Agrupamiento de 16 accesiones peruanas de quinua (Chenopodium quinoa willd.) en relación al origen utilizando marcadores SSR

Descripción del Articulo

Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias. Departamento Académico de Biología
Detalles Bibliográficos
Autor: Ormeño Zevallos, Jonathan
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2015
Institución:Universidad Nacional Agraria La Molina
Repositorio:UNALM-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/1883
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12996/1883
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Marcadores ssr
Accesiones de quinua
Quinua
Chenopodium quinua
Germoplasma
Variación genética
Marcadores genéticos
Distribución geográfica
Biodiversidad
Recursos genéticos
Experimentación en laboratorio
Evaluación
Perú
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La quinua posee una amplia diversidad, especialmente en la zona alto andina siendo Perú y Bolivia quienes presentan mayor diversidad de variedades en los alrededores del Lago Titicaca, llegándose a encontrar diferencias en hojas, altura de la planta, contenido de saponinas, calidad de grano, colores y tipos de panoja. Así mismo, la quinua presenta una amplia adaptación a diferentes zonas agroecológicas, reportándose la existencia de genotipos tolerantes a las sequias, heladas y salinidad, sin disminuir en mucho su calidad nutricional o rendimiento. Estas importantes características de la quinua han impulsado la investigación y caracterización genética que contribuirá al desarrollo de variedades mejoradas. Los SSR son marcadores moleculares altamente polimórficos útiles para la identificación de variaciones intragenotípica e intergenotípica. Sin embargo, este tipo de marcadores son específicos para una determinada especie y su elaboración es muy laboriosa y costosa, debido a que deben identificarse y secuenciarse regiones genómicas concretas. Para la presente investigación se emplearon 16 accesiones formándose bulks con 5 individuos para cada accesión para el análisis de agrupamiento en relación a su origen, para lo cual se emplearon 10 primers generándose 34 bandas polimórficas con un peso molecular promedio de 140 a 300pb, todos los bulks fueron evaluados y se les asignaron valores numéricos de 1 para identificar la presencia de bandas y 0 para la ausencia de las mismas. La matriz básica de datos (MBD) generada fue procesada en el programa NTSYS versión 2.1 usando el coeficiente de similitud Jaccard, llegándose a construir el dendrograma usando el método de ligamiento no ponderado UPGMA. Los datos moleculares agruparon las accesiones en seis grupos a un coeficiente de similitud de 0.70, el grupo 1 estuvo conformado por 4 accesiones (Arequipa 2, Puno 1, Puno 2 y Puno 3); el grupo 2 conformado por 7 accesiones (Cajamarca 1, Cajamarca 2, Cuzco 2, Cuzco 3, Puno 4, Puno 5, Puno 6); el grupo 3 formado por 2 accesiones (Ancash 1 y Ancash 2); el grupo 4, 5 y 6 lo representan las accesiones Cuzco 4, Cajamarca 3 y Arequipa 1 respectivamente. El árbol dendrológico mostro accesiones con gran grado de similitud como las accesiones Puno 1 y 2, mientras que las accesiones Cajamarca 3 y Arequipa 1 mostraron un grado de similitud de 0.54 siendo el más bajo registrado.Tesisapplication/pdfspaUniversidad Nacional Agraria La MolinaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Marcadores ssrAccesiones de quinuaQuinuaChenopodium quinuaGermoplasmaVariación genéticaMarcadores genéticosDistribución geográficaBiodiversidadRecursos genéticosExperimentación en laboratorioEvaluaciónPerúhttp://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07Agrupamiento de 16 accesiones peruanas de quinua (Chenopodium quinoa willd.) en relación al origen utilizando marcadores SSRinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:UNALM-Institucionalinstname:Universidad Nacional Agraria La Molinainstacron:UNALMSUNEDUBiologíaUniversidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de CienciasBiólogo42805724https://orcid.org/0000-0001-9431-9730https://orcid.org/0000-0002-2366-63100846111106058138https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional511206Blas Sevillano, Raúl HumbertoEspejo Joya, Rosa AmeliaMansilla Samaniego, Roberto CarlosTHUMBNAILF30.O75-T.pdf.jpgF30.O75-T.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3747https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/87418164-7e06-4376-ab8b-172458596186/download7b3c9691e198906a2ed2a002860977e7MD57ORIGINALF30.O75-T.pdfF30.O75-T.pdfTexto completoapplication/pdf616635https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/3f98bfcf-57f2-49e0-bbae-54b65d9b7e1c/download868772f8b7a7496f00d1d1188e71ec81MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81232https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/485f9f35-ffed-4648-bc5b-6ed407b5d0fe/downloadbb87e2fb4674c76d0d2e9ed07fbb9c86MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81683https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/ec3cf085-2e07-4e24-b24f-00bd5be66555/download85e652b8dfa19b82485c505314e0a902MD54TEXTF30.O75-T.pdf.txtF30.O75-T.pdf.txtExtracted texttext/plain178026https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/85c234e2-c06a-40b8-8583-d8e2e1ffe05d/download069a350795bce95e40c989c5934151b6MD5520.500.12996/1883oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/18832025-03-04 16:31:31.478https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://repositorio.lamolina.edu.peRepositorio Universidad Nacional Agraria La Molinadspace@lamolina.edu.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