Polimorfismos de los genes calpaína y calpastatina en el ganado criollo colombiano Hartón del Valle
Descripción del Articulo
El objetivo del presente trabajo fue caracterizar el polimorfismo de nucleótido simples 316 y 4751 del gen CAPN y 2959 y CAST1 del gen CAST en la raza bovina criolla colombiana Hartón del Valle. Se genotiparon mediante PCR-RFLP 126 individuos para los cuatro loci. Todos los marcadores fueron polimór...
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Formato: | artículo |
Fecha de Publicación: | 2018 |
Institución: | Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
Repositorio: | Revista UNMSM - Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú |
Lenguaje: | español |
OAI Identifier: | oai:ojs.csi.unmsm:article/14003 |
Enlace del recurso: | https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/14003 |
Nivel de acceso: | acceso abierto |
Materia: | meat quality simple nucleotide polymorphism PCR-RFLP zoogenetic resources calidad de carne polimorfismo de nucleótido simple recursos zoogenéticos |
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Polimorfismos de los genes calpaína y calpastatina en el ganado criollo colombiano Hartón del VallePolymorphisms of the calpain and calpastatin genes in the Colombian creole Hartón del Valle cattleLenis, ClaudiaRamos, LilianaHernández Herrera, DarwinÁlvarez, Luzmeat qualitysimple nucleotide polymorphismPCR-RFLPzoogenetic resourcescalidad de carnePCR-RFLPpolimorfismo de nucleótido simplerecursos zoogenéticosEl objetivo del presente trabajo fue caracterizar el polimorfismo de nucleótido simples 316 y 4751 del gen CAPN y 2959 y CAST1 del gen CAST en la raza bovina criolla colombiana Hartón del Valle. Se genotiparon mediante PCR-RFLP 126 individuos para los cuatro loci. Todos los marcadores fueron polimórficos. El genotipo CC del locus CAPN-316 y el heterocigoto en los otros tres loci tuvieron mayor frecuencia. Las frecuencias de los alelos asociados positivamente con calidad de la carne fueron de C= 21.8 ± 17.5% en CAPN-316, C = 48.4 ± 10.1% en CAPN-4751, T = 52.5 ± 11.4% en CAST-1 y A = 65.1 ± 15.5% en CAST-2959. En todo los loci la Ho (0.599 ± 0.248) fue más alta que la He (0.410 ± 0.081) con valores negativos de FIS y FIT y con desviaciones de EHW solo en CAPN-4751. El valor de FST fue de 0.048 (p < 0.05) y el AMOVA mostró que la variación en estos loci se debía en mayor parte a los individuos (97%). Lo anterior puede ser indicativo de que esta raza presenta predisposición genética para la producción de carne con perfiles de calidad.The objective of the present work was to characterize the simple nucleotide polymorphism 316 and 4751 of the CAPN and 2959 gene and CAST1 of the CAST gene in the Colombian creole breed Hartón del Valle. A total of 126 individuals were genotyped by PCR-RFLP for the four loci. All markers were polymorphic. The CC genotype of the CAPN-316 locus and the heterozygote in the other three loci were more frequent. The frequencies of the alleles positively associated with meat quality were C = 21.8 ± 17.5% in CAPN-316, C = 48.4 ± 10.1% in CAPN-4751, T = 52.5 ± 11.4% in CAST-1 and A = 65.1 ± 15.5% in CAST-2959. In all the loci the Ho (0.599 ± 0.248) was higher than the He (0.410 ± 0.081) with negative values of FIS and FIT and with deviations of EHW only in CAPN-4751. The FST value was 0.048 (p<0.05) and the AMOVA showed that the variation in these loci was mostly due to individuals (97%). This may be indicative that this breed has a genetic predisposition for meat production of better quality.Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Medicina Veterinaria2018-09-06info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdftext/htmlhttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/1400310.15381/rivep.v29i3.14003Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol 29 No 3 (2018); 818-827Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 29 Núm. 3 (2018); 818-8271682-34191609-9117reponame:Revista UNMSM - Revista de Investigaciones Veterinarias del Perúinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMspahttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/14003/13079https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/14003/13890Derechos de autor 2018 Darwin Yovanny Hernández Herrerahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccess2021-06-01T18:08:48Zmail@mail.com - |
