Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru
Descripción del Articulo
Objetivo: Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales y métodos: Estudio comparativo de casos y controles empare...
Autores: | , , , , , , , |
---|---|
Formato: | artículo |
Fecha de Publicación: | 2023 |
Institución: | Colegio Médico del Perú |
Repositorio: | Acta Médica Peruana |
Lenguaje: | inglés español |
OAI Identifier: | oai:amp.cmp.org.pe:article/2475 |
Enlace del recurso: | https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475 |
Nivel de acceso: | acceso abierto |
Materia: | SARS-CoV-2 Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa Técnicas de Diagnóstico Molecular Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction Molecular Diagnostic Techniques |
id |
REVCMP_a28a2fca5bdffc62273e127e5b8eabfe |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:amp.cmp.org.pe:article/2475 |
network_acronym_str |
REVCMP |
network_name_str |
Acta Médica Peruana |
repository_id_str |
. |
spelling |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, PeruComparación de dos métodos isotérmicos para la detección de SARS-COV-2 en Callao, PerúCassa-Loaiza, WilliamVásquez-Velásquez, CinthyaGonzales, Gustavo F.Velasquez-Medrano, CarolFernandez-Delgado, KevinAlvarez-Huambachano, KeylaGamboa-Serpa, HenryFano-Sizgorich, DiegoCassa-Loaiza, WilliamVásquez-Velásquez, CinthyaGonzales, Gustavo F.Velasquez-Medrano, CarolFernandez-Delgado, KevinAlvarez-Huambachano, KeylaGamboa-Serpa, HenryFano-Sizgorich, DiegoSARS-CoV-2Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa InversaTécnicas de Diagnóstico MolecularSARS-CoV-2Reverse Transcriptase Polymerase Chain ReactionMolecular Diagnostic TechniquesObjetivo: Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales y métodos: Estudio comparativo de casos y controles emparejados. Para la evaluación del método CPA se utilizaron 70 casos y 130 controles, mientras que para la RT-LAMP se utilizaron 30 casos y 70 controles. Se calcularon la sensibilidad y la especificidad de ambas pruebas. Posteriormente, se calculó el índice Kappa corregido por sesgo mediante un nuevo muestreo. Resultados: Ambas técnicas presentan valores adecuados y equivalentes de sensibilidad (RT-LAMP: 82,8 %, CPA: 83 %) y especificidad (RT-LAMP y CPA: 91,5 %), así como una alta concordancia (88 %), y un índice Kappa (0,72). Conclusiones: Ambas técnicas de cribado molecular isotérmico son adecuadas para el cribado del SARS-CoV-2, con una sensibilidad y especificidad similares. Objective: To compare the isothermal molecular screening techniques CPA and RT-LAMP, against the gold standard test, reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), and to determine its agreement. Materials and Methods: Paired comparative case-control study. For the evaluation of the CPA method, 70 cases and 130 controls were used, while for RT-LAMP, 30 cases and 70 controls were used. The sensitivity and specificity of both tests were calculated. Subsequently, the bias-corrected Kappa index was calculated by resampling. Results: Both techniques have adequate and equivalent values of sensitivity (RT-LAMP: 82.8%, CPA: 83%) and specificity (RT-LAMP and CPA: 91.5%), as well as a high concordance (88%), and Kappa-index (0.72). Conclusion: Both isothermal molecular screening techniques are suitable for SARS-CoV-2 screening, with a similar sensitivity and specificity.Colegio Médico del Perú2023-01-26info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdftext/htmltext/xmlhttps://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/247510.35663/amp.2022.394.2475ACTA MEDICA PERUANA; Vol. 39 No. 4 (2022): October - DecemberACTA MEDICA PERUANA; Vol. 39 Núm. 4 (2022): Octubre - Diciembre1728-59171018-8800reponame:Acta Médica Peruanainstname:Colegio Médico del Perúinstacron:CMPengspahttps://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1497https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1842https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1843Copyright (c) 2023 ACTA MEDICA PERUANAinfo:eu-repo/semantics/openAccessoai:amp.cmp.org.pe:article/24752024-11-29T05:20:01Z |
dc.title.none.fl_str_mv |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru Comparación de dos métodos isotérmicos para la detección de SARS-COV-2 en Callao, Perú |
title |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru |
