El presente trabajo de investigación tiene como objetivo: Analizar los factores asociados con anomalías congénitas en recién nacidos vivos del Hospital Antonio Lorena del Cusco, 2018-2019. Materiales y métodos: Se desarrolló un tipo de estudio analítico, observacional, retrospectivo y transversal tomando como población a todos los recién nacidos vivos con anomalía congénita. Resultados: En los dos años de estudio realizado en el servicio de Neonatología del Hospital Antonio Lorena del Cusco nacieron 6236 recién nacidos vivos, de los cuales 118 recién nacidos vivos presentaron alguna anomalía congénita. La prevalencia de anomalías congénitas fue de 1.8%. El sexo que predominó fue el masculino (55%). La edad materna más frecuente fue entre 19 a 34 años (72%), con nivel de instrucción secundaria (49%), adecuadamente controlada (65%), número de ecografías obstétrica...