Chloroplast genome of Tillandsia marconae till & Vitek (Bromeliaceae), a hyperarid desert endangered species

Descripción del Articulo

Tillandsia marconae Till & Vitek (Bromeliaceae) is a rare plant native species that grows over sand, in the coastal desert from Perú and Chile and is considered an endangered species. In this study, we assembled its chloroplast genome. The draft chloroplast genome of T. marconae is ca. 158,873 b...

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Detalles Bibliográficos
Autores: Chávez Galarza, Julio César, Cardenas Ninasivincha, Stefanny, Contreras, Roberto, Ferro Mauricio, Rubén Darío, Huanca Mamani, Wilson
Formato: artículo
Fecha de Publicación:2021
Institución:Instituto Nacional de Innovación Agraria
Repositorio:INIA-Institucional
Lenguaje:inglés
OAI Identifier:oai:null:20.500.12955/1661
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12955/1661
https://doi.org/10.1080/23802359.2021.1944364
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Chloroplast genome
Tillandsia
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.00
Descripción
Sumario:Tillandsia marconae Till & Vitek (Bromeliaceae) is a rare plant native species that grows over sand, in the coastal desert from Perú and Chile and is considered an endangered species. In this study, we assembled its chloroplast genome. The draft chloroplast genome of T. marconae is ca. 158,873 bp in length, containing a large single-copy region of 86,937 bp, a small single-copy region of 18,506 bp, and a pair of inverted repeat regions of 26,715 bp. The GC content of the draft chloroplast genome is 37.4%. It encodes a total of 135 genes, including 86 protein-coding genes, 38 tRNA genes, 8 rRNA genes, and three pseudogenes. The phylogenetic tree indicated that T. marconae is placed within the Bromeliaceae family and a close relationship with Tillandsia usneoides with 100% support.
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