Análisis in silico de la proteína transialidasa SA85-1.1 de Trypanosoma cruzi mediante herramientas inmunoinformáticas

• Autor: Mantilla Chauca, Jorge Patrick
• Formato: tesis de grado
• Fecha de Publicación: 2023
• Institución: Universidad Nacional Mayor de San Marcos
• Repositorio: UNMSM-Tesis
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/19707
• Enlace del recurso: https://hdl.handle.net/20.500.12672/19707
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: Enfermedad de Chagas; Trypanosoma cruzi; Simulación por Computador; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.16

La enfermedad de Chagas es una parasitosis causada por el protozoario Trypanosoma cruzi que afecta a 7 millones de personas en todo el mundo y es considerada endémica en 21 países de Latinoamérica. Actualmente, existen medidas de prevención como el control del vector y tamizaje en bancos de sangre; sin embargo, el desarrollo de estrategias de precisión como las vacunas, podrían contribuir a controlar la infección y su patología. Además, la quimioterapia vigente para la enfermedad es limitada, demostrando una baja efectividad en la etapa crónica con efectos secundarios, motivando la búsqueda de nuevas alternativas terapéuticas. La proteína transialidasa se expresa diferencialmente en la etapa infectiva del parásito, y está involucrada en la evasión del sistema inmune, invasión celular y patogénesis. Al estar expresada en todas las cepas de T. cruzi, esta proteína constituye un objetivo molecular para drogas y diseño de vacunas. El estudio tuvo como objetivo realizar el análisis in silico estructural e inmunoinformático de la proteína SA85-1.1, miembro representativo del grupo II de las transialidasas, y proponer epítopos candidatos a vacuna para la región Sudamérica. Se realizó la predicción de su estructura 3D y la predicción inmunoinformática, mediante redes neuronales artificiales (ANNs) a partir de la secuencia consenso de homólogas, mediante un flujo de trabajo que permite el ensayo en modelos de ratón BALB/c y C57BL/6 y que aplique filtros como controles de calidad de los epítopos. Producto de ello, se obtuvieron 14, 8 y 6 epítopos candidatos de células B, TCD8+ y T-CD4+, respectivamente. Además, se identificaron 5 epítopos con una cobertura poblacional mayor del 65% para la población peruana. Se obtuvieron los modelos 3D de los epítopos, un modelo 3D validado de la proteína SA85-1.1 y la identificación del plegamiento involucrado en la adhesión celular. Se concluye que las ANNs son capaces de predecir epítopos inmunogénicos de la proteína transialidasa SA85 de T. cruzi, los cuales podrían ser usados como candidatos para el diagnóstico y diseño de vacunas.