Identificación molecular de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Ferrol, Chimbote, Perú, a través de la técnica de Código de Barras de ADN
Descripción del Articulo
En el presente trabajo de investigación se logró la identifícacion molecular de 11 especies de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Fenal. Chimbote-Perú, a travez de la técnica Codigo de Barras de ADN. Para ello se colectaron 110 especimenes y se aplicó la siguiente metodología:...
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|---|---|
| Formato: | tesis de grado |
| Fecha de Publicación: | 2019 |
| Institución: | Universidad Nacional del Santa |
| Repositorio: | UNS - Institucional |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.uns.edu.pe:20.500.14278/3481 |
| Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.14278/3481 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Invertebrados marinos Distancias intra e interespecífica Gen mitocondrial COI |
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En el presente trabajo de investigación se logró la identifícacion molecular de 11 especies de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Fenal. Chimbote-Perú, a travez de la técnica Codigo de Barras de ADN. Para ello se colectaron 110 especimenes y se aplicó la siguiente metodología: extracción de ADN por el método de fenol cloroformo, evaluación de la calidad de ADN por electroforesis en gel de agarosa al 1%, cuantificación del ADN por espectrofotomenía, amplificación del gen mitocondrial CO/ por el método de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional y el secuenciamiento de los amplicones. Del total de especímenes colectados, solo se obtuvieron 53 secuencias consenso, las cuales están agrupadas en 11 especies. Posterior a ello mediante la herramienta blast se realizo la búsqueda de secuencias identicas en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBD y al Sistema de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLDSystems), identificando haplotipos similares para 10 especies, y para el caso específico de la especie F. maxima no se encontró reporte alguno. Además, quedo demostrado que las secuencias de los especimenes de T. choco/ata separadas inicialmente en grupo Fi y F2 por sus diferencias fenotípicas han formado ciado monofilético con una distancia promedio de 1.35%. Posteriormente se realizo un análisis estadístico a las secuencias consenso con el algoritmo genético Kimura 2 parámetros (KIP), obteniendo distancias intraespecífícas menores al 3 %, dicho valor fue criterio en este trabajo para delimitar especies. Las distancias intraespecíficas e interespecíficas de K2P fueron agrupadas por el algoritmo Neighbor - Joining (Ni) obtniendose clados definidos para 11 especies, las cuales estuvieron fuertemente soportados con los árboles filogenéticos de Inferencia Bayesiarta (IB) y Maximun Likelihood (ML), a la que a través de soportes estadísticos establecieron II Unidades Taxonómicas Operacionales molecular (MOTUs) para los 4 modelos (GMYC, bPTP, ABGD y BINs). Además, se obtuvo un umbral del barcode gap de 8.2 x para el grupo de invertebrados de interés comercial de la bahía El Ferrol. De manera general, el código de barras del ADN constituye una herramienta eficaz en la identificación de los invertebrados marinos para la bahía El Ferrol y una vía rápida para identificar posibles complejos de especies. |
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Posterior a ello mediante la herramienta blast se realizo la búsqueda de secuencias identicas en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBD y al Sistema de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLDSystems), identificando haplotipos similares para 10 especies, y para el caso específico de la especie F. maxima no se encontró reporte alguno. Además, quedo demostrado que las secuencias de los especimenes de T. choco/ata separadas inicialmente en grupo Fi y F2 por sus diferencias fenotípicas han formado ciado monofilético con una distancia promedio de 1.35%. Posteriormente se realizo un análisis estadístico a las secuencias consenso con el algoritmo genético Kimura 2 parámetros (KIP), obteniendo distancias intraespecífícas menores al 3 %, dicho valor fue criterio en este trabajo para delimitar especies. Las distancias intraespecíficas e interespecíficas de K2P fueron agrupadas por el algoritmo Neighbor - Joining (Ni) obtniendose clados definidos para 11 especies, las cuales estuvieron fuertemente soportados con los árboles filogenéticos de Inferencia Bayesiarta (IB) y Maximun Likelihood (ML), a la que a través de soportes estadísticos establecieron II Unidades Taxonómicas Operacionales molecular (MOTUs) para los 4 modelos (GMYC, bPTP, ABGD y BINs). Además, se obtuvo un umbral del barcode gap de 8.2 x para el grupo de invertebrados de interés comercial de la bahía El Ferrol. De manera general, el código de barras del ADN constituye una herramienta eficaz en la identificación de los invertebrados marinos para la bahía El Ferrol y una vía rápida para identificar posibles complejos de especies.Tesisapplication/pdfspaUniversidad Nacional del Santainfo:eu-repo/semantics/openAccessAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United Stateshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/Repositorio Institucional - UNSreponame:UNS - Institucionalinstname:Universidad Nacional del Santainstacron:UNS Invertebrados marinosDistancias intra e interespecíficaGen mitocondrial COIIdentificación molecular de invertebrados marinos de interés comercial de la bahía El Ferrol, Chimbote, Perú, a través de la técnica de Código de Barras de ADNinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisSUNEDUBiólogo AcuicultorUniversidad Nacional del Santa - Facultad de CienciasTitulo ProfesionalBiología en AcuiculturaTHUMBNAIL49944.pdf.jpg49944.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6093http://repositorio.uns.edu.pe/bitstream/20.500.14278/3481/5/49944.pdf.jpg04491fca2c566c338b729bbf98536924MD55ORIGINAL49944.pdf49944.pdfapplication/pdf86409348http://repositorio.uns.edu.pe/bitstream/20.500.14278/3481/1/49944.pdf9cf13484e5c18ff3d7b9bcfa7bdcfb47MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81232http://repositorio.uns.edu.pe/bitstream/20.500.14278/3481/2/license_rdfbb87e2fb4674c76d0d2e9ed07fbb9c86MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81327http://repositorio.uns.edu.pe/bitstream/20.500.14278/3481/3/license.txtc52066b9c50a8f86be96c82978636682MD53TEXT49944.pdf.txt49944.pdf.txtExtracted texttext/plain171181http://repositorio.uns.edu.pe/bitstream/20.500.14278/3481/4/49944.pdf.txt7db476fe2ad89c9633c5c45ef9cd7303MD5420.500.14278/3481oai:repositorio.uns.edu.pe:20.500.14278/34812023-05-22 23:13:03.922DSpace Universidad Nacional del Santarepositorio@uns.edu.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 |
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