Presence of rhlAB, rhlR and rhlR genes in Pseudomonas aeruginosa natives overproductors of ramnolipids
Descripción del Articulo
Genes associated to rhamnolipids production were molecularly characterized in 61 bacterial strains from LAMYBIM bacterial collection (Laboratorio de Microbiología y Biotecnología Microbiana, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú). Strains were isolated from peruvian environments hydrocarbon...
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| Formato: | artículo |
| Fecha de Publicación: | 2017 |
| Institución: | Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Repositorio: | Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe:article/13902 |
| Enlace del recurso: | https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/rpb/article/view/13902 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Pseudomonas aeruginosa biosurfactantes ramnolípidos rhlAB rhlR rhlC biosurfactants rhamnolipids |
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Presence of rhlAB, rhlR and rhlR genes in Pseudomonas aeruginosa natives overproductors of ramnolipids Presencia de genes rhlAB, rhlR y rhlC en Pseudomonas aeruginosa nativas sobreproductoras de ramnolípidos |
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Presence of rhlAB, rhlR and rhlR genes in Pseudomonas aeruginosa natives overproductors of ramnolipids Palomino, Roger A. Pseudomonas aeruginosa biosurfactantes ramnolípidos rhlAB rhlR rhlC Pseudomonas aeruginosa biosurfactants rhamnolipids rhlAB rhlR rhlC |
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Genes associated to rhamnolipids production were molecularly characterized in 61 bacterial strains from LAMYBIM bacterial collection (Laboratorio de Microbiología y Biotecnología Microbiana, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú). Strains were isolated from peruvian environments hydrocarbons polluted and were classified as RL overproducers (n= 21), RL producers (n = 20) and non-producers (n = 20) producers. Molecular identification using the 16S rRNA gene was preceded by the biochemical identification of 61 strains selected with the API 20 NE system. Pseudomonas aeruginosa was the most prevalent strain of the RL overproducers and RL producers. Species such as Burkholderia cepacea, Pseudomonas fluorescens, Aeromonas hydrophila and Chryseobacterium indologenes, were found too. In the same way, non-producers microorganisms were also characterized. The PCR amplification and agarose gel electrophoresis techniques, standarized by the UNAM laboratory, showed that the selected strains had the genes: rhlA, rhlB, rhlR and rhlC. For the sequencing of the rhLABR gene region, four strains were selected: Pseudomonas aeruginosa T2K2, Pseudomonas aeruginosa III T1P2, Pseudomonas aeruginosa 6K-11 and Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027, applying the methodology standardized by the UNAM and were compared with Pseudomonas aeruginosa PAO1. Our results show that the genes studied in the selected strains are synonymous with their homologues in Pseudomonas aeruginosa PAO1 standard strain. Therefore, genotypical differences that explain the overproduction of rhamnolipid might be found in other molecular markers not covered in this study. |
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Revista Peruana de Biología; Vol. 24 No. 3 (2017); 293-302 Revista Peruana de Biología; Vol. 24 Núm. 3 (2017); 293-302 1727-9933 1561-0837 reponame:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos instname:Universidad Nacional Mayor de San Marcos instacron:UNMSM |
