Evaluación del perfil transcriptómico inmunológico y variantes genéticas del SARS-COV-2 como predictores de severidad de la enfermedad COVID-19

• Autores: De La Cruz Vargas, Jhony A., Gallo Lopez, Aly Arnaul, Valencia Chambi, Diego Ernesto, Fazio, Alessandra, Loayza Castro, Joan
• Formato: informe técnico
• Fecha de Publicación: 2020
• Institución: Universidad Ricardo Palma
• Repositorio: URP-Tesis
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:repositorio.urp.edu.pe:20.500.14138/3033
• Enlace del recurso: https://hdl.handle.net/20.500.14138/3033
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: COVID-19; SARS-CoV-2

Resumen del Proyecto: Introduccion: La variabilidad genetica del SARS-CoV-2 ha sido reportada por varios autores. La respuesta del huesped frente al virus es clave para determinar su evolucion. El objetivo es identificar genes o vías de señalización de respuesta antiviral o pro inflamatoria en el huésped asociadas a variantes genéticas de SARSCoV-2 que permitan predecir la progresión de COVID-19 moderado a Severo. Métodos: Estudio observacional, exploratorio de identificacion pronóstica, en pacientes hospitalizados con COVID-19 comparando aquellos con evolucion favorable con los afectados severamente. Del hisopado nasal se extraera RNA viral, Según procedimiento se extraerá RNA y se convertirá a DNA. De muestras sanguíneas de los días 1, 5 y 10 de hospitalización se extraerá RNA/DNA. Las muestras serán centrifugadas para la obtención de plasma y preservadas a -80 0C. Se procederá a preparar manualmente las librerías genéticas a partir del cDNA de sangre y del virus. El análisis de la data primaria se realizará con el software Torrent Suite. Se determinará los genes diferencialmente expresados y el análisis de enriquecimiento de genes entre pacientes. Adicionalmente se realizará una RTPCR para evaluar polimorfismos de genes específicos: ACE2, VEGFA. Se correlacionará el perfil inmunológico del huésped con las variantes genéticas de SARS-CoV-2. Se utilizará un modelo estadístico predictivo para establecer un perfil inflamatorio/viral que determine la progresión a COVID-19 severo. Resultados Esperados: Validacion de resultados previos que demuestran la presencia de un incremento en la expresión de citoquinas proinflamatorias como IL6 y TNF. Se espera encontrar una respuesta antiviral disminuida en aquellos pacientes que presentan una evolución desfavorable. Ademas se evaluaran otros genes de la inmunidad innata y adaptativa que puedan estar asociados a la progresión a un cuadro de COVID-19 severo, así como evaluar genes de predisposición genética para enfermedad grave, que serán complementados con la evaluación de los polimorfismos ACE-2 y VEGFA. El estudio permitirá identificar la cepa prevalente en pacientes con COVID-19 moderado en Perú y variantes asociadas a una evolución desfavorable o a un perfil inmunológico especifico, además de evaluar predisposición genética basal. Finalmente, este estudio puede potencialmente permitirnos identificar pacientes con un perfil inmunológico que respondan mejor a una terapia específica.