Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)

Descripción del Articulo

El aumento de casos de resistencia y el reducido hallazgo de nuevas drogas han limitado el avance en las estrategias de control terapéutico contra tuberculosis (TB). Pirazinamida (PZA), droga de primera línea tiene capacidad de eliminar micobacterias latentes y está incluida en los nuevos regímenes...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Campos Tineo, Jen Jhanina
Formato: tesis de maestría
Fecha de Publicación:2022
Institución:Universidad Peruana Cayetano Heredia
Repositorio:UPCH-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/14037
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12866/14037
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:RNA-seq
Genes
Expresión Diferencial
Resistencia
Pirazinamida (PZA)
Ácido Pirazinoico (POA)
Mycobacterium Tuberculosis (MTB)
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08
id RPCH_270ccb4a4c076dbad0ef48915721912c
oai_identifier_str oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/14037
network_acronym_str RPCH
network_name_str UPCH-Institucional
repository_id_str 3932
dc.title.es_ES.fl_str_mv Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
title Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
spellingShingle Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
Campos Tineo, Jen Jhanina
RNA-seq
Genes
Expresión Diferencial
Resistencia
Pirazinamida (PZA)
Ácido Pirazinoico (POA)
Mycobacterium Tuberculosis (MTB)
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08
title_short Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
title_full Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
title_fullStr Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
title_full_unstemmed Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
title_sort Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
author Campos Tineo, Jen Jhanina
author_facet Campos Tineo, Jen Jhanina
author_role author
dc.contributor.advisor.fl_str_mv Sheen Cortavarría, Patricia
dc.contributor.author.fl_str_mv Campos Tineo, Jen Jhanina
dc.subject.es_ES.fl_str_mv RNA-seq
Genes
Expresión Diferencial
Resistencia
Pirazinamida (PZA)
Ácido Pirazinoico (POA)
Mycobacterium Tuberculosis (MTB)
topic RNA-seq
Genes
Expresión Diferencial
Resistencia
Pirazinamida (PZA)
Ácido Pirazinoico (POA)
Mycobacterium Tuberculosis (MTB)
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08
dc.subject.ocde.es_ES.fl_str_mv https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.07
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08
description El aumento de casos de resistencia y el reducido hallazgo de nuevas drogas han limitado el avance en las estrategias de control terapéutico contra tuberculosis (TB). Pirazinamida (PZA), droga de primera línea tiene capacidad de eliminar micobacterias latentes y está incluida en los nuevos regímenes del tratamiento contra TB. A pesar de su importancia, el mecanismo de acción de PZA aún no es claro. Mycobacterium tuberculosis (MTB) resistente a PZA está asociado a mutaciones en el gen pncA que afectan la actividad de PZAsa. Actualmente han sido reportadas cepas resistentes a PZA, pncA wild-type, sugiriéndose la posibilidad de mecanismos de resistencia alterna. Este trabajo tiene como objetivo hallar genes potencialmente involucrados a resistencia alterna a PZA, a través de la evaluación del transcriptoma completo de H37Rv-WT y de 3 aislados clínicos resistentes a PZA, secuenciados mediante NextSeq550, Illumina. Los resultados evidenciaron cambios transcripcionales por PZA en las cepas pncA funcional, sugiriéndose una acción transcripcional mediado por POA. Este trabajo constituye un importante hallazgo en la exploración de genes involucrados en el mecanismo alterno de resistencia a PZA. Entre los principales genes con posible función biológica en resistencia alterna a PZA están genes del metabolismo de lípidos, proteínas reguladoras de metales, reguladores transcripcionales y bombas de eflujo.
publishDate 2022
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2023-09-05T21:12:47Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2023-09-05T21:12:47Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2022
dc.type.es_ES.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
dc.identifier.other.es_ES.fl_str_mv 206750
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12866/14037
identifier_str_mv 206750
url https://hdl.handle.net/20.500.12866/14037
dc.language.iso.es_ES.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.fl_str_mv SUNEDU
dc.rights.es_ES.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.es_ES.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es
dc.format.es_ES.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.es_ES.fl_str_mv Universidad Peruana Cayetano Heredia
dc.publisher.country.es_ES.fl_str_mv PE
dc.source.none.fl_str_mv reponame:UPCH-Institucional
instname:Universidad Peruana Cayetano Heredia
instacron:UPCH
instname_str Universidad Peruana Cayetano Heredia
instacron_str UPCH
institution UPCH
reponame_str UPCH-Institucional
collection UPCH-Institucional
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/2/license.txt
https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/1/Busqueda_CamposTineo_Jen.pdf
https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/3/Formulario_CamposTineo_Jen.pdf
https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/4/Turnitin_CamposTineo_Jen.pdf
https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/5/ActaJurado_CamposTineo_Jen.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv f0cc608fbbde7146ed2121d53f577bd9
acdda940b642a899b85568f22c3b3e75
c906b94eb23f332303746dc4efd5fdf2
f84e3dd1c3558cdd7632c92fdf7db159
f14421d5a7dc19f61706a0774952fb5a
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Peruana Cayetano Heredia
repository.mail.fl_str_mv repositorio.institucional@oficinas-upch.pe
