Identificación molecular de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Ferrol, Chimbote, Perú, a través de la técnica de Código de Barras de ADN

Descripción del Articulo

En el presente trabajo de investigación se logró la identifícacion molecular de 11 especies de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Fenal. Chimbote-Perú, a travez de la técnica Codigo de Barras de ADN. Para ello se colectaron 110 especimenes y se aplicó la siguiente metodología:...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Gonzáles Máximo, José Jhoel
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2019
Institución:Universidad Nacional del Santa
Repositorio:UNS - Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.uns.edu.pe:20.500.14278/3481
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.14278/3481
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Invertebrados marinos
Distancias intra e interespecífica
Gen mitocondrial COI
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Gonzáles Máximo, José Jhoel
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description En el presente trabajo de investigación se logró la identifícacion molecular de 11 especies de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Fenal. Chimbote-Perú, a travez de la técnica Codigo de Barras de ADN. Para ello se colectaron 110 especimenes y se aplicó la siguiente metodología: extracción de ADN por el método de fenol cloroformo, evaluación de la calidad de ADN por electroforesis en gel de agarosa al 1%, cuantificación del ADN por espectrofotomenía, amplificación del gen mitocondrial CO/ por el método de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional y el secuenciamiento de los amplicones. Del total de especímenes colectados, solo se obtuvieron 53 secuencias consenso, las cuales están agrupadas en 11 especies. Posterior a ello mediante la herramienta blast se realizo la búsqueda de secuencias identicas en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBD y al Sistema de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLDSystems), identificando haplotipos similares para 10 especies, y para el caso específico de la especie F. maxima no se encontró reporte alguno. Además, quedo demostrado que las secuencias de los especimenes de T. choco/ata separadas inicialmente en grupo Fi y F2 por sus diferencias fenotípicas han formado ciado monofilético con una distancia promedio de 1.35%. Posteriormente se realizo un análisis estadístico a las secuencias consenso con el algoritmo genético Kimura 2 parámetros (KIP), obteniendo distancias intraespecífícas menores al 3 %, dicho valor fue criterio en este trabajo para delimitar especies. Las distancias intraespecíficas e interespecíficas de K2P fueron agrupadas por el algoritmo Neighbor - Joining (Ni) obtniendose clados definidos para 11 especies, las cuales estuvieron fuertemente soportados con los árboles filogenéticos de Inferencia Bayesiarta (IB) y Maximun Likelihood (ML), a la que a través de soportes estadísticos establecieron II Unidades Taxonómicas Operacionales molecular (MOTUs) para los 4 modelos (GMYC, bPTP, ABGD y BINs). Además, se obtuvo un umbral del barcode gap de 8.2 x para el grupo de invertebrados de interés comercial de la bahía El Ferrol. De manera general, el código de barras del ADN constituye una herramienta eficaz en la identificación de los invertebrados marinos para la bahía El Ferrol y una vía rápida para identificar posibles complejos de especies.
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Posterior a ello mediante la herramienta blast se realizo la búsqueda de secuencias identicas en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBD y al Sistema de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLDSystems), identificando haplotipos similares para 10 especies, y para el caso específico de la especie F. maxima no se encontró reporte alguno. Además, quedo demostrado que las secuencias de los especimenes de T. choco/ata separadas inicialmente en grupo Fi y F2 por sus diferencias fenotípicas han formado ciado monofilético con una distancia promedio de 1.35%. Posteriormente se realizo un análisis estadístico a las secuencias consenso con el algoritmo genético Kimura 2 parámetros (KIP), obteniendo distancias intraespecífícas menores al 3 %, dicho valor fue criterio en este trabajo para delimitar especies. Las distancias intraespecíficas e interespecíficas de K2P fueron agrupadas por el algoritmo Neighbor - Joining (Ni) obtniendose clados definidos para 11 especies, las cuales estuvieron fuertemente soportados con los árboles filogenéticos de Inferencia Bayesiarta (IB) y Maximun Likelihood (ML), a la que a través de soportes estadísticos establecieron II Unidades Taxonómicas Operacionales molecular (MOTUs) para los 4 modelos (GMYC, bPTP, ABGD y BINs). Además, se obtuvo un umbral del barcode gap de 8.2 x para el grupo de invertebrados de interés comercial de la bahía El Ferrol. 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