Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)

Descripción del Articulo

La concha de abanico (Argopecten purpuratus) es un molusco bivalvo de importancia económica para el Perú, debido a su alto valor nutritivo y su amplia aceptación en los mercados de Estados Unidos, Japón y Europa. En el Perú, no se han realizado estudios a nivel genético poblacional en esta especie,...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Sanchez Silva, Luis Gustavo
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2013
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/2668
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12672/2668
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Conchas
Marcadores genéticos
Microsatélites (Genética)
Moluscos - Genética
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
id UNMS_bbc60886c642b88db5e10523eec95f1f
oai_identifier_str oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/2668
network_acronym_str UNMS
network_name_str UNMSM-Tesis
repository_id_str 410
dc.title.none.fl_str_mv Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
title Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
spellingShingle Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
Sanchez Silva, Luis Gustavo
Conchas
Marcadores genéticos
Microsatélites (Genética)
Moluscos - Genética
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
title_short Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
title_full Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
title_fullStr Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
title_full_unstemmed Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
title_sort Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)
author Sanchez Silva, Luis Gustavo
author_facet Sanchez Silva, Luis Gustavo
author_role author
dc.contributor.advisor.fl_str_mv Quiroz Bazán, Roger Walter
dc.contributor.author.fl_str_mv Sanchez Silva, Luis Gustavo
dc.subject.none.fl_str_mv Conchas
Marcadores genéticos
Microsatélites (Genética)
Moluscos - Genética
topic Conchas
Marcadores genéticos
Microsatélites (Genética)
Moluscos - Genética
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
dc.subject.ocde.none.fl_str_mv https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
description La concha de abanico (Argopecten purpuratus) es un molusco bivalvo de importancia económica para el Perú, debido a su alto valor nutritivo y su amplia aceptación en los mercados de Estados Unidos, Japón y Europa. En el Perú, no se han realizado estudios a nivel genético poblacional en esta especie, existiendo solamente estudios morfométricos, cuyas variaciones estarían ligadas a cambios en la variabilidad genética del recurso (Cisneros et al., 2008). Además, existen pocos marcadores microsatélites reportados, los cuales son los marcadores moleculares más adecuados para evaluar la diversidad genética de una especie. El objetivo del presente estudio fue detectar microsatélites trinucleótidos “CAT” del genoma de A. purpuratus para lo cual se utilizó el método de librerías genómicas enriquecidas. Se optimizó un protocolo para extracción de DNA Genómico de alta calidad a partir de la gónada masculina y utilizando como buffer de lisis TNES-urea. Asimismo, se construyó una librería genómica enriquecida utilizando esferas magnéticas lo que permitió obtener un elevado porcentaje de clones positivos (65 80%). Finalmente, se obtuvo DNA plasmídico de alta calidad cuyo secuenciamiento servirá para diseñar cebadores que permitan evaluar el polimorfismo de los microsatélites. Palabras clave: concha de abanico, Argopecten purpuratus, librerías genómicas enriquecidas, microsatélites, polimorfismo.
