Modelamiento estructural y dinámico de la red de regulación transcripcional de la miogénesis embrionaria en Mus musculus

Descripción del Articulo

Las primeras células del linaje muscular se forman por un proceso llamado miogénesis durante el desarrollo embrionario. En mamíferos, la miogénesis embrionaria se llevaa cabo después de la formación de los somitas, y los primeros mioblastos se derivan de estas estructuras. A nivel molecular existe u...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Supo Escalante, Rydberg Román
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2022
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/18510
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12672/18510
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Desarrollo de músculos
Regulación genética
Ecuaciones diferenciales
Modelos matemáticos
Ratones
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description Las primeras células del linaje muscular se forman por un proceso llamado miogénesis durante el desarrollo embrionario. En mamíferos, la miogénesis embrionaria se llevaa cabo después de la formación de los somitas, y los primeros mioblastos se derivan de estas estructuras. A nivel molecular existe un grupo de factores de transcripción conocidos como MRFs, que incluyen a MyoD, Myf5, Mrf4 y MyoG, los cuales se expresan en distintas etapas de la miogénesis y además controlan la expresión de genes especí ficos del linaje muscular. Externamente, la expresión de estos factores de transcripción es controlada por gradientes de morfógenos que activan rutas de señalización que inducen o reprimen la expresión de los MRFs. A pesar que durante las últimas décadas se ha generado información acerca de interacciones regulatorias específicas entre los MRFs y las rutas de señalización que los controlan, no existe un modelo global que conecte todas las relaciones biológicas y permita hacer predicciones básicas acerca del comportamiento de la red de MRFs. Por esta razón, la presente tesis plantea un modelo matemático determinístico basado en ecuaciones diferenciales ordinarias que conectan las vías de señalización Hedgehog, Wnt, Notch y TGF-β con la red de MRFs. El modelo principal consiste de 4 ecuaciones diferenciales y 17 parámetros. La estimación de los valores de los parámetros se realizó con el método de mínimos cuadrados. Además, se exploraron diferentes modelos, con cada ruta analizada de manera individual y colectiva. Los resultados muestran mapas de activación de la red para diferentes concentraciones de morfógenos, lo que puede servir como guía para futuros estudios experimentales o de inducción. El presente modelo abre una puerta y hace un primer esfuerzo para unificar los avances en la biología de regulación de la miogénesis embrionaria en mamíferos.
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A nivel molecular existe un grupo de factores de transcripción conocidos como MRFs, que incluyen a MyoD, Myf5, Mrf4 y MyoG, los cuales se expresan en distintas etapas de la miogénesis y además controlan la expresión de genes especí ficos del linaje muscular. Externamente, la expresión de estos factores de transcripción es controlada por gradientes de morfógenos que activan rutas de señalización que inducen o reprimen la expresión de los MRFs. A pesar que durante las últimas décadas se ha generado información acerca de interacciones regulatorias específicas entre los MRFs y las rutas de señalización que los controlan, no existe un modelo global que conecte todas las relaciones biológicas y permita hacer predicciones básicas acerca del comportamiento de la red de MRFs. Por esta razón, la presente tesis plantea un modelo matemático determinístico basado en ecuaciones diferenciales ordinarias que conectan las vías de señalización Hedgehog, Wnt, Notch y TGF-β con la red de MRFs. El modelo principal consiste de 4 ecuaciones diferenciales y 17 parámetros. La estimación de los valores de los parámetros se realizó con el método de mínimos cuadrados. Además, se exploraron diferentes modelos, con cada ruta analizada de manera individual y colectiva. Los resultados muestran mapas de activación de la red para diferentes concentraciones de morfógenos, lo que puede servir como guía para futuros estudios experimentales o de inducción. El presente modelo abre una puerta y hace un primer esfuerzo para unificar los avances en la biología de regulación de la miogénesis embrionaria en mamíferos.Perú. Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Vicerrectorado de Investigación y Posgrado. Programa de Proyectos de Investigación para Grupos de Investigación. Resolución rectoral N° 03556-R-19, proyecto con código B19101141. Perú. Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (CONCYTEC). Programa Nacional de Investigación Científica y Estudios Avanzados (Pro Ciencia). 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Escuela Profesional de Genética y BiotecnologíaGenética y Biotecnología41020762https://orcid.org/0000-0002-8392-988070307812919036Vivas Ruiz, Dan ErickCabrera Cordova, Leyda GeraldineGarcia Quispes, Wilserhttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesionalhttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis419511310915669440480447LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/8d9f6959-d1e7-4169-a3db-904c4924974e/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52ORIGINALSupo_er.pdfSupo_er.pdfapplication/pdf14430331https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/815f6654-9f1f-41a9-a2dd-13950ebeef82/download022aa8169fb7c6aa4255716a5b022767MD53TEXTSupo_er.pdf.txtSupo_er.pdf.txtExtracted texttext/plain102420https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/7fe5a7b5-8c55-41e1-bef7-6354de7ebdf3/downloadd7bb4841a097b6b6d07ce624385519ffMD56THUMBNAILSupo_er.pdf.jpgSupo_er.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg14917https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/1d75e64c-61e8-43a1-9aea-1ac20cd1126b/download4f4cad9a1c81618d76de1ca61a2c4d3eMD5720.500.12672/18510oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/185102024-08-15 23:21:34.782https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://cybertesis.unmsm.edu.peCybertesis UNMSMcybertesis@unmsm.edu.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