_version_ 1841552584856305664
spelling Sheen Cortavarría, PatriciaCampos Tineo, Jen Jhanina2023-09-05T21:12:47Z2023-09-05T21:12:47Z2022206750https://hdl.handle.net/20.500.12866/14037El aumento de casos de resistencia y el reducido hallazgo de nuevas drogas han limitado el avance en las estrategias de control terapéutico contra tuberculosis (TB). Pirazinamida (PZA), droga de primera línea tiene capacidad de eliminar micobacterias latentes y está incluida en los nuevos regímenes del tratamiento contra TB. A pesar de su importancia, el mecanismo de acción de PZA aún no es claro. Mycobacterium tuberculosis (MTB) resistente a PZA está asociado a mutaciones en el gen pncA que afectan la actividad de PZAsa. Actualmente han sido reportadas cepas resistentes a PZA, pncA wild-type, sugiriéndose la posibilidad de mecanismos de resistencia alterna. Este trabajo tiene como objetivo hallar genes potencialmente involucrados a resistencia alterna a PZA, a través de la evaluación del transcriptoma completo de H37Rv-WT y de 3 aislados clínicos resistentes a PZA, secuenciados mediante NextSeq550, Illumina. Los resultados evidenciaron cambios transcripcionales por PZA en las cepas pncA funcional, sugiriéndose una acción transcripcional mediado por POA. Este trabajo constituye un importante hallazgo en la exploración de genes involucrados en el mecanismo alterno de resistencia a PZA. Entre los principales genes con posible función biológica en resistencia alterna a PZA están genes del metabolismo de lípidos, proteínas reguladoras de metales, reguladores transcripcionales y bombas de eflujo.The increase in cases of resistance and the reduced discovery of new drugs have limited progress in therapeutic control strategies against tuberculosis (TB). The first-line drug PZA has the ability to eliminate latent mycobacteria and is included in new TB treatment regimens. Despite its importance, the mechanism of action of PZA is still unclear. PZA-resistant MTB is associated with mutations in the pncA gene that affect PZAse activity. Currently, strains resistant to PZA, pncA wild-type, have been reported, suggesting the possibility of alternative resistance mechanisms. This work aims to find genes potentially related to alternate resistance to PZA, through the evaluation of the complete transcriptome of MTB-H37RV and 3 strains resistant to PZA, sequenced by NextSeq550, Illumina. The results evidenced transcriptional changes by PZA in the functional pncA strains, suggesting a transcriptional action mediated by POA. This work constitutes an important finding in the exploration of genes involved in the alternative mechanism of resistance to PZA. Among the main genes with a possible relationship to alternative resistance to PZA are lipid metabolism genes, metal regulatory proteins, transcriptional regulators, and efflux pumps.Submitted by Yazmin Zelaya (yazmin.zelaya.b@upch.pe) on 2023-09-04T21:21:01Z No. of bitstreams: 1 Busqueda_CamposTineo_Jen.pdf: 2436489 bytes, checksum: acdda940b642a899b85568f22c3b3e75 (MD5)Approved for entry into archive by Ricardo Mariño (ricardo.marino@upch.pe) on 2023-09-04T21:32:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Busqueda_CamposTineo_Jen.pdf: 2436489 bytes, checksum: acdda940b642a899b85568f22c3b3e75 (MD5)Approved for entry into archive by Yazmin Zelaya (yazmin.zelaya.b@upch.pe) on 2023-09-05T21:12:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Busqueda_CamposTineo_Jen.pdf: 2436489 bytes, checksum: acdda940b642a899b85568f22c3b3e75 (MD5)Made available in DSpace on 2023-09-05T21:12:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Busqueda_CamposTineo_Jen.pdf: 2436489 bytes, checksum: acdda940b642a899b85568f22c3b3e75 (MD5) Previous issue date: 2022application/pdfspaUniversidad Peruana Cayetano HerediaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.esRNA-seqGenesExpresión DiferencialResistenciaPirazinamida (PZA)Ácido Pirazinoico (POA)Mycobacterium Tuberculosis (MTB)https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.07https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)info:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:UPCH-Institucionalinstname:Universidad Peruana Cayetano Herediainstacron:UPCHSUNEDUMaestro en Bioquímica y Biología MolecularUniversidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora CastroBioquímica y Biología Molecular45974600https://orcid.org/0000-0002-7118-930109541127https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro206750Rodriguez Bailon, Jorge EnriqueTsukayama Cisneros, PabloAgapito Panta, Juan CarlosLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81859https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/2/license.txtf0cc608fbbde7146ed2121d53f577bd9MD52ORIGINALBusqueda_CamposTineo_Jen.pdfBusqueda_CamposTineo_Jen.pdfapplication/pdf2436489https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/1/Busqueda_CamposTineo_Jen.pdfacdda940b642a899b85568f22c3b3e75MD51Formulario_CamposTineo_Jen.pdfFormulario_CamposTineo_Jen.pdfapplication/pdf289302https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/3/Formulario_CamposTineo_Jen.pdfc906b94eb23f332303746dc4efd5fdf2MD53Turnitin_CamposTineo_Jen.pdfTurnitin_CamposTineo_Jen.pdfapplication/pdf16752834https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/4/Turnitin_CamposTineo_Jen.pdff84e3dd1c3558cdd7632c92fdf7db159MD54ActaJurado_CamposTineo_Jen.pdfActaJurado_CamposTineo_Jen.pdfapplication/pdf288823https://repositorio.upch.edu.pe/bitstream/20.500.12866/14037/5/ActaJurado_CamposTineo_Jen.pdff14421d5a7dc19f61706a0774952fb5aMD5520.500.12866/14037oai:repositorio.upch.edu.pe:20.500.12866/140372025-08-25 12:04:06.834Repositorio Institucional Universidad Peruana Cayetano Herediarepositorio.institucional@oficinas-upch.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
score 13.983407
Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).

Ejemplares Similares