Characterization of the gene sequence of the peptide transport protein (PepT1) in paiche Arapaima gigas fingerlings

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The aim of this study was to characterize the PepT1 of pirarucu Arapaima gigas through genomic and proteomic tools. A transcriptomic and proteomic analysis was made from sections of the intestine, spleen, liver and kidney of fingerlings. The transcriptomic analysis allowed obtaining two consensus se...

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Detalles Bibliográficos
Autores: Toledo Valdiviezo, Odalis Epifanía, Castañeda, Arnaldo, Feria, Manuel A., Masías, Pedro, Cueva, Mario, Motte, Emmerik
Formato: artículo
Fecha de Publicación:2019
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe:article/15400
Enlace del recurso:https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/15400
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Arapaima gigas
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spelling Characterization of the gene sequence of the peptide transport protein (PepT1) in paiche Arapaima gigas fingerlingsCaracterización de la secuencia del gen de la proteína transportadora de péptidos (PepT1) en alevines de paiche Arapaima gigasToledo Valdiviezo, Odalis EpifaníaCastañeda, ArnaldoFeria, Manuel A.Masías, PedroCueva, MarioMotte, EmmerikArapaima gigaspeptide transporterPepT1proteomicmass spectrometryMALDI TOF/TOFArapaima gigasproteína transportadora de péptidoPepT1proteómicaespectrometría de masasMALDI TOF/TOFThe aim of this study was to characterize the PepT1 of pirarucu Arapaima gigas through genomic and proteomic tools. A transcriptomic and proteomic analysis was made from sections of the intestine, spleen, liver and kidney of fingerlings. The transcriptomic analysis allowed obtaining two consensus sequences of 357 and 459 bp. Both fragments showed a high degree of homology (78 and 80%), mainly with nucleotide sequences coding for the PepT1 of Scleropages formosus of the same Order as A. gigas. The proteomic analysis by double mass spectrometry MALDI TOF/TOF allowed to identify 15 peptide sequences of PepT1 in pirarucu. In conclusion, PepT1 was partially characterized in the intestine of pirarucu, which could be used for further studies on the evaluation of its expression.El objetivo del estudio fue caracterizar el PepT1 del paiche Arapaima gigas mediante herramientas genómicas y proteómicas. Se realizó un análisis transcriptómico y proteómico a partir de secciones del intestino, bazo, hígado y riñón de alevines. El análisis transcriptómico permitió obtener dos secuencias consenso de 357 y 459 pb. Ambos fragmentos presentaron un alto grado de homología (78 y 80%), principalmente con secuencias de nucleótidos codificantes del PepT1 de Scleropages formosus del mismo Orden que el paiche. El análisis proteómico por espectrometría de doble masa MALDI TOF/TOF permitió identificar quince secuencias peptídicas del PepT1 en paiche. Como conclusión se logró caracterizar parcialmente el PepT1 en el intestino del paiche, las cuales podrán ser usadas para posteriores estudios sobre la evaluación de su expresión.Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Medicina Veterinaria2019-10-10info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/1540010.15381/rivep.v30i3.15400Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 30 No. 3 (2019); 1129-1142Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 30 Núm. 3 (2019); 1129-11421682-34191609-9117reponame:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMspahttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/15400/14361Derechos de autor 2019 Odalis Epifanía Toledo Valdiviezohttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessoai:revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe:article/154002019-10-13T17:18:10Z
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Caracterización de la secuencia del gen de la proteína transportadora de péptidos (PepT1) en alevines de paiche Arapaima gigas
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description The aim of this study was to characterize the PepT1 of pirarucu Arapaima gigas through genomic and proteomic tools. A transcriptomic and proteomic analysis was made from sections of the intestine, spleen, liver and kidney of fingerlings. The transcriptomic analysis allowed obtaining two consensus sequences of 357 and 459 bp. Both fragments showed a high degree of homology (78 and 80%), mainly with nucleotide sequences coding for the PepT1 of Scleropages formosus of the same Order as A. gigas. The proteomic analysis by double mass spectrometry MALDI TOF/TOF allowed to identify 15 peptide sequences of PepT1 in pirarucu. In conclusion, PepT1 was partially characterized in the intestine of pirarucu, which could be used for further studies on the evaluation of its expression.
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