Un requisito básico para los programas de mejoramiento genético y la conservación de bancos de germoplasma basada en la selección asistida por marcadores moleculares es contar con un adecuado número de marcadores polimórficos, por ello esta investigación se realizó en los laboratorios de la Universidad Nacional del Altiplano y la Universidad Nacional Agraria la Molina de abril del 2016 a noviembre del 2017, con el objetivo de identificar los marcadores moleculares altamente informativos en la genotipificación de dos variedades de quinua donde la totalidad de muestras evaluadas fueron 19 entre witulla y Chenopodium petiolare, después de la recolección de semillas y la germinación en invernadero se colectó hojas jóvenes para realizar la extracción del ADN, se hizo la cuantificación para luego realizar el método de PCR y electroforesis; para el análisis estadístico se usÃ...