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El objetivo del presente trabajo fue caracterizar el polimorfismo de nucleótido simples 316 y 4751 del gen CAPN y 2959 y CAST1 del gen CAST en la raza bovina criolla colombiana Hartón del Valle. Se genotiparon mediante PCR-RFLP 126 individuos para los cuatro loci. Todos los marcadores fueron polimórficos. El genotipo CC del locus CAPN-316 y el heterocigoto en los otros tres loci tuvieron mayor frecuencia. Las frecuencias de los alelos asociados positivamente con calidad de la carne fueron de C= 21.8 ± 17.5% en CAPN-316, C = 48.4 ± 10.1% en CAPN-4751, T = 52.5 ± 11.4% en CAST-1 y A = 65.1 ± 15.5% en CAST-2959. En todo los loci la Ho (0.599 ± 0.248) fue más alta que la He (0.410 ± 0.081) con valores negativos de FIS y FIT y con desviaciones de EHW solo en CAPN-4751. El valor de FST fue de 0.048 (p < 0.05) y el AMOVA mostró que la variación en estos loci se debía en mayor parte a los individuos (97%). Lo anterior puede ser indicativo de que esta raza presenta predisposición genética para la producción de carne con perfiles de calidad. The objective of the present work was to characterize the simple nucleotide polymorphism 316 and 4751 of the CAPN and 2959 gene and CAST1 of the CAST gene in the Colombian creole breed Hartón del Valle. A total of 126 individuals were genotyped by PCR-RFLP for the four loci. All markers were polymorphic. The CC genotype of the CAPN-316 locus and the heterozygote in the other three loci were more frequent. The frequencies of the alleles positively associated with meat quality were C = 21.8 ± 17.5% in CAPN-316, C = 48.4 ± 10.1% in CAPN-4751, T = 52.5 ± 11.4% in CAST-1 and A = 65.1 ± 15.5% in CAST-2959. In all the loci the Ho (0.599 ± 0.248) was higher than the He (0.410 ± 0.081) with negative values of FIS and FIT and with deviations of EHW only in CAPN-4751. The FST value was 0.048 (p<0.05) and the AMOVA showed that the variation in these loci was mostly due to individuals (97%). This may be indicative that this breed has a genetic predisposition for meat production of better quality. |
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El objetivo del presente trabajo fue caracterizar el polimorfismo de nucleótido simples 316 y 4751 del gen CAPN y 2959 y CAST1 del gen CAST en la raza bovina criolla colombiana Hartón del Valle. Se genotiparon mediante PCR-RFLP 126 individuos para los cuatro loci. Todos los marcadores fueron polimórficos. El genotipo CC del locus CAPN-316 y el heterocigoto en los otros tres loci tuvieron mayor frecuencia. Las frecuencias de los alelos asociados positivamente con calidad de la carne fueron de C= 21.8 ± 17.5% en CAPN-316, C = 48.4 ± 10.1% en CAPN-4751, T = 52.5 ± 11.4% en CAST-1 y A = 65.1 ± 15.5% en CAST-2959. En todo los loci la Ho (0.599 ± 0.248) fue más alta que la He (0.410 ± 0.081) con valores negativos de FIS y FIT y con desviaciones de EHW solo en CAPN-4751. El valor de FST fue de 0.048 (p < 0.05) y el AMOVA mostró que la variación en estos loci se debía en mayor parte a los individuos (97%). Lo anterior puede ser indicativo de que esta raza presenta predisposición genética para la producción de carne con perfiles de calidad. |
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