Genetic variability of 29 Peruvian quinoa (Chenopodium quinoa Willd) accessions using AFLP markers and multivariate analysis

• Autores: García-Godos, Paula, Cueva-Castillo, Judith M.
• Formato: artículo
• Fecha de Publicación: 2021
• Institución: Universidad Nacional de Trujillo
• Repositorio: Revista UNITRU - Scientia Agropecuaria
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:ojs.revistas.unitru.edu.pe:article/3298
• Enlace del recurso: http://revistas.unitru.edu.pe/index.php/scientiaagrop/article/view/3298
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: Chenopodium quinoa Willd.; Germplasm; AFLPs; genetic diversity; genetic variation; genetic variability; germoplasma; diversidad genética; variación genética; variabilidad genética

Aiming to determine the genetic variability of accessions of Chenopodium quinoa Willd. "Quinoa" from the Germplasm Bank of INIA - Ayacucho, analyze 29 accessions, which were characterized using AFLP molecular markers. The quality of the DNA extracted by the Doyle and modified Doyle method was optimal for all samples, obtaining modifications in a range of 100 - 400 ng / μl. In the standardization of the AFLP technique, it was determined that the proteins between 100 and 200 ng / μl of digested DNA were adequate to efficiently develop the AFLP technique, and it was also determined that the preamplification products that allowed the resolution amplification profiles variables were higher with a 1:4 ratio. A total of 7 primer combinations generated 220 DNA bands, being 201 polymorphic loci. Molecular data grouped the accessions into seven groups at a similarity of 0.81 ultrametric units, of which a group is made up of 23 accessions and the remaining six made up of a single accession. It was found that the mean genetic variance was 0.306 ± 0.011, with a Shannon information index of 0.463 ± 0.015, these results showed that in the 29 quinoa accessions it presents a high degree of genetic variability and there is no duplicate accession. The study determines the genetic relationship and is essential to raise the genetic improvement and conservation of quinoa.
Con el objetivo de determinar la variabilidad genética de accesiones de Chenopodium quinoa Willd. “quinua” del Banco de Germoplasma del INIA - Ayacucho, se analizaron 29 accesiones, las cuales fueron caracterizadas utilizando marcadores moleculares AFLP. La calidad del ADN extraído mediante el método de Doyle & Doyle modificado, fue óptima para todas las muestras, obteniéndose concentraciones en un rango de 100 – 400 ng/μl. En la estandarización de la técnica AFLP se determinó que las concentraciones entre 100 y 200 ng/μl de ADN digerido fueron adecuadas para desarrollar de manera eficiente la técnica de AFLP, además se determinó que los productos de preamplificación que permitieron perfiles de amplificación de mayor resolución fueron las concentraciones con una relación de 1:4. Un total de 7 combinaciones de iniciadores generaron 220 bandas de ADN, siendo 201 loci polimórficos. Los datos moleculares agruparon las accesiones en siete grupos a una similitud de 0,81 unidades ultramétricas, de los cuales un grupo está constituido por 23 accesiones y las seis restantes conformadas por una sola accesión. Se encontró que la variancia genética promedio fue de 0,306 ± 0,011, con un índice de información de Shannon de 0,463 ± 0,015, estos resultados mostraron que en las 29 accesiones de quinua presenta un alto grado de variabilidad genética y no existe ninguna accesión duplicada. El estudio determina la relación genética y es fundamental para plantear estrategias de mejoramiento genético y conservación de la quinua.