Análisis de la variabilidad genética de los microsatelites TPOX y PENTA E en la población de humana de la región sur del Perú

Descripción del Articulo

El estudio de la variabilidad genética mediante el uso de marcadores microsatélites nos ayuda a caracterizar molecularmente a una población, los parámetros genéticos obtenidos son de gran utilidad para ser usados en cálculos estadísticos forenses, en genética de poblaciones, en la identificación de...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Manrique Sam, Maria Cecilia
Formato: tesis doctoral
Fecha de Publicación:2022
Institución:Universidad Nacional de San Agustín
Repositorio:UNSA-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.unsa.edu.pe:20.500.12773/14735
Enlace del recurso:http://hdl.handle.net/20.500.12773/14735
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Microsatélites
frecuencias alélicas
Equilibrio de Hardy Weinberg
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description El estudio de la variabilidad genética mediante el uso de marcadores microsatélites nos ayuda a caracterizar molecularmente a una población, los parámetros genéticos obtenidos son de gran utilidad para ser usados en cálculos estadísticos forenses, en genética de poblaciones, en la identificación de personas, etc. El presente trabajo tuvo como objetivo analizar la variabilidad genética de los microsatélites TPOX y PENTA E en la población humana de la región Sur del Perú. Se hallaron las frecuencias alélicas y genotípicas de ambos marcadores, y se determinó si estos marcadores se encontraban en equilibrio genético de Hardy-Weinberg. Se analizaron 100 muestras de personas que acudieron al laboratorio de Biología Molecular de la Universidad Nacional de San Agustín, se realizó la extracción de ADN, se amplificó por la técnica de la PCR, los productos de la amplificación se visualizaron en geles de agarosa a una concentración del 2%, el análisis informático se hizo en los programas GENEPOP y Cervus. Se encontró para el marcador TPOX 4 alelos de las 10 variantes alélicas reportadas para este marcador, los alelos identificados fueron 8, 9, 11 y 12, siendo la variante alélica más frecuente el alelo 8 (60.00%), para el marcador PENTA E se identificó en nuestra población de estudio 10 alelos de los 21 alelos reportados, los alelos hallados fueron 10, 11, 12, 13, 14, 15,16, 17, 19 y 20; los alelos más frecuentes para este marcador fueron 13(16.5%), 14(17%) y 15(17.5%). En ambos marcadores se obtuvo una P<0.05, en base a este resultado se demostró que nuestra población se encuentra en equilibrio de Hardy Weinberg para los STRs TPOX y PENTA E, los valores de PIC fueron mayores a 0.5 y el marcador STR PENTA E fue el más polimórfico con un valor de PIC de 0.856.
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Se analizaron 100 muestras de personas que acudieron al laboratorio de Biología Molecular de la Universidad Nacional de San Agustín, se realizó la extracción de ADN, se amplificó por la técnica de la PCR, los productos de la amplificación se visualizaron en geles de agarosa a una concentración del 2%, el análisis informático se hizo en los programas GENEPOP y Cervus. Se encontró para el marcador TPOX 4 alelos de las 10 variantes alélicas reportadas para este marcador, los alelos identificados fueron 8, 9, 11 y 12, siendo la variante alélica más frecuente el alelo 8 (60.00%), para el marcador PENTA E se identificó en nuestra población de estudio 10 alelos de los 21 alelos reportados, los alelos hallados fueron 10, 11, 12, 13, 14, 15,16, 17, 19 y 20; los alelos más frecuentes para este marcador fueron 13(16.5%), 14(17%) y 15(17.5%). En ambos marcadores se obtuvo una P<0.05, en base a este resultado se demostró que nuestra población se encuentra en equilibrio de Hardy Weinberg para los STRs TPOX y PENTA E, los valores de PIC fueron mayores a 0.5 y el marcador STR PENTA E fue el más polimórfico con un valor de PIC de 0.856.application/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12773/14735spaUniversidad Nacional de San Agustín de ArequipaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Universidad Nacional de San Agustín de ArequipaRepositorio Institucional - UNSAreponame:UNSA-Institucionalinstname:Universidad Nacional de San Agustíninstacron:UNSAMicrosatélitesfrecuencias alélicasEquilibrio de Hardy Weinberghttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.05.01Análisis de la variabilidad genética de los microsatelites TPOX y PENTA E en la población de humana de la región sur del Perúinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisSUNEDU476696https://orcid.org/0000-0003-0313-103329420612511048Vargas de Nieto, Maria ElenaParedes de Gomez, Trinidad BettyBernabe Ortiz, Julio Cesarhttp://purl.org/pe-repo/renati/level#doctorhttp://purl.org/pe-repo/renati/type#tesisDoctorado en Biología Molecular y BiotecnologíaUniversidad Nacional de San Agustín de Arequipa.Unidad de Posgrado.Facultad de Ciencias Naturales y FormalesDoctora en Biología Molecular y BiotecnologíaTHUMBNAILPDF.jpgimage/jpeg42566https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/e08fbd6a-0546-44f9-bf4d-9bfaa60b4de2/downloadeaa4ac57f1dcfae112ab6dd5b8fb68c9MD57ORIGINALUPmasamc.pdfapplication/pdf1769417https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/b55ec46f-afa7-43cf-84fe-bbe50263dcf4/download766c5aa6b513ed4cd1b4b0784288d4e7MD54Reporte de Similitud.pdfapplication/pdf570206https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/fd71c56d-e4e4-417d-91c8-da74e1fca93d/download9075a93c64e6f6f696aaf43d7dc1cca8MD55Autorización de Publicación Digital.pdfapplication/pdf998029https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/66cad18f-3fa2-47b1-80d0-a35c9dd9e14f/download17f67c65c7602e62bfc03c79ba42ab7fMD56LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81327https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/91f82c5b-3685-40d4-b0e1-b80fd0e5ede3/downloadc52066b9c50a8f86be96c82978636682MD52TEXTUPmasamc.pdf.txtUPmasamc.pdf.txtExtracted texttext/plain63263https://repositorio.unsa.edu.pe/bitstreams/c364961b-f8cf-4fee-a44b-f2b181fe959f/download60961cbcfec07efef5b7197969fcb6a5MD5320.500.12773/14735oai:repositorio.unsa.edu.pe:20.500.12773/147352023-11-16 12:02:10.159http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://repositorio.unsa.edu.peRepositorio Institucional UNSArepositorio@unsa.edu.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