassecundarias y modelamiento por homología, empleando las herramientasbioinformáticas ProtParam, Prosite, PHD Secondary Structure Prediction y SWISS-MODEL, respectivamente. La visualización de modelos tridimensionales se realizóempleando PyMol. Resultados: La proteasa ClpP de S. mutans es unamolécula ácida y de mediano peso molecular y además presenta dos dominiosaltamente conservados relacionados con endopeptidasas bacterianas. A partir dela predicción de su estructura tridimensional, la proteasa ClpP presenta una conformación tetradecamérica similar a un anillo, por el cual pasarían lasproteínas bacterianas que necesiten ser procesadas. Conclusión: La proteasa ClpPde S. mutans resulta importante para el proceso infectivo de esta bacteria lo cualpermitirá generar una variedad de estrategias para la inhibición de la colonización de la cavidad bucal.