Búsqueda de genes relacionados a la síntesis de la fibra y marcadores SSR en los ESTs de piel de alpaca Vicugna pacos

Descripción del Articulo

La comercialización de la fibra de alpaca es una de las principales fuentes de sustento para más de un millón de personas en el Perú, siendo de mucha importancia para su economía por ser el principal productor de fibra. Teniendo en cuenta que dos de los factores importantes en la calidad de la fibra...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Fernández Ugaz, Daniel Antonio
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2015
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:UNMSM-Tesis
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/4473
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12672/4473
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Transcriptoma
Huacaya
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description La comercialización de la fibra de alpaca es una de las principales fuentes de sustento para más de un millón de personas en el Perú, siendo de mucha importancia para su economía por ser el principal productor de fibra. Teniendo en cuenta que dos de los factores importantes en la calidad de la fibra son su diámetro y su longitud, se analizaron los ESTs de la alpaca depositados en la base de datos del NCBI para identificar los genes relacionados a la síntesis de fibra y microsatélites que tendrían una función importante relacionada a su calidad. Se analizaron 7286 ESTs de piel de una alpaca del tipo huacaya, resultando en 2428 secuencias ensambladas o unigenes, posteriormente se realizó la búsqueda de homologías y la anotación de secuencias. Se identificaron 22 genes relacionados a la síntesis de la fibra (KRT10, KRT25, KRT31, KRT14, KRT15, KRT5, KRT78, KRT81, KRT85, KRTAP3-2, KRTAP10, KRTAP11-1, TNFSF12, sFRP4, RACK1, COL1A1, COL1A2, DAB2IP, GLI1, BMP1, BMP4 y CTNNB1) donde se observó 4 de estos con una alta expresión (TNFSF12, sFRP4, COL1A1 y COL1A2) y 10 genes poseen microsatélites (COL1A1, TNFSF12, DAB2IP, GLI1, BMP4, KRT81, KRT5, KRT15, KRT85 y KRTAP3-2). El presente estudio aporta la identificación de genes relacionados a la síntesis de fibra y marcadores EST-SSR con los cuales se pueden probar en la alpaca para establecer de forma experimental si estos genes tienen una relación con el diámetro.
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Se identificaron 22 genes relacionados a la síntesis de la fibra (KRT10, KRT25, KRT31, KRT14, KRT15, KRT5, KRT78, KRT81, KRT85, KRTAP3-2, KRTAP10, KRTAP11-1, TNFSF12, sFRP4, RACK1, COL1A1, COL1A2, DAB2IP, GLI1, BMP1, BMP4 y CTNNB1) donde se observó 4 de estos con una alta expresión (TNFSF12, sFRP4, COL1A1 y COL1A2) y 10 genes poseen microsatélites (COL1A1, TNFSF12, DAB2IP, GLI1, BMP4, KRT81, KRT5, KRT15, KRT85 y KRTAP3-2). 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