spellingShingle |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru Cassa-Loaiza, William SARS-CoV-2 Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa Técnicas de Diagnóstico Molecular SARS-CoV-2 Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction Molecular Diagnostic Techniques |
title_short |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru |
title_full |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru |
title_fullStr |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru |
title_full_unstemmed |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru |
title_sort |
Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Cassa-Loaiza, William Vásquez-Velásquez, Cinthya Gonzales, Gustavo F. Velasquez-Medrano, Carol Fernandez-Delgado, Kevin Alvarez-Huambachano, Keyla Gamboa-Serpa, Henry Fano-Sizgorich, Diego Cassa-Loaiza, William Vásquez-Velásquez, Cinthya Gonzales, Gustavo F. Velasquez-Medrano, Carol Fernandez-Delgado, Kevin Alvarez-Huambachano, Keyla Gamboa-Serpa, Henry Fano-Sizgorich, Diego |
author |
Cassa-Loaiza, William |
author_facet |
Cassa-Loaiza, William Vásquez-Velásquez, Cinthya Gonzales, Gustavo F. Velasquez-Medrano, Carol Fernandez-Delgado, Kevin Alvarez-Huambachano, Keyla Gamboa-Serpa, Henry Fano-Sizgorich, Diego |
author_role |
author |
author2 |
Vásquez-Velásquez, Cinthya Gonzales, Gustavo F. Velasquez-Medrano, Carol Fernandez-Delgado, Kevin Alvarez-Huambachano, Keyla Gamboa-Serpa, Henry Fano-Sizgorich, Diego |
author2_role |
author author author author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
SARS-CoV-2 Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa Técnicas de Diagnóstico Molecular SARS-CoV-2 Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction Molecular Diagnostic Techniques |
topic |
SARS-CoV-2 Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa Técnicas de Diagnóstico Molecular SARS-CoV-2 Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction Molecular Diagnostic Techniques |
description |
Objetivo: Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales y métodos: Estudio comparativo de casos y controles emparejados. Para la evaluación del método CPA se utilizaron 70 casos y 130 controles, mientras que para la RT-LAMP se utilizaron 30 casos y 70 controles. Se calcularon la sensibilidad y la especificidad de ambas pruebas. Posteriormente, se calculó el índice Kappa corregido por sesgo mediante un nuevo muestreo. Resultados: Ambas técnicas presentan valores adecuados y equivalentes de sensibilidad (RT-LAMP: 82,8 %, CPA: 83 %) y especificidad (RT-LAMP y CPA: 91,5 %), así como una alta concordancia (88 %), y un índice Kappa (0,72). Conclusiones: Ambas técnicas de cribado molecular isotérmico son adecuadas para el cribado del SARS-CoV-2, con una sensibilidad y especificidad similares. |
publishDate |
2023 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2023-01-26 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475 10.35663/amp.2022.394.2475 |
url |
https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475 |
identifier_str_mv |
10.35663/amp.2022.394.2475 |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng spa |
language |
eng spa |
dc.relation.none.fl_str_mv |
https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1497 https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1842 https://amp.cmp.org.pe/index.php/AMP/article/view/2475/1843 |
dc.rights.none.fl_str_mv |
Copyright (c) 2023 ACTA MEDICA PERUANA info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Copyright (c) 2023 ACTA MEDICA PERUANA |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf text/html text/xml |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Colegio Médico del Perú |
publisher.none.fl_str_mv |
Colegio Médico del Perú |
dc.source.none.fl_str_mv |
ACTA MEDICA PERUANA; Vol. 39 No. 4 (2022): October - December ACTA MEDICA PERUANA; Vol. 39 Núm. 4 (2022): Octubre - Diciembre 1728-5917 1018-8800 reponame:Acta Médica Peruana instname:Colegio Médico del Perú instacron:CMP |
instname_str |
Colegio Médico del Perú |
instacron_str |
CMP |
institution |
CMP |
reponame_str |
Acta Médica Peruana |
collection |
Acta Médica Peruana |
repository.name.fl_str_mv |
|
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1842710631047757824 |
score |
12.660197 |
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).