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Presence of rhlAB, rhlR and rhlR genes in Pseudomonas aeruginosa natives overproductors of ramnolipidsPresencia de genes rhlAB, rhlR y rhlC en Pseudomonas aeruginosa nativas sobreproductoras de ramnolípidosPalomino, Roger A.Romero, GuillermoGonzález-Valdez, AbigailSoberón-Chávez, GloriaGutiérrez, Susana M.Merino, Fernando A.Pseudomonas aeruginosabiosurfactantesramnolípidosrhlABrhlRrhlCPseudomonas aeruginosabiosurfactantsrhamnolipidsrhlABrhlRrhlCGenes associated to rhamnolipids production were molecularly characterized in 61 bacterial strains from LAMYBIM bacterial collection (Laboratorio de Microbiología y Biotecnología Microbiana, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú). Strains were isolated from peruvian environments hydrocarbons polluted and were classified as RL overproducers (n= 21), RL producers (n = 20) and non-producers (n = 20) producers. Molecular identification using the 16S rRNA gene was preceded by the biochemical identification of 61 strains selected with the API 20 NE system. Pseudomonas aeruginosa was the most prevalent strain of the RL overproducers and RL producers. Species such as Burkholderia cepacea, Pseudomonas fluorescens, Aeromonas hydrophila and Chryseobacterium indologenes, were found too. In the same way, non-producers microorganisms were also characterized. The PCR amplification and agarose gel electrophoresis techniques, standarized by the UNAM laboratory, showed that the selected strains had the genes: rhlA, rhlB, rhlR and rhlC. For the sequencing of the rhLABR gene region, four strains were selected: Pseudomonas aeruginosa T2K2, Pseudomonas aeruginosa III T1P2, Pseudomonas aeruginosa 6K-11 and Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027, applying the methodology standardized by the UNAM and were compared with Pseudomonas aeruginosa PAO1. Our results show that the genes studied in the selected strains are synonymous with their homologues in Pseudomonas aeruginosa PAO1 standard strain. Therefore, genotypical differences that explain the overproduction of rhamnolipid might be found in other molecular markers not covered in this study.Se realizó la caracterización molecular de los genes asociados a la producción de ramnolípidos (RL), en 61 cepas bacterianas de la colección del Laboratorio de Microbiología y Biotecnología Microbiana (LAMYBIM) de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú. Las cepas provenian de entornos peruanos contami-nados con hidrocarburos y fueron catalogadas como sobreproductoras de RL(n= 21), productoras de RL (n= 20) y no productoras de RL (n= 20). Las 61 cepas fueron identificadas bioquímicamente con el sistema API 20 NE. La identificación molecular se realizó empleando el gen del RNAr 16S. Se encontró que Pseudomonas aeruginosa fue el microorganismo de mayor prevalencia en los estratos sobreproductores y productores de ramnolípidos. Además, se encontraron: Burkholderia cepacea, Pseudomonas fluorescens, Aeromonas hydrophila y Chryseobacterium indologenes. Los microorganismos no productores de ramnolípidos, también fueron caracterizados bioquímicamente. Mediante amplificación de PCR y electroforesis en gel de agarosa, estandarizados por la UNAM, se evidenció que las cepas seleccionadas poseen los genes: rhlA, rhlB, rhlR y rhlC. Para el secuenciamiento de la región génica rhLABR, se seleccionaron cuatros especies: Pseudomonas aeruginosa T2X-2, Pseudomonas aeruginosa IIIT1P2, Pseudomonas aeruginosa 6K-11 y Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027, siguiendo metodología estandarizada por la UNAM y fueron comparados con Pseudomonas aeruginosa PAO1. Nuestros resultados muestran que los genes estudiados en las cepas seleccionadas son sinónimas de sus homólogos en la cepa patrón Pseudomonas aeruginosa PAO1, por lo que las diferencias genotípicas que expliquen la sobreproducción de ramnolípidos deberían hallarse en otros marcadores moleculares no cubiertos en el presente estudio.Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas2017-10-28info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/rpb/article/view/1390210.15381/rpb.v24i3.13902Revista Peruana de Biología; Vol. 24 No. 3 (2017); 293-302Revista Peruana de Biología; Vol. 24 Núm. 3 (2017); 293-3021727-99331561-0837reponame:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMspahttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/rpb/article/view/13902/12280Derechos de autor 2017 Roger A. Palomino, Guillermo Romero, Abigail González-Valdez, Gloria Soberón-Chávez, Susana M. Gutiérrez, Fernando A. Merinohttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessoai:revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe:article/139022018-06-23T13:32:30Z |
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