Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru

Descripción del Articulo

Objetivo: Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales y métodos: Estudio comparativo de casos y controles empare...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: Cassa-Loaiza, William, Vásquez-Velásquez, Cinthya, Gonzales, Gustavo F., Velasquez-Medrano, Carol, Fernandez-Delgado, Kevin, Alvarez-Huambachano, Keyla, Gamboa-Serpa, Henry, Fano-Sizgorich, Diego
Formato: artículo
Fecha de Publicación:2023
Institución:Colegio Médico del Perú
Repositorio:Acta Médica Peruana
Lenguaje:inglés
español
OAI Identifier:oai:amp.cmp.org.pe:article/2475
Enlace del recurso:https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:SARS-CoV-2
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
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spelling Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, PeruComparación de dos métodos isotérmicos para la detección de SARS-COV-2 en Callao, PerúCassa-Loaiza, WilliamVásquez-Velásquez, CinthyaGonzales, Gustavo F.Velasquez-Medrano, CarolFernandez-Delgado, KevinAlvarez-Huambachano, KeylaGamboa-Serpa, HenryFano-Sizgorich, DiegoCassa-Loaiza, WilliamVásquez-Velásquez, CinthyaGonzales, Gustavo F.Velasquez-Medrano, CarolFernandez-Delgado, KevinAlvarez-Huambachano, KeylaGamboa-Serpa, HenryFano-Sizgorich, DiegoSARS-CoV-2Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa InversaTécnicas de Diagnóstico MolecularSARS-CoV-2Reverse Transcriptase Polymerase Chain ReactionMolecular Diagnostic TechniquesObjetivo: Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales y métodos: Estudio comparativo de casos y controles emparejados. Para la evaluación del método CPA se utilizaron 70 casos y 130 controles, mientras que para la RT-LAMP se utilizaron 30 casos y 70 controles. Se calcularon la sensibilidad y la especificidad de ambas pruebas. Posteriormente, se calculó el índice Kappa corregido por sesgo mediante un nuevo muestreo. Resultados: Ambas técnicas presentan valores adecuados y equivalentes de sensibilidad (RT-LAMP: 82,8 %, CPA: 83 %) y especificidad (RT-LAMP y CPA: 91,5 %), así como una alta concordancia (88 %), y un índice Kappa (0,72). Conclusiones: Ambas técnicas de cribado molecular isotérmico son adecuadas para el cribado del SARS-CoV-2, con una sensibilidad y especificidad similares.  Objective: To compare the isothermal molecular screening techniques CPA and RT-LAMP, against the gold standard test, reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), and to determine its agreement. Materials and Methods: Paired comparative case-control study. For the evaluation of the CPA method, 70 cases and 130 controls were used, while for RT-LAMP, 30 cases and 70 controls were used. The sensitivity and specificity of both tests were calculated. Subsequently, the bias-corrected Kappa index was calculated by resampling. Results: Both techniques have adequate and equivalent values of sensitivity (RT-LAMP: 82.8%, CPA: 83%) and specificity (RT-LAMP and CPA: 91.5%), as well as a high concordance (88%), and Kappa-index (0.72). Conclusion: Both isothermal molecular screening techniques are suitable for SARS-CoV-2 screening, with a similar sensitivity and specificity.Colegio Médico del Perú2023-01-26info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdftext/htmltext/xmlhttps://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/247510.35663/amp.2022.394.2475ACTA MEDICA PERUANA; Vol. 39 No. 4 (2022): October - DecemberACTA MEDICA PERUANA; Vol. 39 Núm. 4 (2022): Octubre - Diciembre1728-59171018-8800reponame:Acta Médica Peruanainstname:Colegio Médico del Perúinstacron:CMPengspahttps://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1497https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1842https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1843Copyright (c) 2023 ACTA MEDICA PERUANAinfo:eu-repo/semantics/openAccessoai:amp.cmp.org.pe:article/24752024-11-29T05:20:01Z
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