publishDate 2013
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2013-08-20T21:16:08Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2013-08-20T21:16:08Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2013
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12672/2668
url https://hdl.handle.net/20.500.12672/2668
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.fl_str_mv SUNEDU
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.none.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.publisher.country.none.fl_str_mv PE
publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.source.none.fl_str_mv Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio de Tesis - UNMSM
reponame:UNMSM-Tesis
instname:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
instacron:UNMSM
instname_str Universidad Nacional Mayor de San Marcos
instacron_str UNMSM
institution UNMSM
reponame_str UNMSM-Tesis
collection UNMSM-Tesis
bitstream.url.fl_str_mv https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/28071791-3e88-4938-adcd-3ae60ed03194/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f4091a30-a1a9-4286-a44d-5f0a68248cd8/download
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/fe3963e1-4536-44d9-83dc-63588ac9a918/download
bitstream.checksum.fl_str_mv e12da324b53c740777f7d40ce4f865e7
6b006aa1e8cfb1309c16bf9c2f255b58
444488e62dda1b2c8b1770fb93a44d0c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Cybertesis UNMSM
repository.mail.fl_str_mv cybertesis@unmsm.edu.pe
_version_ 1841551530826661888
spelling Quiroz Bazán, Roger WalterSanchez Silva, Luis Gustavo2013-08-20T21:16:08Z2013-08-20T21:16:08Z2013https://hdl.handle.net/20.500.12672/2668La concha de abanico (Argopecten purpuratus) es un molusco bivalvo de importancia económica para el Perú, debido a su alto valor nutritivo y su amplia aceptación en los mercados de Estados Unidos, Japón y Europa. En el Perú, no se han realizado estudios a nivel genético poblacional en esta especie, existiendo solamente estudios morfométricos, cuyas variaciones estarían ligadas a cambios en la variabilidad genética del recurso (Cisneros et al., 2008). Además, existen pocos marcadores microsatélites reportados, los cuales son los marcadores moleculares más adecuados para evaluar la diversidad genética de una especie. El objetivo del presente estudio fue detectar microsatélites trinucleótidos “CAT” del genoma de A. purpuratus para lo cual se utilizó el método de librerías genómicas enriquecidas. Se optimizó un protocolo para extracción de DNA Genómico de alta calidad a partir de la gónada masculina y utilizando como buffer de lisis TNES-urea. Asimismo, se construyó una librería genómica enriquecida utilizando esferas magnéticas lo que permitió obtener un elevado porcentaje de clones positivos (65 80%). Finalmente, se obtuvo DNA plasmídico de alta calidad cuyo secuenciamiento servirá para diseñar cebadores que permitan evaluar el polimorfismo de los microsatélites. Palabras clave: concha de abanico, Argopecten purpuratus, librerías genómicas enriquecidas, microsatélites, polimorfismo.--- The Peruvian scallop (Argopecten purpuratus) is an economically important bivalve in Peru due to its high nutritional qualities and its wide acceptance in the markets of United States, Japan and Europe. In Peru, there have not been studies of this resource at the population genetic level and there are only morphometric studies, one of those reports that variations at this level could be linked to the genetic variability of the resource (Cisneros et al., 2008). In addition, there are only few microsatellite markers reported, this molecular markers are the best to assess the genetic diversity. Due to this reason, the aim of this study was to detected trinucleotide microsatellites with the motif “CAT“ from the genome of A. purpuratus using enriched genomic libraries. High quality DNA extraction from the male gonad with TNES-urea lysis buffer was optimized. Furthermore, the enriched genomic libraries constructed using magnetic beads allowed identification of a high percentage of positive clones (65-80%). Finally, the sequencing of the high quality plasmid DNA obtained will enable primers design for the evaluation of the microsatellites polymorphism. Keywords: Peruvian scallop, Argopecten purpuratus, enriched genomic libraries, microsatellite, polymorphism.TesisspaUniversidad Nacional Mayor de San MarcosPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Universidad Nacional Mayor de San MarcosRepositorio de Tesis - UNMSMreponame:UNMSM-Tesisinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMConchasMarcadores genéticosMicrosatélites (Genética)Moluscos - Genéticahttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07Detección de microsatélites trinucleótidos en Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819)info:eu-repo/semantics/bachelorThesisSUNEDUBiólogo Genetista BiotecnólogoUniversidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Escuela Académico Profesional de Genética y BiotecnologíaGenética y Biotecnología10348490https://orcid.org/0000-0002-2839-6671https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesionalhttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesisORIGINALSanchez_sl.pdfapplication/pdf2601286https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/28071791-3e88-4938-adcd-3ae60ed03194/downloade12da324b53c740777f7d40ce4f865e7MD51TEXTSanchez_sl.pdf.txtSanchez_sl.pdf.txtExtracted texttext/plain100217https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/f4091a30-a1a9-4286-a44d-5f0a68248cd8/download6b006aa1e8cfb1309c16bf9c2f255b58MD52THUMBNAILSanchez_sl.pdf.jpgSanchez_sl.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg10950https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/fe3963e1-4536-44d9-83dc-63588ac9a918/download444488e62dda1b2c8b1770fb93a44d0cMD5320.500.12672/2668oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/26682021-09-25 12:54:40.673https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://cybertesis.unmsm.edu.peCybertesis UNMSMcybertesis@unmsm.edu.pe
score 13.4481325
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).